260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2812 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2812  purine nucleoside phosphorylase  100 
 
 		 236 aa  484  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0651432  unclonable  0.00000308017 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3045  purine nucleoside phosphorylase  96.61 
 
 		 236 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.465909  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3375  purine nucleoside phosphorylase  94.07 
 
 		 236 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.284651 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3546  purine nucleoside phosphorylase  93.64 
 
 		 236 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.799796  hitchhiker  0.000820133 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1040  purine nucleoside phosphorylase  90.68 
 
 		 236 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.540297  hitchhiker  0.00000698922 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1105  purine nucleoside phosphorylase  90.68 
 
 		 236 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182057 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1044  purine nucleoside phosphorylase  90.68 
 
 		 236 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179251 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0976  purine nucleoside phosphorylase  91.53 
 
 		 236 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00392055 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1221  purine nucleoside phosphorylase  90.25 
 
 		 236 aa  442  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2819  purine nucleoside phosphorylase  89.83 
 
 		 236 aa  442  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3227  purine nucleoside phosphorylase  88.56 
 
 		 236 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3363  purine nucleoside phosphorylase  88.56 
 
 		 236 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586668 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3224  purine nucleoside phosphorylase  88.56 
 
 		 236 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1143  purine nucleoside phosphorylase  88.56 
 
 		 236 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000418679 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1005  purine nucleoside phosphorylase  89.41 
 
 		 236 aa  434  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.622952  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1028  purine nucleoside phosphorylase  88.98 
 
 		 236 aa  430  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.263223  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2864  purine nucleoside phosphorylase  73.08 
 
 		 236 aa  370  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.304471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002632  purine nucleoside phosphorylase  72.65 
 
 		 239 aa  365  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0288  purine nucleoside phosphorylase  73.28 
 
 		 238 aa  366  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.324122  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3449  purine nucleoside phosphorylase  73.08 
 
 		 241 aa  362  3e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3624  purine nucleoside phosphorylase  72.22 
 
 		 239 aa  360  8e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3495  purine nucleoside phosphorylase  72.22 
 
 		 239 aa  360  8e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3330  purine nucleoside phosphorylase  72.65 
 
 		 241 aa  360  1e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0817178  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0824  purine nucleoside phosphorylase  71.79 
 
 		 239 aa  359  2e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.02467  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0602  purine nucleoside phosphorylase  71.37 
 
 		 239 aa  357  7e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03374  purine nucleoside phosphorylase  72.22 
 
 		 269 aa  357  9.999999999999999e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0828  purine nucleoside phosphorylase  71.79 
 
 		 239 aa  357  9.999999999999999e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4978  purine nucleoside phosphorylase  71.37 
 
 		 239 aa  350  8e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1926  purine nucleoside phosphorylase  70.51 
 
 		 241 aa  349  2e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4985  purine nucleoside phosphorylase  70.94 
 
 		 239 aa  348  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4824  purine nucleoside phosphorylase  70.94 
 
 		 239 aa  348  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4892  purine nucleoside phosphorylase  70.94 
 
 		 239 aa  348  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4926  purine nucleoside phosphorylase  70.94 
 
 		 239 aa  348  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.416667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0544  purine nucleoside phosphorylase  70.64 
 
 		 240 aa  345  4e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.353867  normal  0.0917006 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04260  purine nucleoside phosphorylase  70.09 
 
 		 239 aa  344  6e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3614  purine nucleoside phosphorylase  70.09 
 
 		 239 aa  344  6e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4983  purine nucleoside phosphorylase  70.09 
 
 		 239 aa  344  6e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3672  purine nucleoside phosphorylase  70.09 
 
 		 239 aa  344  6e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.398843 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4933  purine nucleoside phosphorylase  70.09 
 
 		 239 aa  344  6e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.857632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5899  purine nucleoside phosphorylase  70.09 
 
 		 239 aa  344  6e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4619  purine nucleoside phosphorylase  70.09 
 
 		 239 aa  344  6e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4931  purine nucleoside phosphorylase  70.09 
 
 		 239 aa  344  6e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.863605  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04226  hypothetical protein  70.09 
 
 		 239 aa  344  6e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0083  purine nucleoside phosphorylase  66.1 
 
 		 245 aa  339  2e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0506882  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001249  purine nucleoside phosphorylase  66.53 
 
 		 236 aa  333  1e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.328135  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1978  purine nucleoside phosphorylase  65.81 
 
 		 234 aa  332  2e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.331725  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0663  purine nucleoside phosphorylase  67.65 
 
 		 243 aa  332  4e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05118  purine nucleoside phosphorylase  66.53 
 
 		 236 aa  330  9e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0828  purine-nucleoside phosphorylase  67.95 
 
 		 243 aa  330  9e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0457  purine nucleoside phosphorylase  64.41 
 
 		 236 aa  325  5e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3612  purine nucleoside phosphorylase  62.71 
 
 		 236 aa  321  6e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3884  purine nucleoside phosphorylase  63.91 
 
 		 236 aa  315  4e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000380041 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0635  purine nucleoside phosphorylase  63.48 
 
 		 236 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1344  purine nucleoside phosphorylase  62.17 
 
 		 235 aa  289  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1187  purine nucleoside phosphorylase  62.17 
 
 		 235 aa  290  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.562168  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1518  purine nucleoside phosphorylase  62.17 
 
 		 235 aa  289  3e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3827  purine nucleoside phosphorylase  62.17 
 
 		 235 aa  288  4e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000284162 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1588  purine nucleoside phosphorylase  62.17 
 
 		 235 aa  288  4e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0326912  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1372  purine nucleoside phosphorylase  62.17 
 
 		 235 aa  288  4e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.896759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1345  purine nucleoside phosphorylase  62.17 
 
 		 235 aa  288  4e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1386  purine nucleoside phosphorylase  62.17 
 
 		 235 aa  288  4e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1483  purine nucleoside phosphorylase  62.17 
 
 		 235 aa  288  4e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1555  purine nucleoside phosphorylase  62.17 
 
 		 235 aa  288  4e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000650002 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1624  purine nucleoside phosphorylase  62.17 
 
 		 235 aa  288  4e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1863  purine nucleoside phosphorylase  60.43 
 
 		 235 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2420  purine nucleoside phosphorylase  60.43 
 
 		 236 aa  284  9e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2947  purine nucleoside phosphorylase  56.33 
 
 		 232 aa  278  4e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1391  purine nucleoside phosphorylase  56.47 
 
 		 235 aa  278  5e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000867516  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1652  purine nucleoside phosphorylase  56.03 
 
 		 235 aa  277  1e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000543003  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0510  purine nucleoside phosphorylase  53.81 
 
 		 236 aa  271  9e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0092  purine nucleoside phosphorylase  53.81 
 
 		 236 aa  270  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0203  purine nucleoside phosphorylase  53.68 
 
 		 235 aa  268  5.9999999999999995e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1497  purine nucleoside phosphorylase  53.88 
 
 		 261 aa  267  1e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.153254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3422  purine nucleoside phosphorylase  55.41 
 
 		 234 aa  267  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3271  purine nucleoside phosphorylase  54.11 
 
 		 234 aa  266  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.147124 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3784  purine nucleoside phosphorylase  54.11 
 
 		 234 aa  260  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0231  purine nucleoside phosphorylase  53.04 
 
 		 235 aa  259  3e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.691256  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2719  purine nucleoside phosphorylase  53.45 
 
 		 234 aa  256  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1838  purine nucleoside phosphorylase  52.59 
 
 		 234 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.336588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1657  purine nucleoside phosphorylase  53.02 
 
 		 234 aa  256  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0417756  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1925  purine nucleoside phosphorylase  52.16 
 
 		 235 aa  256  3e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2503  purine nucleoside phosphorylase  53.02 
 
 		 234 aa  255  5e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.263795  hitchhiker  0.000530536 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3381  purine nucleoside phosphorylase  52.77 
 
 		 235 aa  254  7e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.336963  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1318  purine nucleoside phosphorylase  51.09 
 
 		 233 aa  254  8e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000021408  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1793  purine nucleoside phosphorylase  53.98 
 
 		 232 aa  252  4.0000000000000004e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000806796  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0799  purine nucleoside phosphorylase  52.79 
 
 		 234 aa  251  5.000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.467388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6136  purine nucleoside phosphorylase  53.22 
 
 		 235 aa  250  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2832  purine nucleoside phosphorylase  53.48 
 
 		 235 aa  250  1e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111726  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1003  purine nucleoside phosphorylase  53.85 
 
 		 234 aa  249  3e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00510571  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0295  purine nucleoside phosphorylase  53.42 
 
 		 232 aa  247  1e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1747  purine nucleoside phosphorylase  54.51 
 
 		 236 aa  246  2e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3108  purine nucleoside phosphorylase  51.08 
 
 		 234 aa  245  4e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0114  purine nucleoside phosphorylase  52.79 
 
 		 236 aa  242  3.9999999999999997e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000527057  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1513  purine-nucleoside phosphorylase  50.43 
 
 		 243 aa  241  5e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0821603  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2212  purine nucleoside phosphorylase  52.16 
 
 		 236 aa  239  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2174  purine nucleoside phosphorylase  52.16 
 
 		 236 aa  239  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0463  purine nucleoside phosphorylase  51.74 
 
 		 233 aa  239  2.9999999999999997e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0259121  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0752  purine nucleoside phosphorylase  52.59 
 
 		 238 aa  238  6.999999999999999e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0127  purine nucleoside phosphorylase  51.95 
 
 		 235 aa  234  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.391631  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0122  purine nucleoside phosphorylase  51.95 
 
 		 235 aa  234  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000853984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>