58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2486 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2486  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.821286  normal  0.0164308 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1563  hypothetical protein  67.97 
 
 		 230 aa  325  3e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.481041  hitchhiker  0.0000891871 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3089  hypothetical protein  65.8 
 
 		 224 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.841691  hitchhiker  0.0000201211 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2473  hypothetical protein  63.36 
 
 		 230 aa  288  4e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00172237 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2659  hypothetical protein  58.05 
 
 		 236 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1816  hypothetical protein  63.79 
 
 		 226 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2633  hypothetical protein  62.61 
 
 		 230 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00306883 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2541  hypothetical protein  62.61 
 
 		 230 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.688217  hitchhiker  0.00185195 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1615  hypothetical protein  62.34 
 
 		 229 aa  277  8e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2728  hypothetical protein  62.34 
 
 		 229 aa  277  8e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000631509 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1626  hypothetical protein  62.34 
 
 		 229 aa  277  8e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1649  hypothetical protein  62.34 
 
 		 229 aa  276  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.429893 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1510  hypothetical protein  59.55 
 
 		 234 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2633  hypothetical protein  54.44 
 
 		 240 aa  260  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1246  hypothetical protein  57.74 
 
 		 234 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106966 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2432  hypothetical protein  45.34 
 
 		 234 aa  204  7e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3206  hypothetical protein  27.39 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00873811  normal  0.0205878 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2623  hypothetical protein  27.39 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.515334  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2534  hypothetical protein  27.39 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000238326  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1761  hypothetical protein  24.89 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0748188  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2679  conserved hypothetical protein  26.34 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.430544  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2632  hypothetical protein  26.34 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.521459  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2155  hypothetical protein  26.34 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.257613  normal  0.348745 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2351  hypothetical protein  26.34 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.300281  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1079  hypothetical protein  26.34 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928447  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1073  hypothetical protein  26.34 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00226171  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1128  hypothetical protein  26.34 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.52869  normal  0.229343 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00975  hypothetical protein  26.34 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00968  hypothetical protein  26.34 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.554756  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1476  hypothetical protein  23.11 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2815  hypothetical protein  22.83 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.270347  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1232  hypothetical protein  23.67 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06645  hypothetical protein  27.46 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1152  hypothetical protein  23.89 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1216  hypothetical protein  27.78 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.273624  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1118  hypothetical protein  23.89 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000226557 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1140  hypothetical protein  23.89 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.704245 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1186  hypothetical protein  23.45 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  0.698742 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1966  hypothetical protein  31.16 
 
 		 144 aa  53.1  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1035  hypothetical protein  23.45 
 
 		 220 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.251889  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1349  hypothetical protein  23.29 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4148  hypothetical protein  30.97 
 
 		 133 aa  47  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.144769 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0193  hypothetical protein  24 
 
 		 140 aa  47.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1523  hypothetical protein  25 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1584  hypothetical protein  25.21 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.753254  normal  0.316977 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3571  hypothetical protein  25.11 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1437  hypothetical protein  21.21 
 
 		 208 aa  46.2  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000552081  normal  0.908079 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1590  hypothetical protein  25.31 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.124163 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2811  hypothetical protein  25 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.255962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1801  hypothetical protein  28.89 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.182005  normal  0.0371017 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1784  hypothetical protein  25.54 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.215532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0107  hypothetical protein  23.61 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0214  hypothetical protein  24.8 
 
 		 141 aa  43.5  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0786  hypothetical protein  25.32 
 
 		 233 aa  42.7  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0591  hypothetical protein  26.13 
 
 		 170 aa  42.7  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135105  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001140  putative secreted protein  25.1 
 
 		 239 aa  42.7  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0272  hypothetical protein  26.06 
 
 		 144 aa  42.4  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3538  hypothetical protein  26.81 
 
 		 145 aa  42  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>