34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1966 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1966  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  293  6e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0272  hypothetical protein  74.31 
 
 		 144 aa  233  7e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0214  hypothetical protein  34.56 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0193  hypothetical protein  34.56 
 
 		 140 aa  89.4  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3985  hypothetical protein  34.81 
 
 		 139 aa  88.2  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0591  hypothetical protein  28.7 
 
 		 170 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135105  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3979  hypothetical protein  31.69 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3779  hypothetical protein  29.08 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.822352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3852  hypothetical protein  27.46 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4593  hypothetical protein  31.15 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3538  hypothetical protein  29.46 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4169  hypothetical protein  31.97 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4099  hypothetical protein  31.97 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4300  hypothetical protein  31.15 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0166  hypothetical protein  31.15 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0157  hypothetical protein  29.75 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0326453  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2486  hypothetical protein  31.16 
 
 		 229 aa  53.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.821286  normal  0.0164308 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2541  hypothetical protein  28.15 
 
 		 230 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.688217  hitchhiker  0.00185195 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2473  hypothetical protein  28.15 
 
 		 230 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00172237 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2633  hypothetical protein  25.37 
 
 		 230 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00306883 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1649  hypothetical protein  26.12 
 
 		 229 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.429893 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2728  hypothetical protein  26.12 
 
 		 229 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000631509 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1626  hypothetical protein  26.12 
 
 		 229 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1615  hypothetical protein  26.12 
 
 		 229 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1563  hypothetical protein  26.47 
 
 		 230 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.481041  hitchhiker  0.0000891871 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3089  hypothetical protein  26.23 
 
 		 224 aa  46.2  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.841691  hitchhiker  0.0000201211 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1816  hypothetical protein  26.12 
 
 		 226 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4148  hypothetical protein  28.57 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.144769 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2432  hypothetical protein  32.52 
 
 		 234 aa  44.3  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1246  hypothetical protein  26.61 
 
 		 234 aa  43.5  0.0009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106966 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1510  hypothetical protein  25 
 
 		 234 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2659  hypothetical protein  26.83 
 
 		 236 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2815  hypothetical protein  26.47 
 
 		 221 aa  40.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.270347  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2633  hypothetical protein  27.41 
 
 		 240 aa  40  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>