25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3985 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3985  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  284  4e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0193  hypothetical protein  55.71 
 
 
140 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0214  hypothetical protein  50 
 
 
141 aa  147  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0591  hypothetical protein  42.98 
 
 
170 aa  99.8  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135105  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3538  hypothetical protein  38.24 
 
 
145 aa  99  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3779  hypothetical protein  38.21 
 
 
151 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.822352  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3852  hypothetical protein  37.4 
 
 
151 aa  94.4  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0166  hypothetical protein  36.36 
 
 
151 aa  94  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4169  hypothetical protein  35.61 
 
 
151 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0157  hypothetical protein  35.61 
 
 
151 aa  91.7  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0326453  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4300  hypothetical protein  34.85 
 
 
151 aa  92  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3979  hypothetical protein  36.03 
 
 
152 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4099  hypothetical protein  35.11 
 
 
151 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4593  hypothetical protein  37.5 
 
 
151 aa  89.4  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1966  hypothetical protein  34.81 
 
 
144 aa  88.2  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0272  hypothetical protein  31.85 
 
 
144 aa  87  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4148  hypothetical protein  35.71 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.144769 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1784  hypothetical protein  33.02 
 
 
231 aa  50.8  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.215532  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1626  hypothetical protein  29.41 
 
 
229 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1615  hypothetical protein  29.41 
 
 
229 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1563  hypothetical protein  30.53 
 
 
230 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.481041  hitchhiker  0.0000891871 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1649  hypothetical protein  29.41 
 
 
229 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.429893 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2728  hypothetical protein  29.41 
 
 
229 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000631509 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2486  hypothetical protein  30.53 
 
 
229 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.821286  normal  0.0164308 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0786  hypothetical protein  26.67 
 
 
233 aa  41.2  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>