27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0272 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0272  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  295  1e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1966  hypothetical protein  74.31 
 
 		 144 aa  233  7e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3985  hypothetical protein  31.85 
 
 		 139 aa  87  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0591  hypothetical protein  33.04 
 
 		 170 aa  84.7  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135105  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0214  hypothetical protein  32.35 
 
 		 141 aa  83.6  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0193  hypothetical protein  32.35 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3852  hypothetical protein  27.46 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3979  hypothetical protein  29.58 
 
 		 152 aa  67  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3779  hypothetical protein  26.57 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.822352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3538  hypothetical protein  30.3 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0166  hypothetical protein  32.79 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4099  hypothetical protein  32.79 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4169  hypothetical protein  32.79 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0157  hypothetical protein  32.23 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0326453  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4593  hypothetical protein  25.41 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4300  hypothetical protein  31.97 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1246  hypothetical protein  26.89 
 
 		 234 aa  47.8  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106966 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3089  hypothetical protein  26.98 
 
 		 224 aa  47.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.841691  hitchhiker  0.0000201211 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2541  hypothetical protein  25.95 
 
 		 230 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.688217  hitchhiker  0.00185195 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2815  hypothetical protein  27.83 
 
 		 221 aa  44.3  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.270347  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2473  hypothetical protein  25.95 
 
 		 230 aa  43.5  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00172237 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2633  hypothetical protein  25.19 
 
 		 230 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00306883 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1563  hypothetical protein  24.46 
 
 		 230 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.481041  hitchhiker  0.0000891871 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2486  hypothetical protein  26.06 
 
 		 229 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.821286  normal  0.0164308 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2659  hypothetical protein  26.83 
 
 		 236 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1232  hypothetical protein  28.7 
 
 		 243 aa  40.8  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1816  hypothetical protein  25.19 
 
 		 226 aa  40.4  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>