44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1232 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1232  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  507  1e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01270  hypothetical protein  27.95 
 
 
198 aa  65.1  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1784  hypothetical protein  27.43 
 
 
231 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.215532  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2811  hypothetical protein  28.93 
 
 
226 aa  64.3  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.255962  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06645  hypothetical protein  26.39 
 
 
239 aa  63.5  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004185  hypothetical protein  28.47 
 
 
197 aa  61.2  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.737127  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2659  hypothetical protein  24.89 
 
 
236 aa  59.7  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001140  putative secreted protein  25.81 
 
 
239 aa  59.3  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3089  hypothetical protein  26.11 
 
 
224 aa  59.3  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.841691  hitchhiker  0.0000201211 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1761  hypothetical protein  23.33 
 
 
223 aa  57.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0748188  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3571  hypothetical protein  28.57 
 
 
212 aa  54.7  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1349  hypothetical protein  28.3 
 
 
217 aa  54.7  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1523  hypothetical protein  28.73 
 
 
234 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1246  hypothetical protein  22.27 
 
 
234 aa  53.9  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106966 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2633  hypothetical protein  23.73 
 
 
240 aa  52.4  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1563  hypothetical protein  21.79 
 
 
230 aa  52.4  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.481041  hitchhiker  0.0000891871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1590  hypothetical protein  25.73 
 
 
234 aa  52  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.124163 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2541  hypothetical protein  22.77 
 
 
230 aa  52  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.688217  hitchhiker  0.00185195 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1510  hypothetical protein  25.11 
 
 
234 aa  50.1  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2633  hypothetical protein  22.36 
 
 
230 aa  49.3  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00306883 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2486  hypothetical protein  23.26 
 
 
229 aa  48.9  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.821286  normal  0.0164308 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2473  hypothetical protein  22.92 
 
 
230 aa  48.9  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00172237 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1816  hypothetical protein  25 
 
 
226 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2432  hypothetical protein  24.64 
 
 
234 aa  48.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2728  hypothetical protein  21.99 
 
 
229 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000631509 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1649  hypothetical protein  21.99 
 
 
229 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.429893 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1584  hypothetical protein  25.24 
 
 
238 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.753254  normal  0.316977 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1626  hypothetical protein  21.99 
 
 
229 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1476  hypothetical protein  23.2 
 
 
220 aa  48.1  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1615  hypothetical protein  21.99 
 
 
229 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1444  hypothetical protein  23.77 
 
 
224 aa  47.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000075829  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2129  hypothetical protein  23.85 
 
 
208 aa  47  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.116207  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2745  hypothetical protein  24.73 
 
 
252 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.284126 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0107  hypothetical protein  24.54 
 
 
211 aa  46.2  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1610  hypothetical protein  25 
 
 
251 aa  45.8  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000546178  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3206  hypothetical protein  21.95 
 
 
226 aa  45.4  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00873811  normal  0.0205878 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2534  hypothetical protein  21.95 
 
 
226 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000238326  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2623  hypothetical protein  21.95 
 
 
226 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.515334  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1720  hypothetical protein  25.71 
 
 
224 aa  43.9  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.851625  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2666  hypothetical protein  25.56 
 
 
252 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.141618  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1152  hypothetical protein  21.76 
 
 
220 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3483  hypothetical protein  26.87 
 
 
194 aa  42.7  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532841  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1186  hypothetical protein  21.4 
 
 
220 aa  42.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  0.698742 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1718  hypothetical protein  25.47 
 
 
252 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0414729  hitchhiker  0.0000333205 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>