48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3571 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3571  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  432  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1584  hypothetical protein  68.07 
 
 		 238 aa  328  4e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.753254  normal  0.316977 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1590  hypothetical protein  68.38 
 
 		 234 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.124163 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1523  hypothetical protein  67.95 
 
 		 234 aa  325  3e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2745  hypothetical protein  46.03 
 
 		 252 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.284126 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1718  hypothetical protein  46.83 
 
 		 252 aa  217  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0414729  hitchhiker  0.0000333205 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2666  hypothetical protein  46.03 
 
 		 252 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.141618  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1610  hypothetical protein  44.98 
 
 		 251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000546178  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2631  hypothetical protein  46.03 
 
 		 252 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0786  hypothetical protein  40.17 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1720  hypothetical protein  41.21 
 
 		 224 aa  142  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.851625  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1784  hypothetical protein  34.53 
 
 		 231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.215532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2811  hypothetical protein  33.64 
 
 		 226 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.255962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0107  hypothetical protein  32.88 
 
 		 211 aa  116  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2129  hypothetical protein  33.33 
 
 		 208 aa  115  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.116207  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06645  hypothetical protein  31.86 
 
 		 239 aa  112  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2355  hypothetical protein  31.3 
 
 		 256 aa  112  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001140  putative secreted protein  30.62 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1444  hypothetical protein  29.95 
 
 		 224 aa  89.7  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000075829  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1761  hypothetical protein  25.93 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0748188  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3483  hypothetical protein  27.69 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532841  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003961  putative secreted protein  28.04 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1152  hypothetical protein  30.89 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1186  hypothetical protein  30.89 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  0.698742 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1140  hypothetical protein  30.89 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.704245 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1118  hypothetical protein  30.89 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000226557 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1035  hypothetical protein  30.89 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.251889  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2679  conserved hypothetical protein  29.32 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.430544  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00975  hypothetical protein  29.32 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1128  hypothetical protein  29.32 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.52869  normal  0.229343 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2351  hypothetical protein  29.32 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.300281  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1079  hypothetical protein  29.32 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928447  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00968  hypothetical protein  29.32 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.554756  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2155  hypothetical protein  29.32 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.257613  normal  0.348745 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2632  hypothetical protein  29.32 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.521459  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1073  hypothetical protein  29.32 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00226171  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1476  hypothetical protein  27.75 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3206  hypothetical protein  27.23 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00873811  normal  0.0205878 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2534  hypothetical protein  27.23 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000238326  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2623  hypothetical protein  27.23 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.515334  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004185  hypothetical protein  28.8 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.737127  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1232  hypothetical protein  28.57 
 
 		 243 aa  54.7  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1216  hypothetical protein  24.06 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.273624  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01270  hypothetical protein  27.61 
 
 		 198 aa  52  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1349  hypothetical protein  24.77 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2542  hypothetical protein  26.76 
 
 		 174 aa  45.4  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0704132  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2851  hypothetical protein  26.35 
 
 		 174 aa  43.5  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0787973  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2432  hypothetical protein  24.35 
 
 		 234 aa  41.2  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>