41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0786 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0786  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  480  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1590  hypothetical protein  43.81 
 
 		 234 aa  162  6e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.124163 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1584  hypothetical protein  43.1 
 
 		 238 aa  160  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.753254  normal  0.316977 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1523  hypothetical protein  42.92 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1718  hypothetical protein  39.52 
 
 		 252 aa  158  6e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0414729  hitchhiker  0.0000333205 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2631  hypothetical protein  40.57 
 
 		 252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2745  hypothetical protein  37.98 
 
 		 252 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.284126 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1610  hypothetical protein  37.86 
 
 		 251 aa  151  7e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000546178  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2666  hypothetical protein  38.93 
 
 		 252 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.141618  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3571  hypothetical protein  40.17 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1784  hypothetical protein  35.9 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.215532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2355  hypothetical protein  32.8 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1720  hypothetical protein  38.46 
 
 		 224 aa  125  7e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.851625  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2811  hypothetical protein  31.49 
 
 		 226 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.255962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06645  hypothetical protein  30.38 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0107  hypothetical protein  30.67 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2129  hypothetical protein  30.4 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.116207  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001140  putative secreted protein  29.24 
 
 		 239 aa  92.8  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3483  hypothetical protein  29.77 
 
 		 194 aa  90.5  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532841  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1444  hypothetical protein  26.32 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000075829  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003961  putative secreted protein  27.71 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3206  hypothetical protein  25.91 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00873811  normal  0.0205878 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2534  hypothetical protein  25.91 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000238326  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2623  hypothetical protein  25.91 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.515334  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004185  hypothetical protein  28.8 
 
 		 197 aa  58.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.737127  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01270  hypothetical protein  28.18 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1563  hypothetical protein  23.21 
 
 		 230 aa  52  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.481041  hitchhiker  0.0000891871 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0214  hypothetical protein  29.53 
 
 		 141 aa  48.9  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3089  hypothetical protein  26.92 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.841691  hitchhiker  0.0000201211 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2432  hypothetical protein  25.66 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1349  hypothetical protein  24.28 
 
 		 217 aa  47.8  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2659  hypothetical protein  24.58 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1186  hypothetical protein  21.43 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  0.698742 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1152  hypothetical protein  21.52 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1118  hypothetical protein  21.52 
 
 		 220 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000226557 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1476  hypothetical protein  21.15 
 
 		 220 aa  43.5  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0193  hypothetical protein  26.47 
 
 		 140 aa  42.7  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1035  hypothetical protein  21.52 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.251889  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1761  hypothetical protein  21.08 
 
 		 223 aa  42.4  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0748188  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0591  hypothetical protein  31.37 
 
 		 170 aa  42.4  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135105  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1140  hypothetical protein  21.08 
 
 		 220 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.704245 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>