62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1152 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A1152  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1118  hypothetical protein  99.55 
 
 		 220 aa  446  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000226557 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1140  hypothetical protein  99.09 
 
 		 220 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.704245 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1035  hypothetical protein  98.64 
 
 		 220 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.251889  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1186  hypothetical protein  98.64 
 
 		 220 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  0.698742 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2679  conserved hypothetical protein  85.45 
 
 		 220 aa  392  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.430544  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00975  hypothetical protein  85.45 
 
 		 220 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1128  hypothetical protein  85.45 
 
 		 220 aa  392  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.52869  normal  0.229343 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2351  hypothetical protein  85.45 
 
 		 220 aa  392  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.300281  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2155  hypothetical protein  85.45 
 
 		 220 aa  392  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.257613  normal  0.348745 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2632  hypothetical protein  85 
 
 		 220 aa  390  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.521459  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1079  hypothetical protein  85.45 
 
 		 220 aa  392  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928447  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1073  hypothetical protein  85 
 
 		 220 aa  390  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00226171  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00968  hypothetical protein  85.45 
 
 		 220 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.554756  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1476  hypothetical protein  75.45 
 
 		 220 aa  348  3e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1761  hypothetical protein  39.09 
 
 		 223 aa  162  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0748188  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3206  hypothetical protein  35.84 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00873811  normal  0.0205878 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2623  hypothetical protein  35.4 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.515334  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2534  hypothetical protein  35.4 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000238326  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1216  hypothetical protein  34.69 
 
 		 215 aa  124  8.000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.273624  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2542  hypothetical protein  35.39 
 
 		 174 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0704132  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2851  hypothetical protein  35.06 
 
 		 174 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0787973  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1349  hypothetical protein  31.43 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0107  hypothetical protein  24.65 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3571  hypothetical protein  30.89 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3089  hypothetical protein  24.2 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.841691  hitchhiker  0.0000201211 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1784  hypothetical protein  25.66 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.215532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2811  hypothetical protein  29.03 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.255962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2659  hypothetical protein  25.1 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2129  hypothetical protein  24.29 
 
 		 208 aa  62  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.116207  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01270  hypothetical protein  26.19 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3483  hypothetical protein  27.55 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532841  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1615  hypothetical protein  23.43 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1720  hypothetical protein  25.76 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.851625  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2728  hypothetical protein  23.43 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000631509 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1626  hypothetical protein  23.43 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004185  hypothetical protein  26.19 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.737127  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1649  hypothetical protein  23.43 
 
 		 229 aa  58.2  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.429893 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001140  putative secreted protein  24.66 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1563  hypothetical protein  22.32 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.481041  hitchhiker  0.0000891871 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2473  hypothetical protein  23.14 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00172237 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2355  hypothetical protein  26.62 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1523  hypothetical protein  27.19 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2541  hypothetical protein  23.58 
 
 		 230 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.688217  hitchhiker  0.00185195 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1584  hypothetical protein  25.97 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.753254  normal  0.316977 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2633  hypothetical protein  23.14 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00306883 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1816  hypothetical protein  22.67 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1610  hypothetical protein  30.3 
 
 		 251 aa  52.8  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000546178  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1590  hypothetical protein  25.88 
 
 		 234 aa  52  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.124163 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2815  hypothetical protein  24.06 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.270347  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003961  putative secreted protein  24.15 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2486  hypothetical protein  22.12 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.821286  normal  0.0164308 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1444  hypothetical protein  23.12 
 
 		 224 aa  49.7  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000075829  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2633  hypothetical protein  21.19 
 
 		 240 aa  48.5  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2432  hypothetical protein  22.37 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1510  hypothetical protein  21.17 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0786  hypothetical protein  21.52 
 
 		 233 aa  44.3  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2631  hypothetical protein  26.99 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2745  hypothetical protein  23.35 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.284126 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2666  hypothetical protein  26.55 
 
 		 252 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.141618  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1232  hypothetical protein  21.76 
 
 		 243 aa  42.7  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1718  hypothetical protein  26.38 
 
 		 252 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0414729  hitchhiker  0.0000333205 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>