46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2815 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2815  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  443  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.270347  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1563  hypothetical protein  23.98 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.481041  hitchhiker  0.0000891871 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3089  hypothetical protein  25.35 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.841691  hitchhiker  0.0000201211 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1816  hypothetical protein  24.32 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2473  hypothetical protein  24.24 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00172237 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2633  hypothetical protein  23.5 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00306883 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2541  hypothetical protein  23.08 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.688217  hitchhiker  0.00185195 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1246  hypothetical protein  21.5 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106966 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1510  hypothetical protein  22.39 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1761  hypothetical protein  22.37 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0748188  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4148  hypothetical protein  28.23 
 
 		 133 aa  52.8  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.144769 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2486  hypothetical protein  29.73 
 
 		 229 aa  52.8  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.821286  normal  0.0164308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1626  hypothetical protein  24.18 
 
 		 229 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2728  hypothetical protein  24.18 
 
 		 229 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000631509 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1615  hypothetical protein  24.18 
 
 		 229 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1649  hypothetical protein  23.56 
 
 		 229 aa  52  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.429893 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0591  hypothetical protein  30 
 
 		 170 aa  50.8  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135105  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1140  hypothetical protein  24.06 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.704245 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1152  hypothetical protein  24.06 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1118  hypothetical protein  24.06 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000226557 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1035  hypothetical protein  24.65 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.251889  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2659  hypothetical protein  23.38 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1186  hypothetical protein  24.38 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  0.698742 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3779  hypothetical protein  29.75 
 
 		 151 aa  48.9  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.822352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1216  hypothetical protein  21.89 
 
 		 215 aa  48.5  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.273624  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1720  hypothetical protein  30.61 
 
 		 224 aa  48.1  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.851625  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06645  hypothetical protein  25 
 
 		 239 aa  47  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001140  putative secreted protein  23.91 
 
 		 239 aa  46.2  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1476  hypothetical protein  21.7 
 
 		 220 aa  45.8  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1073  hypothetical protein  22.12 
 
 		 220 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00226171  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2632  hypothetical protein  22.12 
 
 		 220 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.521459  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00968  hypothetical protein  22.12 
 
 		 220 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.554756  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1079  hypothetical protein  22.12 
 
 		 220 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928447  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2679  conserved hypothetical protein  22.12 
 
 		 220 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.430544  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00975  hypothetical protein  22.12 
 
 		 220 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2432  hypothetical protein  21.25 
 
 		 234 aa  45.1  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1128  hypothetical protein  22.12 
 
 		 220 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.52869  normal  0.229343 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2633  hypothetical protein  20.33 
 
 		 240 aa  45.1  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2351  hypothetical protein  22.12 
 
 		 220 aa  45.1  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.300281  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2155  hypothetical protein  22.12 
 
 		 220 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.257613  normal  0.348745 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2129  hypothetical protein  26.7 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.116207  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0272  hypothetical protein  27.83 
 
 		 144 aa  44.3  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0107  hypothetical protein  20.29 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3852  hypothetical protein  27.91 
 
 		 151 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1444  hypothetical protein  26 
 
 		 224 aa  42.7  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000075829  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3979  hypothetical protein  26.45 
 
 		 152 aa  42.4  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>