19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3852 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3852  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  308  1e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3779  hypothetical protein  89.4 
 
 		 151 aa  276  1e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.822352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3979  hypothetical protein  85.53 
 
 		 152 aa  264  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4593  hypothetical protein  72.19 
 
 		 151 aa  209  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0157  hypothetical protein  58.62 
 
 		 151 aa  178  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0326453  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4169  hypothetical protein  58.62 
 
 		 151 aa  177  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0166  hypothetical protein  57.93 
 
 		 151 aa  176  7e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4099  hypothetical protein  57.93 
 
 		 151 aa  175  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4300  hypothetical protein  57.24 
 
 		 151 aa  174  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0591  hypothetical protein  35.86 
 
 		 170 aa  102  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135105  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3985  hypothetical protein  37.4 
 
 		 139 aa  94.4  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0193  hypothetical protein  36.59 
 
 		 140 aa  94  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3538  hypothetical protein  39.72 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0214  hypothetical protein  40.29 
 
 		 141 aa  91.3  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1966  hypothetical protein  27.46 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0272  hypothetical protein  27.46 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4148  hypothetical protein  29.37 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.144769 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2815  hypothetical protein  27.91 
 
 		 221 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.270347  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1784  hypothetical protein  30.63 
 
 		 231 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.215532  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>