27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3538 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3538  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  293  4e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0193  hypothetical protein  41.61 
 
 		 140 aa  107  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3985  hypothetical protein  38.24 
 
 		 139 aa  99  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0214  hypothetical protein  42.75 
 
 		 141 aa  97.8  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4300  hypothetical protein  40.54 
 
 		 151 aa  94.7  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0591  hypothetical protein  40.5 
 
 		 170 aa  94  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135105  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0157  hypothetical protein  39.86 
 
 		 151 aa  93.6  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0326453  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0166  hypothetical protein  39.86 
 
 		 151 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4099  hypothetical protein  39.86 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4169  hypothetical protein  39.86 
 
 		 151 aa  92.8  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3852  hypothetical protein  39.72 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3779  hypothetical protein  37.59 
 
 		 151 aa  87.4  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.822352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3979  hypothetical protein  40.17 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4593  hypothetical protein  40.43 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1966  hypothetical protein  29.46 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0272  hypothetical protein  30.3 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2633  hypothetical protein  31.4 
 
 		 240 aa  47.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2432  hypothetical protein  29.1 
 
 		 234 aa  47.4  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4148  hypothetical protein  30.36 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.144769 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1563  hypothetical protein  27.1 
 
 		 230 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.481041  hitchhiker  0.0000891871 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2486  hypothetical protein  26.81 
 
 		 229 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.821286  normal  0.0164308 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2659  hypothetical protein  26.45 
 
 		 236 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2541  hypothetical protein  30.4 
 
 		 230 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.688217  hitchhiker  0.00185195 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1615  hypothetical protein  28.57 
 
 		 229 aa  40.4  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1649  hypothetical protein  28.57 
 
 		 229 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.429893 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1626  hypothetical protein  28.57 
 
 		 229 aa  40.4  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2728  hypothetical protein  28.57 
 
 		 229 aa  40.4  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000631509 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>