20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_A0157 on replicon NC_004349
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004349  SO_A0157  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  306  8e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0326453  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0166  hypothetical protein  94.7 
 
 		 151 aa  291  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4099  hypothetical protein  94.7 
 
 		 151 aa  291  3e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4169  hypothetical protein  94.7 
 
 		 151 aa  291  3e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4300  hypothetical protein  93.38 
 
 		 151 aa  288  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3779  hypothetical protein  55.33 
 
 		 151 aa  181  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.822352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3852  hypothetical protein  58.62 
 
 		 151 aa  178  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3979  hypothetical protein  56.29 
 
 		 152 aa  179  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4593  hypothetical protein  49.33 
 
 		 151 aa  149  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0214  hypothetical protein  44.09 
 
 		 141 aa  100  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0193  hypothetical protein  39.71 
 
 		 140 aa  98.6  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0591  hypothetical protein  34.51 
 
 		 170 aa  97.1  7e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135105  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3538  hypothetical protein  39.86 
 
 		 145 aa  93.6  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3985  hypothetical protein  35.61 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1966  hypothetical protein  29.75 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0272  hypothetical protein  32.23 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4148  hypothetical protein  28.69 
 
 		 133 aa  47.8  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.144769 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1437  hypothetical protein  28.97 
 
 		 208 aa  43.5  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000552081  normal  0.908079 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1853  hypothetical protein  26.36 
 
 		 233 aa  43.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00782113  normal  0.262689 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1784  hypothetical protein  25.2 
 
 		 231 aa  40.8  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.215532  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>