19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3779 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3779  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  310  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.822352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3852  hypothetical protein  89.4 
 
 		 151 aa  276  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3979  hypothetical protein  86.18 
 
 		 152 aa  268  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4593  hypothetical protein  72.85 
 
 		 151 aa  215  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0157  hypothetical protein  55.33 
 
 		 151 aa  181  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0326453  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4169  hypothetical protein  55.33 
 
 		 151 aa  180  6e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0166  hypothetical protein  54.67 
 
 		 151 aa  179  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4099  hypothetical protein  54.67 
 
 		 151 aa  178  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4300  hypothetical protein  54.67 
 
 		 151 aa  177  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0591  hypothetical protein  36.55 
 
 		 170 aa  102  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135105  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3985  hypothetical protein  38.21 
 
 		 139 aa  96.3  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0214  hypothetical protein  41.01 
 
 		 141 aa  95.1  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0193  hypothetical protein  37.68 
 
 		 140 aa  94.7  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3538  hypothetical protein  37.59 
 
 		 145 aa  87.4  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1966  hypothetical protein  29.08 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0272  hypothetical protein  26.57 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4148  hypothetical protein  27.78 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.144769 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2815  hypothetical protein  29.75 
 
 		 221 aa  48.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.270347  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1784  hypothetical protein  30.25 
 
 		 231 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.215532  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>