20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_4169 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_4169  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  305  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4300  hypothetical protein  98.68 
 
 
151 aa  302  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4099  hypothetical protein  98.68 
 
 
151 aa  301  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0166  hypothetical protein  97.35 
 
 
151 aa  298  1e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0157  hypothetical protein  94.7 
 
 
151 aa  291  3e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0326453  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3779  hypothetical protein  55.33 
 
 
151 aa  180  6e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.822352  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3979  hypothetical protein  56.95 
 
 
152 aa  179  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3852  hypothetical protein  58.62 
 
 
151 aa  177  4e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4593  hypothetical protein  48.67 
 
 
151 aa  147  6e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0214  hypothetical protein  44.88 
 
 
141 aa  102  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0193  hypothetical protein  42.52 
 
 
140 aa  101  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0591  hypothetical protein  34.97 
 
 
170 aa  94.7  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135105  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3985  hypothetical protein  35.61 
 
 
139 aa  93.6  9e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3538  hypothetical protein  39.86 
 
 
145 aa  92.8  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1966  hypothetical protein  31.97 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0272  hypothetical protein  32.79 
 
 
144 aa  60.5  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4148  hypothetical protein  30.33 
 
 
133 aa  50.8  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.144769 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1437  hypothetical protein  28.57 
 
 
208 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000552081  normal  0.908079 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1563  hypothetical protein  28.1 
 
 
230 aa  43.9  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.481041  hitchhiker  0.0000891871 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1853  hypothetical protein  25.58 
 
 
233 aa  41.2  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00782113  normal  0.262689 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>