18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3979 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3979  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  310  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3779  hypothetical protein  86.18 
 
 
151 aa  268  2e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.822352  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3852  hypothetical protein  85.53 
 
 
151 aa  264  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4593  hypothetical protein  72.37 
 
 
151 aa  210  4.9999999999999996e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4169  hypothetical protein  56.95 
 
 
151 aa  179  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0157  hypothetical protein  56.29 
 
 
151 aa  179  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0326453  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0166  hypothetical protein  55.63 
 
 
151 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4300  hypothetical protein  55.63 
 
 
151 aa  176  9e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4099  hypothetical protein  55.63 
 
 
151 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0591  hypothetical protein  36.3 
 
 
170 aa  98.2  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135105  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3985  hypothetical protein  36.03 
 
 
139 aa  91.7  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0214  hypothetical protein  41.04 
 
 
141 aa  90.9  6e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0193  hypothetical protein  34.68 
 
 
140 aa  86.7  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3538  hypothetical protein  40.17 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1966  hypothetical protein  31.69 
 
 
144 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0272  hypothetical protein  29.58 
 
 
144 aa  67  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4148  hypothetical protein  30.23 
 
 
133 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.144769 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2815  hypothetical protein  26.45 
 
 
221 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.270347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>