37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0214 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0214  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  290  5e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0193  hypothetical protein  65 
 
 		 140 aa  197  5e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3985  hypothetical protein  50 
 
 		 139 aa  147  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0591  hypothetical protein  39.85 
 
 		 170 aa  103  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135105  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0166  hypothetical protein  45.67 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4169  hypothetical protein  44.88 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4099  hypothetical protein  45.24 
 
 		 151 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4300  hypothetical protein  44.09 
 
 		 151 aa  100  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0157  hypothetical protein  44.09 
 
 		 151 aa  100  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0326453  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3538  hypothetical protein  42.75 
 
 		 145 aa  97.8  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3779  hypothetical protein  41.01 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.822352  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4593  hypothetical protein  36.05 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1966  hypothetical protein  34.56 
 
 		 144 aa  91.7  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3852  hypothetical protein  40.29 
 
 		 151 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3979  hypothetical protein  41.04 
 
 		 152 aa  90.9  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0272  hypothetical protein  32.35 
 
 		 144 aa  83.6  8e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4148  hypothetical protein  33.61 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.144769 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1563  hypothetical protein  34.02 
 
 		 230 aa  51.2  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.481041  hitchhiker  0.0000891871 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0786  hypothetical protein  29.53 
 
 		 233 aa  48.9  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2541  hypothetical protein  30.33 
 
 		 230 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.688217  hitchhiker  0.00185195 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2633  hypothetical protein  34.38 
 
 		 240 aa  48.9  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2633  hypothetical protein  29.6 
 
 		 230 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00306883 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2728  hypothetical protein  30.33 
 
 		 229 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000631509 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1626  hypothetical protein  30.33 
 
 		 229 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2473  hypothetical protein  29.51 
 
 		 230 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00172237 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1615  hypothetical protein  30.33 
 
 		 229 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2432  hypothetical protein  39.18 
 
 		 234 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1649  hypothetical protein  30.33 
 
 		 229 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.429893 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1590  hypothetical protein  29.31 
 
 		 234 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.124163 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1816  hypothetical protein  28.8 
 
 		 226 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1584  hypothetical protein  29.31 
 
 		 238 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.753254  normal  0.316977 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2486  hypothetical protein  24.8 
 
 		 229 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.821286  normal  0.0164308 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1523  hypothetical protein  27.59 
 
 		 234 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3089  hypothetical protein  29.17 
 
 		 224 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.841691  hitchhiker  0.0000201211 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2631  hypothetical protein  31.09 
 
 		 252 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1510  hypothetical protein  29.63 
 
 		 234 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2745  hypothetical protein  30.25 
 
 		 252 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.284126 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>