49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1510 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1510  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  480  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1816  hypothetical protein  82.05 
 
 
226 aa  378  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2473  hypothetical protein  83.33 
 
 
230 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00172237 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2633  hypothetical protein  83.76 
 
 
230 aa  369  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00306883 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2541  hypothetical protein  82.91 
 
 
230 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.688217  hitchhiker  0.00185195 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1649  hypothetical protein  79.91 
 
 
229 aa  357  9e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.429893 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1626  hypothetical protein  79.91 
 
 
229 aa  356  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1615  hypothetical protein  79.91 
 
 
229 aa  356  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2728  hypothetical protein  79.91 
 
 
229 aa  356  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000631509 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1563  hypothetical protein  57.38 
 
 
230 aa  286  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.481041  hitchhiker  0.0000891871 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2486  hypothetical protein  58.97 
 
 
229 aa  280  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.821286  normal  0.0164308 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2659  hypothetical protein  56.25 
 
 
236 aa  275  5e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3089  hypothetical protein  54.43 
 
 
224 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.841691  hitchhiker  0.0000201211 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1246  hypothetical protein  53.85 
 
 
234 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106966 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2633  hypothetical protein  52.08 
 
 
240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2432  hypothetical protein  47.3 
 
 
234 aa  211  9e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2815  hypothetical protein  22.87 
 
 
221 aa  64.7  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.270347  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1761  hypothetical protein  25.73 
 
 
223 aa  60.5  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0748188  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3206  hypothetical protein  26.58 
 
 
226 aa  59.7  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00873811  normal  0.0205878 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2623  hypothetical protein  26.58 
 
 
226 aa  59.7  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.515334  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2534  hypothetical protein  26.58 
 
 
226 aa  59.7  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000238326  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2679  conserved hypothetical protein  22.03 
 
 
220 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.430544  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1079  hypothetical protein  22.03 
 
 
220 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928447  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00968  hypothetical protein  22.03 
 
 
220 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.554756  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2155  hypothetical protein  22.03 
 
 
220 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.257613  normal  0.348745 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1476  hypothetical protein  22.47 
 
 
220 aa  56.2  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00975  hypothetical protein  22.03 
 
 
220 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2351  hypothetical protein  22.03 
 
 
220 aa  56.2  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.300281  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1140  hypothetical protein  21.59 
 
 
220 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.704245 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1128  hypothetical protein  22.03 
 
 
220 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.52869  normal  0.229343 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2632  hypothetical protein  22.03 
 
 
220 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.521459  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1073  hypothetical protein  22.03 
 
 
220 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00226171  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1035  hypothetical protein  21.59 
 
 
220 aa  55.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.251889  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1152  hypothetical protein  21.59 
 
 
220 aa  55.5  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1118  hypothetical protein  21.59 
 
 
220 aa  55.1  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000226557 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1186  hypothetical protein  21.59 
 
 
220 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  0.698742 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1232  hypothetical protein  22.8 
 
 
243 aa  53.9  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1349  hypothetical protein  23.31 
 
 
217 aa  54.3  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1784  hypothetical protein  28.33 
 
 
231 aa  50.1  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.215532  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0591  hypothetical protein  27.69 
 
 
170 aa  49.7  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135105  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1720  hypothetical protein  23.83 
 
 
224 aa  48.9  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.851625  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0193  hypothetical protein  28.46 
 
 
140 aa  47.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1437  hypothetical protein  22.67 
 
 
208 aa  47  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000552081  normal  0.908079 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1216  hypothetical protein  23.36 
 
 
215 aa  47.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.273624  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0214  hypothetical protein  30.33 
 
 
141 aa  45.8  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1966  hypothetical protein  26.12 
 
 
144 aa  45.8  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4148  hypothetical protein  30.39 
 
 
133 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.144769 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0786  hypothetical protein  25.76 
 
 
233 aa  43.5  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1523  hypothetical protein  24.78 
 
 
234 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>