62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_00968 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_2679  conserved hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  448  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.430544  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00975  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  448  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1128  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  448  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.52869  normal  0.229343 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2351  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  448  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.300281  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2155  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  448  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.257613  normal  0.348745 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1079  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  448  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928447  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00968  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  448  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.554756  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2632  hypothetical protein  99.55 
 
 
220 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.521459  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1073  hypothetical protein  99.55 
 
 
220 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00226171  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1140  hypothetical protein  85.45 
 
 
220 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.704245 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1152  hypothetical protein  85.45 
 
 
220 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1118  hypothetical protein  85 
 
 
220 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000226557 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1186  hypothetical protein  84.09 
 
 
220 aa  387  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  0.698742 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1035  hypothetical protein  84.09 
 
 
220 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.251889  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1476  hypothetical protein  78.64 
 
 
220 aa  363  1e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1761  hypothetical protein  40 
 
 
223 aa  170  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0748188  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3206  hypothetical protein  36.96 
 
 
226 aa  150  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00873811  normal  0.0205878 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2534  hypothetical protein  36.52 
 
 
226 aa  148  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000238326  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2623  hypothetical protein  36.52 
 
 
226 aa  148  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.515334  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1216  hypothetical protein  35.53 
 
 
215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.273624  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2542  hypothetical protein  36.52 
 
 
174 aa  116  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0704132  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2851  hypothetical protein  36.21 
 
 
174 aa  116  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0787973  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1349  hypothetical protein  31.28 
 
 
217 aa  87.8  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3089  hypothetical protein  24.89 
 
 
224 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.841691  hitchhiker  0.0000201211 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3571  hypothetical protein  29.32 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0107  hypothetical protein  23.26 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2811  hypothetical protein  25.94 
 
 
226 aa  64.7  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.255962  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1784  hypothetical protein  25 
 
 
231 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.215532  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2659  hypothetical protein  25 
 
 
236 aa  62.8  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2129  hypothetical protein  24.39 
 
 
208 aa  62.8  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.116207  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1720  hypothetical protein  24.75 
 
 
224 aa  61.6  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.851625  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06645  hypothetical protein  25.11 
 
 
239 aa  60.5  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01270  hypothetical protein  26.45 
 
 
198 aa  59.3  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1523  hypothetical protein  26.99 
 
 
234 aa  59.3  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1563  hypothetical protein  23.58 
 
 
230 aa  59.3  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.481041  hitchhiker  0.0000891871 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2486  hypothetical protein  26.43 
 
 
229 aa  58.2  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.821286  normal  0.0164308 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004185  hypothetical protein  27.12 
 
 
197 aa  57.8  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.737127  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1615  hypothetical protein  24.56 
 
 
229 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2728  hypothetical protein  24.56 
 
 
229 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000631509 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1626  hypothetical protein  24.56 
 
 
229 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1649  hypothetical protein  24.56 
 
 
229 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.429893 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001140  putative secreted protein  24.66 
 
 
239 aa  56.6  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2473  hypothetical protein  23.08 
 
 
230 aa  55.8  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00172237 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1610  hypothetical protein  29.22 
 
 
251 aa  55.5  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000546178  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1590  hypothetical protein  25.56 
 
 
234 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.124163 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1584  hypothetical protein  27.07 
 
 
238 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.753254  normal  0.316977 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3483  hypothetical protein  27.23 
 
 
194 aa  53.9  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532841  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2633  hypothetical protein  22.87 
 
 
230 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00306883 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2355  hypothetical protein  21.67 
 
 
256 aa  53.1  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2541  hypothetical protein  22.87 
 
 
230 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.688217  hitchhiker  0.00185195 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1816  hypothetical protein  21.65 
 
 
226 aa  52.4  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1444  hypothetical protein  23.12 
 
 
224 aa  50.1  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000075829  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1510  hypothetical protein  22.37 
 
 
234 aa  49.3  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2432  hypothetical protein  21.76 
 
 
234 aa  48.5  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003961  putative secreted protein  22.82 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2745  hypothetical protein  23.79 
 
 
252 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.284126 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2815  hypothetical protein  22.12 
 
 
221 aa  45.1  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.270347  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2631  hypothetical protein  24.49 
 
 
252 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1718  hypothetical protein  25.11 
 
 
252 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0414729  hitchhiker  0.0000333205 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2666  hypothetical protein  24.9 
 
 
252 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.141618  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2633  hypothetical protein  31.03 
 
 
240 aa  42.7  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1246  hypothetical protein  19.35 
 
 
234 aa  42.4  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106966 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>