51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1523 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1523  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  474  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1590  hypothetical protein  94.87 
 
 		 234 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.124163 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1584  hypothetical protein  91.6 
 
 		 238 aa  410  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.753254  normal  0.316977 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3571  hypothetical protein  67.95 
 
 		 212 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1718  hypothetical protein  47.73 
 
 		 252 aa  235  4e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0414729  hitchhiker  0.0000333205 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2745  hypothetical protein  48.24 
 
 		 252 aa  234  8e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.284126 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2666  hypothetical protein  48.62 
 
 		 252 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.141618  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1610  hypothetical protein  47.39 
 
 		 251 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000546178  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2631  hypothetical protein  46.59 
 
 		 252 aa  228  7e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0786  hypothetical protein  42.48 
 
 		 233 aa  166  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1720  hypothetical protein  38.1 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.851625  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2811  hypothetical protein  34.19 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.255962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1784  hypothetical protein  34.78 
 
 		 231 aa  132  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.215532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06645  hypothetical protein  32.35 
 
 		 239 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2355  hypothetical protein  31.15 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2129  hypothetical protein  29.41 
 
 		 208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.116207  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0107  hypothetical protein  30.93 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001140  putative secreted protein  28.57 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1444  hypothetical protein  33.33 
 
 		 224 aa  89.4  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000075829  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003961  putative secreted protein  33.12 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3483  hypothetical protein  26.94 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532841  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1761  hypothetical protein  25.53 
 
 		 223 aa  72  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0748188  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2351  hypothetical protein  26.01 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.300281  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2155  hypothetical protein  26.01 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.257613  normal  0.348745 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1128  hypothetical protein  26.01 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.52869  normal  0.229343 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2679  conserved hypothetical protein  26.01 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.430544  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00975  hypothetical protein  26.01 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1079  hypothetical protein  26.01 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928447  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00968  hypothetical protein  26.01 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.554756  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1073  hypothetical protein  26.01 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00226171  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2632  hypothetical protein  26.01 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.521459  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1035  hypothetical protein  27.31 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.251889  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1152  hypothetical protein  26.79 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1140  hypothetical protein  26.79 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.704245 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1186  hypothetical protein  26.32 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  0.698742 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1349  hypothetical protein  23.18 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1118  hypothetical protein  26.79 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000226557 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3206  hypothetical protein  27.19 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00873811  normal  0.0205878 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2623  hypothetical protein  27.19 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.515334  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2534  hypothetical protein  27.19 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000238326  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004185  hypothetical protein  29.73 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.737127  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1476  hypothetical protein  25.56 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1232  hypothetical protein  26.7 
 
 		 243 aa  57  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1216  hypothetical protein  27.03 
 
 		 215 aa  52.4  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.273624  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01270  hypothetical protein  27.03 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2659  hypothetical protein  25.1 
 
 		 236 aa  50.1  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2542  hypothetical protein  30.34 
 
 		 174 aa  46.6  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0704132  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2432  hypothetical protein  24.78 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2851  hypothetical protein  29.5 
 
 		 174 aa  44.3  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0787973  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0214  hypothetical protein  27.59 
 
 		 141 aa  42.7  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2633  hypothetical protein  26.38 
 
 		 240 aa  42  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>