49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2659 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2659  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  483  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1563  hypothetical protein  59.49 
 
 
230 aa  294  7e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.481041  hitchhiker  0.0000891871 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3089  hypothetical protein  57.63 
 
 
224 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.841691  hitchhiker  0.0000201211 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2473  hypothetical protein  59.49 
 
 
230 aa  275  5e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00172237 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2486  hypothetical protein  57.63 
 
 
229 aa  270  1e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.821286  normal  0.0164308 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2541  hypothetical protein  59.07 
 
 
230 aa  269  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.688217  hitchhiker  0.00185195 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2633  hypothetical protein  59.07 
 
 
230 aa  268  4e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00306883 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1816  hypothetical protein  56.36 
 
 
226 aa  265  4e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1615  hypothetical protein  55.7 
 
 
229 aa  264  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2728  hypothetical protein  55.7 
 
 
229 aa  264  1e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000631509 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1626  hypothetical protein  55.7 
 
 
229 aa  264  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1649  hypothetical protein  55.27 
 
 
229 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.429893 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1510  hypothetical protein  54.39 
 
 
234 aa  247  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1246  hypothetical protein  58.16 
 
 
234 aa  245  4e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106966 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2633  hypothetical protein  46.83 
 
 
240 aa  236  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2432  hypothetical protein  43.1 
 
 
234 aa  194  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2534  hypothetical protein  23.71 
 
 
226 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000238326  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2623  hypothetical protein  23.71 
 
 
226 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.515334  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3206  hypothetical protein  23.71 
 
 
226 aa  71.2  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00873811  normal  0.0205878 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1761  hypothetical protein  27.43 
 
 
223 aa  68.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0748188  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1152  hypothetical protein  25.1 
 
 
220 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00975  hypothetical protein  25 
 
 
220 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2155  hypothetical protein  25 
 
 
220 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.257613  normal  0.348745 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2679  conserved hypothetical protein  25 
 
 
220 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.430544  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2351  hypothetical protein  25 
 
 
220 aa  62.8  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.300281  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1118  hypothetical protein  25.1 
 
 
220 aa  62.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000226557 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1128  hypothetical protein  25 
 
 
220 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.52869  normal  0.229343 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1140  hypothetical protein  25.1 
 
 
220 aa  62.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.704245 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1079  hypothetical protein  25 
 
 
220 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928447  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00968  hypothetical protein  25 
 
 
220 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.554756  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1073  hypothetical protein  25 
 
 
220 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00226171  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2632  hypothetical protein  25 
 
 
220 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.521459  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1186  hypothetical protein  24.69 
 
 
220 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  0.698742 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1035  hypothetical protein  24.69 
 
 
220 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.251889  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1232  hypothetical protein  24.89 
 
 
243 aa  59.7  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1437  hypothetical protein  25.33 
 
 
208 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000552081  normal  0.908079 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1476  hypothetical protein  22.84 
 
 
220 aa  55.1  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1216  hypothetical protein  21.5 
 
 
215 aa  52.4  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.273624  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2815  hypothetical protein  23.38 
 
 
221 aa  51.6  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.270347  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1349  hypothetical protein  23.43 
 
 
217 aa  49.7  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0786  hypothetical protein  24.58 
 
 
233 aa  44.7  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1523  hypothetical protein  24.36 
 
 
234 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1720  hypothetical protein  23.83 
 
 
224 aa  44.3  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.851625  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1590  hypothetical protein  24.58 
 
 
234 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.124163 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2129  hypothetical protein  37.29 
 
 
208 aa  42.7  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.116207  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0591  hypothetical protein  27.05 
 
 
170 aa  42.4  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135105  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1966  hypothetical protein  26.83 
 
 
144 aa  42.4  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0272  hypothetical protein  26.83 
 
 
144 aa  42.4  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3538  hypothetical protein  26.45 
 
 
145 aa  42  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>