46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1816 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1816  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  462  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2473  hypothetical protein  87.39 
 
 		 230 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00172237 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2633  hypothetical protein  88.7 
 
 		 230 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00306883 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2541  hypothetical protein  87.39 
 
 		 230 aa  394  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.688217  hitchhiker  0.00185195 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2728  hypothetical protein  83.41 
 
 		 229 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000631509 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1649  hypothetical protein  83.41 
 
 		 229 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.429893 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1626  hypothetical protein  83.41 
 
 		 229 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1615  hypothetical protein  83.41 
 
 		 229 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1510  hypothetical protein  81.36 
 
 		 234 aa  352  2.9999999999999997e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1563  hypothetical protein  60.87 
 
 		 230 aa  292  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.481041  hitchhiker  0.0000891871 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3089  hypothetical protein  58.95 
 
 		 224 aa  285  4e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.841691  hitchhiker  0.0000201211 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2486  hypothetical protein  63.79 
 
 		 229 aa  281  6.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.821286  normal  0.0164308 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2659  hypothetical protein  56.12 
 
 		 236 aa  271  5.000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1246  hypothetical protein  57.98 
 
 		 234 aa  258  7e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106966 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2633  hypothetical protein  51.25 
 
 		 240 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2432  hypothetical protein  45.61 
 
 		 234 aa  206  3e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2815  hypothetical protein  24.32 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.270347  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2623  hypothetical protein  25.78 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.515334  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2534  hypothetical protein  25.78 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000238326  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3206  hypothetical protein  25.78 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00873811  normal  0.0205878 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1761  hypothetical protein  26.72 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0748188  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1476  hypothetical protein  22.37 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1186  hypothetical protein  23.04 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  0.698742 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1140  hypothetical protein  22.61 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.704245 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1035  hypothetical protein  22.61 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.251889  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1118  hypothetical protein  22.61 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000226557 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1152  hypothetical protein  22.61 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2351  hypothetical protein  23.89 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.300281  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2155  hypothetical protein  23.89 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.257613  normal  0.348745 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2679  conserved hypothetical protein  23.89 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.430544  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1128  hypothetical protein  23.89 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.52869  normal  0.229343 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00975  hypothetical protein  23.89 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1079  hypothetical protein  23.89 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928447  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00968  hypothetical protein  23.89 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.554756  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2632  hypothetical protein  23.89 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.521459  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1073  hypothetical protein  23.89 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00226171  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1216  hypothetical protein  23.27 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.273624  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1232  hypothetical protein  25 
 
 		 243 aa  52.4  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1349  hypothetical protein  23.29 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0591  hypothetical protein  27.73 
 
 		 170 aa  47  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135105  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1784  hypothetical protein  28.63 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.215532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1720  hypothetical protein  23.22 
 
 		 224 aa  45.8  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.851625  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0214  hypothetical protein  28.8 
 
 		 141 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4148  hypothetical protein  37.88 
 
 		 133 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.144769 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1966  hypothetical protein  26.12 
 
 		 144 aa  44.3  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1610  hypothetical protein  23.11 
 
 		 251 aa  42.7  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000546178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>