53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2298 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2298  putative alpha-glucosidase  100 
 
 		 647 aa  1337    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1628  putative alpha-glucosidase  43.5 
 
 		 678 aa  567  1e-160  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0539219  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2360  putative alpha-glucosidase  42.28 
 
 		 679 aa  552  1e-156  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0169  putative alpha-glucosidase  42.77 
 
 		 656 aa  538  1e-151  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5410  alpha-glucosidase, putative  40.46 
 
 		 648 aa  512  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0179561  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4959  hypothetical protein  39.21 
 
 		 659 aa  498  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5726  Glycoside hydrolase 97  38.3 
 
 		 656 aa  469  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.035847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1312  putative alpha-glucosidase  37.46 
 
 		 655 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3217  alpha-glucosidase, putative  34.63 
 
 		 682 aa  342  2e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751285  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23190  alpha-glucosidase  30.61 
 
 		 701 aa  275  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.243429  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3876  Glycoside hydrolase 97  31.22 
 
 		 571 aa  274  4.0000000000000004e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0907495  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4326  hypothetical protein  30.49 
 
 		 672 aa  268  2.9999999999999995e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2002  alpha-glucosidase  30.72 
 
 		 727 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0590  alpha-glucosidase  30.26 
 
 		 684 aa  260  7e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.225417  normal  0.0221919 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2102  alpha-glucosidase  29.52 
 
 		 703 aa  259  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.869354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51780  alpha-glucosidase  29.76 
 
 		 673 aa  258  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.816262  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1876  alpha-glucosidase  29.67 
 
 		 703 aa  257  4e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1931  alpha-glucosidase  29.52 
 
 		 703 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0058  Glycoside hydrolase 97  30.31 
 
 		 693 aa  255  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.52966 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1876  alpha-glucosidase  29.68 
 
 		 707 aa  251  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.507439 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1108  alpha-glucosidase  30.13 
 
 		 676 aa  250  5e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2329  alpha-glucosidase  29.67 
 
 		 710 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20719  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1777  alpha-glucosidase  29.82 
 
 		 697 aa  246  8e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2445  alpha-glucosidase  29.81 
 
 		 710 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.607095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2329  alpha-glucosidase  29.52 
 
 		 710 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0367  putative alpha-glucosidase  28.91 
 
 		 677 aa  243  7.999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2017  alpha-glucosidase  29.67 
 
 		 702 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.248833  hitchhiker  0.00490164 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2450  alpha-glucosidase  29.51 
 
 		 699 aa  239  9e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1153  putative alpha-glucosidase  29.28 
 
 		 574 aa  239  1e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2740  alpha-glucosidase  28.94 
 
 		 703 aa  238  2e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2499  putative alpha-glucosidase  29.79 
 
 		 674 aa  229  9e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5767  putative alpha-glucosidase  28.84 
 
 		 711 aa  229  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1892  alpha-glucosidase  27.33 
 
 		 682 aa  223  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1209  hypothetical protein  26.53 
 
 		 726 aa  221  3.9999999999999997e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0185  alpha-glucosidase  26.29 
 
 		 680 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0626  alpha-glucosidase  26.39 
 
 		 727 aa  215  1.9999999999999998e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1400  hypothetical protein  27.25 
 
 		 704 aa  216  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2708  hypothetical protein  26.91 
 
 		 629 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0314889  normal  0.739389 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4429  hypothetical protein  27.23 
 
 		 707 aa  213  5.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.857441  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1394  hypothetical protein  27.14 
 
 		 700 aa  213  5.999999999999999e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.872498  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0476  alpha-glucosidase, putative, adg97A  29.06 
 
 		 643 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1420  hypothetical protein  27.78 
 
 		 649 aa  211  3e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.828826  normal  0.205294 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1019  alpha-glucosidase  26.3 
 
 		 683 aa  210  5e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0777  hypothetical protein  30.3 
 
 		 606 aa  207  4e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0928  hypothetical protein  26.97 
 
 		 728 aa  199  2.0000000000000003e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.453447  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3805  hypothetical protein  26.87 
 
 		 615 aa  198  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2469  Glycoside hydrolase 97  28.19 
 
 		 641 aa  195  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3590  hypothetical protein  28.77 
 
 		 630 aa  187  5e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0790  alpha-glucosidase  25.64 
 
 		 661 aa  177  5e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0155602  normal  0.344193 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2159  alpha-glucosidase, putative, adg97A  25.42 
 
 		 658 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0591315  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3873  hypothetical protein  24.22 
 
 		 647 aa  147  8.000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437353  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1419  Glycoside hydrolase 97  24.01 
 
 		 648 aa  138  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.067122  normal  0.614514 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1460  Protein of unknown function DUF2223  25.7 
 
 		 1255 aa  136  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>