54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1495 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1495  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3532  hypothetical protein  51.85 
 
 		 255 aa  238  4e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2914  putative alpha/beta hydrolase  56.1 
 
 		 255 aa  229  4e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274125  normal  0.502699 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3354  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like  55.71 
 
 		 241 aa  228  5e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1332  hypothetical protein  53.08 
 
 		 309 aa  219  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0601  lipase, putative  53.7 
 
 		 268 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.267926 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1008  hypothetical protein  46.7 
 
 		 221 aa  182  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0301  hypothetical protein  43.66 
 
 		 216 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1076  PGAP1 family protein  46.19 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0272  hypothetical protein  43.66 
 
 		 216 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0756  hypothetical protein  46.01 
 
 		 222 aa  161  6e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2648  hypothetical protein  38.1 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.549613  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2277  hypothetical protein  38.68 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5737  hypothetical protein  39.29 
 
 		 245 aa  149  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310215  normal  0.993413 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2975  lipase, putative  36.24 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3773  PGAP1 family protein  36.71 
 
 		 393 aa  126  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1159  hypothetical protein  32.56 
 
 		 254 aa  113  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1164  hypothetical protein  32.56 
 
 		 254 aa  112  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2455  lipase, putative  26.92 
 
 		 247 aa  102  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1690  hypothetical protein  34.72 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00126399  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0802  hypothetical protein  30.67 
 
 		 240 aa  95.1  7e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.946026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2238  hypothetical protein  29.72 
 
 		 209 aa  84.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05312  cob(I)alamin adenosyltransferase  29.72 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0546  acetyltransferase/hydrolase  33.63 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338996  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0047  hypothetical protein  31.8 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1726  hypothetical protein  29.33 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120818  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0345  hypothetical protein  26.99 
 
 		 325 aa  79  0.00000000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0618  hypothetical protein  25 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000571  cob(I)alamin adenosyltransferase  29.44 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3129  PGAP1 family protein  33.96 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0537  cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase  28.77 
 
 		 393 aa  73.6  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.319517  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0515  hypothetical protein  36.13 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1019  hypothetical protein  26.76 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01554  hypothetical protein  29.82 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.114311  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2353  PGAP1-like protein  29.91 
 
 		 382 aa  54.3  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.808395  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2867  hypothetical protein  25.84 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1762  hypothetical protein  26.11 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.88395  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  30.91 
 
 		 339 aa  51.6  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  30.77 
 
 		 276 aa  51.2  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  29.81 
 
 		 324 aa  49.3  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  32.17 
 
 		 281 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0751  hypothetical protein  29.46 
 
 		 492 aa  46.6  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.870291 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0697  PGAP1 family protein  26.32 
 
 		 282 aa  45.1  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190659  normal  0.0587452 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  28.21 
 
 		 338 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  32.08 
 
 		 298 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0108  hypothetical protein  31.07 
 
 		 1878 aa  43.5  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7189  hypothetical protein  26.57 
 
 		 259 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  25.71 
 
 		 294 aa  43.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0906  PGAP1-like protein  27.64 
 
 		 344 aa  42  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0259  hypothetical protein  23.48 
 
 		 270 aa  42  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  27.83 
 
 		 306 aa  42  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  30.36 
 
 		 342 aa  42  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  27.83 
 
 		 306 aa  42  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0887  alpha/beta hydrolase fold  31.73 
 
 		 290 aa  42  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0583236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>