More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0724 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1020  protein of unknown function DUF214  76.83 
 
 		 436 aa  665    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0999  hypothetical protein  75.92 
 
 		 436 aa  660    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2990  hypothetical protein  76.38 
 
 		 436 aa  664    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1032  hypothetical protein  75.46 
 
 		 436 aa  658    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0724  hypothetical protein  100 
 
 		 436 aa  897    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3340  hypothetical protein  76.61 
 
 		 436 aa  665    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0899  hypothetical protein  67.28 
 
 		 437 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.811824  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2849  hypothetical protein  67.2 
 
 		 436 aa  580  1e-164  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4071  hypothetical protein  62.61 
 
 		 433 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3363  hypothetical protein  62.84 
 
 		 433 aa  551  1e-155  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2863  hypothetical protein  60.32 
 
 		 435 aa  545  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3721  hypothetical protein  62.16 
 
 		 433 aa  530  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.232567  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0864  hypothetical protein  59.95 
 
 		 434 aa  511  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3158  hypothetical protein  60.18 
 
 		 434 aa  512  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3259  hypothetical protein  59.95 
 
 		 434 aa  510  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2407  hypothetical protein  39.6 
 
 		 438 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2240  hypothetical protein  36.57 
 
 		 435 aa  278  1e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3502  protein of unknown function DUF214  38.01 
 
 		 432 aa  259  9e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.592439  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0574  putative ABC transporter, permease protein  31.14 
 
 		 432 aa  195  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3929  protein of unknown function DUF214  27.65 
 
 		 432 aa  132  9e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4840  protein of unknown function DUF214  24.06 
 
 		 810 aa  96.3  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.259968 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  24.62 
 
 		 406 aa  94.4  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4628  protein of unknown function DUF214  24.12 
 
 		 795 aa  91.3  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  25.21 
 
 		 805 aa  90.5  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  24.06 
 
 		 407 aa  89.4  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4844  protein of unknown function DUF214  23.09 
 
 		 793 aa  88.2  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357668  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.46 
 
 		 805 aa  88.2  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4623  protein of unknown function DUF214  25.14 
 
 		 808 aa  87.8  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.417059 
 
 
-
 
NC_002950  PG0281  ABC transporter, permease protein, putative  23.4 
 
 		 458 aa  87  6e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  25.34 
 
 		 802 aa  87  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  23.41 
 
 		 402 aa  85.9  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5612  protein of unknown function DUF214  21.44 
 
 		 414 aa  86.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2084  protein of unknown function DUF214  21.2 
 
 		 801 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.326443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  23.55 
 
 		 805 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  24.57 
 
 		 405 aa  85.5  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  25.39 
 
 		 653 aa  84  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0230  protein of unknown function DUF214  24.54 
 
 		 402 aa  83.6  0.000000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.78911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  23.27 
 
 		 805 aa  83.6  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4848  protein of unknown function DUF214  25.14 
 
 		 804 aa  83.6  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00205753  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4857  protein of unknown function DUF214  21.81 
 
 		 793 aa  83.2  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.586648  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0935  protein of unknown function DUF214  20.65 
 
 		 785 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  25.88 
 
 		 819 aa  82  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1506  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.55 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.746473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3314  protein of unknown function DUF214  22.78 
 
 		 806 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0603  protein of unknown function DUF214  23.95 
 
 		 809 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.237353 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  23.33 
 
 		 405 aa  81.3  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.71 
 
 		 882 aa  80.9  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  25.23 
 
 		 657 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.4 
 
 		 823 aa  80.5  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5545  protein of unknown function DUF214  24.12 
 
 		 788 aa  80.1  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.366096  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.74 
 
 		 805 aa  80.1  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0939  protein of unknown function DUF214  25.9 
 
 		 770 aa  79.7  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.709248 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  23.06 
 
 		 805 aa  79.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.83 
 
 		 413 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  23.72 
 
 		 404 aa  79.3  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  23.72 
 
 		 404 aa  79.3  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  24.72 
 
 		 821 aa  78.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1760  protein of unknown function DUF214  21.74 
 
 		 798 aa  78.2  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.962231  normal  0.806233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0958  protein of unknown function DUF214  24.09 
 
 		 797 aa  77.8  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00075656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  26.53 
 
 		 421 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5675  protein of unknown function DUF214  22.1 
 
 		 789 aa  77.8  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.279033 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  23.3 
 
 		 409 aa  77.8  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4615  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 807 aa  77.4  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0929  protein of unknown function DUF214  21.97 
 
 		 791 aa  77  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4631  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.55 
 
 		 419 aa  77  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1539  protein of unknown function DUF214  22.76 
 
 		 804 aa  76.6  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0948  protein of unknown function DUF214  22.53 
 
 		 797 aa  76.6  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  25.26 
 
 		 865 aa  76.6  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4859  protein of unknown function DUF214  24.16 
 
 		 792 aa  76.3  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0508357 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  23.56 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  24.42 
 
 		 421 aa  75.9  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  21.43 
 
 		 409 aa  76.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  25.83 
 
 		 415 aa  75.1  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3764  protein of unknown function DUF214  23.04 
 
 		 714 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5420  protein of unknown function DUF214  21.37 
 
 		 784 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0066196  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4598  protein of unknown function DUF214  25.16 
 
 		 784 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0266  hypothetical protein  26.69 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17241  normal  0.0445989 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.63 
 
 		 807 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3610  protein of unknown function DUF214  23.29 
 
 		 789 aa  74.7  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.251487  hitchhiker  0.000460877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4641  protein of unknown function DUF214  23.09 
 
 		 836 aa  75.1  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0388606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  24.1 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0269  hypothetical protein  25.91 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.831572  hitchhiker  0.00091516 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  25.5 
 
 		 411 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4624  protein of unknown function DUF214  22.67 
 
 		 811 aa  74.3  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.41173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0936  protein of unknown function DUF214  23.19 
 
 		 793 aa  73.9  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  23.29 
 
 		 804 aa  74.3  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  22.4 
 
 		 385 aa  74.3  0.000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0472  hypothetical protein  26.88 
 
 		 807 aa  73.9  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4618  protein of unknown function DUF214  23.08 
 
 		 808 aa  73.9  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.154299 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4591  protein of unknown function DUF214  23.69 
 
 		 795 aa  73.2  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0960  protein of unknown function DUF214  22.77 
 
 		 803 aa  73.2  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000834077  normal  0.437277 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  25.98 
 
 		 656 aa  73.2  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  23.34 
 
 		 406 aa  73.2  0.000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  22.73 
 
 		 411 aa  73.2  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.57 
 
 		 808 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2247  protein of unknown function DUF214  23.94 
 
 		 805 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4905  protein of unknown function DUF214  24.06 
 
 		 798 aa  71.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0532186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4595  protein of unknown function DUF214  28.53 
 
 		 800 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0697  protein of unknown function DUF214  27.84 
 
 		 401 aa  72  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  21.25 
 
 		 391 aa  72  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>