53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2329 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1892  alpha-glucosidase  49.41 
 
 
682 aa  663    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2017  alpha-glucosidase  95.21 
 
 
702 aa  1399    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.248833  hitchhiker  0.00490164 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1019  alpha-glucosidase  53.1 
 
 
683 aa  716    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51780  alpha-glucosidase  50.91 
 
 
673 aa  643    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.816262  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2445  alpha-glucosidase  98.03 
 
 
710 aa  1447    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.607095  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2450  alpha-glucosidase  86.2 
 
 
699 aa  1291    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2329  alpha-glucosidase  100 
 
 
710 aa  1471    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20719  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4326  hypothetical protein  47.88 
 
 
672 aa  664    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1876  alpha-glucosidase  71.69 
 
 
707 aa  1066    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.507439 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2329  alpha-glucosidase  97.46 
 
 
710 aa  1438    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1108  alpha-glucosidase  63.96 
 
 
676 aa  880    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1931  alpha-glucosidase  85.94 
 
 
703 aa  1271    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1777  alpha-glucosidase  71.12 
 
 
697 aa  1050    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0590  alpha-glucosidase  65.83 
 
 
684 aa  952    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.225417  normal  0.0221919 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0367  putative alpha-glucosidase  51.04 
 
 
677 aa  694    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2002  alpha-glucosidase  70.51 
 
 
727 aa  1051    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0185  alpha-glucosidase  50.61 
 
 
680 aa  655    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1876  alpha-glucosidase  86.08 
 
 
703 aa  1273    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2102  alpha-glucosidase  86.08 
 
 
703 aa  1271    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.869354  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2740  alpha-glucosidase  57.27 
 
 
703 aa  794    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0058  Glycoside hydrolase 97  45.49 
 
 
693 aa  573  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.52966 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23190  alpha-glucosidase  43.87 
 
 
701 aa  556  1e-157  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.243429  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0777  hypothetical protein  45.28 
 
 
606 aa  540  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1394  hypothetical protein  41.6 
 
 
700 aa  539  9.999999999999999e-153  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.872498  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1209  hypothetical protein  40.34 
 
 
726 aa  521  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0626  alpha-glucosidase  38.71 
 
 
727 aa  497  1e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5767  putative alpha-glucosidase  39.6 
 
 
711 aa  494  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4429  hypothetical protein  39.33 
 
 
707 aa  477  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.857441  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1400  hypothetical protein  36.5 
 
 
704 aa  462  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0928  hypothetical protein  37.18 
 
 
728 aa  457  1e-127  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.453447  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1460  Protein of unknown function DUF2223  35.34 
 
 
1255 aa  298  2e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3217  alpha-glucosidase, putative  30.29 
 
 
682 aa  261  3e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751285  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1628  putative alpha-glucosidase  29.67 
 
 
678 aa  252  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0539219  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1312  putative alpha-glucosidase  28.97 
 
 
655 aa  248  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2298  putative alpha-glucosidase  29.67 
 
 
647 aa  246  8e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4959  hypothetical protein  27.76 
 
 
659 aa  246  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0169  putative alpha-glucosidase  29.5 
 
 
656 aa  244  3.9999999999999997e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5726  Glycoside hydrolase 97  28.36 
 
 
656 aa  236  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.035847 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2360  putative alpha-glucosidase  28.98 
 
 
679 aa  232  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103256  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5410  alpha-glucosidase, putative  29.32 
 
 
648 aa  226  8e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0179561  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3805  hypothetical protein  25.44 
 
 
615 aa  198  4.0000000000000005e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3876  Glycoside hydrolase 97  27.7 
 
 
571 aa  161  4e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0907495  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3590  hypothetical protein  26.22 
 
 
630 aa  160  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116623  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0476  alpha-glucosidase, putative, adg97A  27.63 
 
 
643 aa  160  5e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2159  alpha-glucosidase, putative, adg97A  27.6 
 
 
658 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0591315  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1153  putative alpha-glucosidase  23.79 
 
 
574 aa  138  4e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1420  hypothetical protein  24.58 
 
 
649 aa  137  7.000000000000001e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.828826  normal  0.205294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2708  hypothetical protein  23.72 
 
 
629 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0314889  normal  0.739389 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0790  alpha-glucosidase  25.43 
 
 
661 aa  132  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0155602  normal  0.344193 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2499  putative alpha-glucosidase  23.69 
 
 
674 aa  122  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2469  Glycoside hydrolase 97  23.92 
 
 
641 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3873  hypothetical protein  22.48 
 
 
647 aa  95.5  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437353  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1419  Glycoside hydrolase 97  24.07 
 
 
648 aa  94.4  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.067122  normal  0.614514 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>