More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_04370 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_04370  Rhodanese-related sulfurtransferase  100 
 
 		 163 aa  333  7e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155672 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  30.46 
 
 		 144 aa  83.6  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  43.53 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2652  rhodanese-like protein  42.11 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  41.18 
 
 		 130 aa  77  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  35.35 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  39.39 
 
 		 116 aa  71.6  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1872  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  43.66 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0100112 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1810  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  43.66 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000312161 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1646  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  43.66 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000604972 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1811  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  43.66 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.197401 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1464  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  43.66 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.176791  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01285  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase (rhodanese)  46.58 
 
 		 104 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2338  phage shock operon rhodanese PspE  46.58 
 
 		 104 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00488281  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1544  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  46.58 
 
 		 104 aa  70.5  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2317  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  46.58 
 
 		 104 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00657888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1518  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  46.58 
 
 		 104 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01296  hypothetical protein  46.58 
 
 		 104 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1423  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  46.58 
 
 		 104 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1814  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  46.58 
 
 		 104 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.309116 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  35.19 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1950  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  45.21 
 
 		 104 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  38 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1374  rhodanese-like protein  36.36 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0706791  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  31.97 
 
 		 189 aa  63.9  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4614  Rhodanese domain protein  30.1 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480272  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  37.97 
 
 		 99 aa  63.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  31.62 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  37.97 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  33.33 
 
 		 346 aa  62.4  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  36.36 
 
 		 354 aa  62.4  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  31.46 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  37.65 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  27.41 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  34.94 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  36.08 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  32.08 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2832  rhodanese domain-containing protein  36.11 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018114 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.79 
 
 		 393 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  36.26 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  36.67 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  33.73 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  34.74 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  31.63 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  38.36 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  34.25 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.29 
 
 		 389 aa  57.8  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2802  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2782  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245575  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48690  Rhodanese-like protein with Ankyrin repeat  32.99 
 
 		 261 aa  57.4  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16580  Rhodanese-related sulfurtransferase  36.14 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0172752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0839  rhodanese-like domain-containing protein  33.02 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  36.56 
 
 		 389 aa  57  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  38.64 
 
 		 131 aa  57  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1238  hypothetical protein  34.67 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.950013  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  28.3 
 
 		 136 aa  57  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  36.17 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  33.68 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2086  rhodanese-like protein  32.1 
 
 		 121 aa  57  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  28.57 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  36.08 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1612  rhodanese domain-containing protein  39.74 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0487868  hitchhiker  0.00165935 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  36.05 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0063  rhodanese domain-containing protein  32.26 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00465337  unclonable  0.0000000104645 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  33.1 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  35.63 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05040  endoplasmic reticulum protein, putative  28.92 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.575301  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  38.16 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0334  rhodanese-like protein  34.74 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206424  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_13503  Rhodanese-related sulfurtransferase  33.61 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.258058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  27.62 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  36.05 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  35.63 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2042  rhodanese-like domain-containing protein  39.56 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000168009  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  37.97 
 
 		 388 aa  55.1  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0099  rhodanese domain-containing protein  31.18 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.973774  normal  0.0985137 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  34.69 
 
 		 282 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1406  rhodanese-like protein  36.59 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700677  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  32.71 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0701  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  32.32 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.6297700000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4464  Rhodanese domain protein  34.82 
 
 		 549 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448284 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0063  Rhodanese domain protein  39.19 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0402698 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3602  rhodanese-like protein  37.21 
 
 		 527 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717675  normal  0.234562 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4598  Rhodanese domain protein  34.82 
 
 		 549 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.664806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  35.29 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  30.7 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  35.23 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1458  rhodanese-like protein  28.26 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  36.71 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  38.67 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  35.37 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3040  rhodanese domain-containing protein  36.14 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00420401  normal  0.0677639 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5106  rhodanese domain-containing protein  34.04 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  34.29 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  26.45 
 
 		 656 aa  53.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>