70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_04270 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_04270  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  374  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.379993  normal  0.356103 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1445  flavocytochrome c heme subunit  36 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.390446  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0137  fumarate reductase flavoprotein subunit  27.27 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.100425  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2585  hypothetical protein  38.26 
 
 		 232 aa  58.2  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000203897  normal  0.20088 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2528  hypothetical protein  35.54 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  36.04 
 
 		 596 aa  54.7  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2892  hypothetical protein  43.33 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2097  hypothetical protein  32.28 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.206741  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1158  hypothetical protein  36.46 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1860  hypothetical protein  36.45 
 
 		 221 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  37.25 
 
 		 596 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  36.21 
 
 		 596 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  33.04 
 
 		 589 aa  52.8  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  36.27 
 
 		 598 aa  52.8  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  33.62 
 
 		 596 aa  52.4  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  33.62 
 
 		 596 aa  52.4  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  33.62 
 
 		 596 aa  52.4  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  33.62 
 
 		 596 aa  52.4  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  36.27 
 
 		 596 aa  51.6  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  35.34 
 
 		 597 aa  51.6  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  36.27 
 
 		 596 aa  51.6  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1830  flavocytochrome c heme subunit  26.88 
 
 		 144 aa  51.2  0.000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0946  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  28.85 
 
 		 122 aa  51.2  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  33.65 
 
 		 589 aa  50.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1781  hypothetical protein  35.35 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.531778  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  34.34 
 
 		 588 aa  50.8  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  35.29 
 
 		 598 aa  50.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  34.91 
 
 		 593 aa  50.1  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2085  flavocytochrome c heme subunit  28.07 
 
 		 146 aa  49.3  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.952774  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3693  hypothetical protein  33.33 
 
 		 118 aa  49.3  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.799168  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  32.35 
 
 		 589 aa  48.9  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0627  hypothetical protein  38.46 
 
 		 125 aa  48.1  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.593343 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  33.33 
 
 		 596 aa  47.8  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1004  hypothetical protein  32 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3056  tetraheme cytochrome c  32.29 
 
 		 127 aa  47  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1005  hypothetical protein  29.09 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.289863 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1491  tetraheme cytochrome c  33.33 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2430  tetraheme cytochrome c  32.29 
 
 		 135 aa  45.4  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.439789  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  33 
 
 		 591 aa  45.4  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3370  tetraheme cytochrome c  34.38 
 
 		 126 aa  44.7  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.656549  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3617  hypothetical protein  30.21 
 
 		 137 aa  44.7  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1444  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  29.81 
 
 		 114 aa  44.7  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000626372 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3683  hypothetical protein  30.21 
 
 		 137 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4179  tetraheme cytochrome c  43.55 
 
 		 120 aa  44.3  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.717177 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  31.48 
 
 		 596 aa  43.9  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  33.33 
 
 		 596 aa  43.9  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3182  hypothetical protein  31.25 
 
 		 118 aa  43.9  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0887  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  43.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.590211  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1393  hypothetical protein  31.71 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0527  hypothetical protein  29.37 
 
 		 231 aa  43.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.810163 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3300  cytochrome c  28.8 
 
 		 126 aa  42.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0342  tetraheme cytochrome c  40 
 
 		 126 aa  42.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07630  hypothetical protein  31.75 
 
 		 229 aa  42.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.48578 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04960  hypothetical protein  32 
 
 		 240 aa  42.4  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3623  tetraheme cytochrome c  41.94 
 
 		 116 aa  42  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2786  hypothetical protein  32.29 
 
 		 113 aa  42  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.12053 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  32.32 
 
 		 583 aa  42.4  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0533  hypothetical protein  28.57 
 
 		 222 aa  42.4  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.738429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2279  tetraheme cytochrome c  30.21 
 
 		 126 aa  42  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0855381  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3921  cytochrome c nitrite reductase, pentaheme subunit  27.75 
 
 		 188 aa  41.6  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3388  hypothetical protein  29.17 
 
 		 116 aa  41.2  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03903  hypothetical protein  27.75 
 
 		 188 aa  41.6  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4316  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  27.75 
 
 		 188 aa  41.6  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4627  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  27.75 
 
 		 188 aa  41.6  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5576  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  27.75 
 
 		 188 aa  41.6  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03943  nitrite reductase, formate-dependent, penta-heme cytochrome c  27.75 
 
 		 188 aa  41.6  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3956  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  27.59 
 
 		 188 aa  41.2  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4533  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  27.59 
 
 		 188 aa  41.2  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4592  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  27.59 
 
 		 188 aa  41.2  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0014  hypothetical protein  26.27 
 
 		 670 aa  41.2  0.009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>