195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3527 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3527  major facilitator transporter  100 
 
 		 390 aa  767    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1617  major facilitator superfamily MFS_1  41.58 
 
 		 396 aa  258  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000010959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1519  major facilitator transporter  41.95 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.496216 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  36.01 
 
 		 402 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1226  major facilitator transporter  37.43 
 
 		 391 aa  192  8e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.184807  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2632  major facilitator transporter  33.93 
 
 		 403 aa  190  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224364  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0656  fosmidomycin resistance protein  33.16 
 
 		 403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.231636  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0649  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 403 aa  182  8.000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2341  major facilitator superfamily MFS_1  31.31 
 
 		 417 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1690  major facilitator transporter  34.47 
 
 		 403 aa  179  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  31.76 
 
 		 410 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1696  fosmidomycin resistance protein  34.94 
 
 		 403 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00774427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1677  fosmidomycin resistance protein  34.94 
 
 		 403 aa  178  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0817289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1652  fosmidomycin resistance protein  34.94 
 
 		 403 aa  178  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000459515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1830  fosmidomycin resistance protein  34.94 
 
 		 403 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1918  fosmidomycin resistance protein  34.94 
 
 		 403 aa  177  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.243949  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1836  fosmidomycin resistance protein  34.98 
 
 		 403 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1874  fosmidomycin resistance protein  35.34 
 
 		 403 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194019 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1953  fosmidomycin resistance protein  34.94 
 
 		 403 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1794  Xaa-Pro dipeptidase  33.07 
 
 		 389 aa  177  3e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1437  major facilitator transporter  33.67 
 
 		 402 aa  177  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3507  fosmidomycin resistance protein  35.34 
 
 		 403 aa  176  8e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 401 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1116  major facilitator superfamily MFS_1  32.12 
 
 		 410 aa  173  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.298595 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3837  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 415 aa  173  5.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2924  major facilitator superfamily MFS_1  33.95 
 
 		 388 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.755065  normal  0.842149 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1857  major facilitator superfamily MFS_1  33.6 
 
 		 408 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0541564  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0282  major facilitator superfamily MFS_1  33.6 
 
 		 421 aa  170  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2437  major facilitator superfamily MFS_1  32.64 
 
 		 396 aa  170  5e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5829  major facilitator transporter  32.22 
 
 		 422 aa  170  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.50804  normal  0.878008 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0645  major facilitator transporter  32.96 
 
 		 382 aa  168  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080187  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3329  major facilitator transporter  32.02 
 
 		 410 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.707628 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0720  major facilitator transporter  32.98 
 
 		 403 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588429 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0701  MFS efflux transporter, putative  34.92 
 
 		 404 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1478  major facilitator superfamily MFS_1  32.82 
 
 		 402 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0735  major facilitator transporter  34.92 
 
 		 404 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0734  major facilitator transporter  34.76 
 
 		 404 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0156  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 		 408 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0962  major facilitator transporter  33.68 
 
 		 412 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1444  major facilitator transporter  33.68 
 
 		 412 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1422  major facilitator transporter  33.68 
 
 		 412 aa  163  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4483  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 403 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.706987 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1603  major facilitator superfamily MFS_1  34.66 
 
 		 399 aa  161  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0711095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0367  permease  30.48 
 
 		 412 aa  160  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.32941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2630  fosmidomycin resistance protein  31.32 
 
 		 420 aa  160  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4112  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 397 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0806371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1365  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 412 aa  159  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.399503 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6092  major facilitator superfamily MFS_1  32.65 
 
 		 400 aa  159  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1326  major facilitator transporter  33.68 
 
 		 412 aa  159  9e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686197  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4588  major facilitator transporter  33.68 
 
 		 412 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0213  major facilitator superfamily MFS_1  36.2 
 
 		 398 aa  159  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0670  ProP protein  32.47 
 
 		 386 aa  157  2e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1871  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 413 aa  158  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.565485  hitchhiker  0.00660368 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4757  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 405 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54337  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2366  antibiotic MFS transporter, putative  31.5 
 
 		 420 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0817  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 		 401 aa  157  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3431  major facilitator superfamily MFS_1  34.51 
 
 		 404 aa  157  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00698685  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2972  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 422 aa  156  7e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3799  fosmidomycin resistance protein  32.89 
 
 		 402 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.319996  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1587  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 412 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2124  major facilitator superfamily transporter  33.25 
 
 		 431 aa  155  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204693  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1681  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 402 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1115  major facilitator transporter  32.18 
 
 		 415 aa  155  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6505  major facilitator superfamily MFS_1  32.41 
 
 		 400 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0724  XRE family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 406 aa  155  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0248517  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0930  fosmidomycin resistance protein  30.75 
 
 		 416 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1849  fosmidomycin resistance protein  30.75 
 
 		 417 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1308  major facilitator transporter  34.13 
 
 		 420 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120753  normal  0.191945 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1463  fosmidomycin resistance protein  30.75 
 
 		 416 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1672  fosmidomycin resistance protein  30.75 
 
 		 417 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1694  fosmidomycin resistance protein  30.75 
 
 		 417 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511968  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1645  major facilitator superfamily MFS_1  31.94 
 
 		 403 aa  151  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.849012  hitchhiker  0.000565509 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1977  fosmidomycin resistance protein, putative  31.94 
 
 		 403 aa  151  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85297  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4107  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 404 aa  150  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266046  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0474  major facilitator transporter  31.7 
 
 		 398 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1146  major facilitator transporter  32.89 
 
 		 406 aa  150  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155488  unclonable  0.000000029988 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2084  major facilitator superfamily MFS_1  34.2 
 
 		 395 aa  150  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.942608 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0419  fosmidomycin resistance protein  30.48 
 
 		 416 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.423949  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0744  fosmidomycin resistance protein  30.48 
 
 		 416 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944019  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0216  hypothetical protein  27.78 
 
 		 393 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3923  major facilitator superfamily MFS_1  31.93 
 
 		 418 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3577  hypothetical protein  27.2 
 
 		 421 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.972735  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0137  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 		 420 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0222229  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3913  major facilitator transporter  33.69 
 
 		 421 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4835  major facilitator transporter  33.6 
 
 		 403 aa  147  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4717  major facilitator superfamily MFS_1  32.19 
 
 		 410 aa  146  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521537 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3640  major facilitator superfamily MFS_1  32.19 
 
 		 410 aa  146  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2794  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 419 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572754  normal  0.513078 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0958  major facilitator transporter  31.41 
 
 		 406 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00430  predicted fosmidomycin efflux system  32.71 
 
 		 406 aa  144  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00435  hypothetical protein  32.71 
 
 		 406 aa  144  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1603  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 		 408 aa  144  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0412  putative fosmidomycin resistance antibiotic resistance transmembrane protein  30.55 
 
 		 411 aa  143  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22156  normal  0.519743 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2007  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 423 aa  144  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.28785 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1340  major facilitator superfamily multidrug (fosmidomycin) efflux transporter  32.36 
 
 		 420 aa  144  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2852  major facilitator superfamily MFS_1  32.62 
 
 		 371 aa  143  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0477779  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4797  major facilitator superfamily MFS_1  33.69 
 
 		 421 aa  143  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.292232  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0523  fosmidomycin resistance protein  32.71 
 
 		 406 aa  142  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0571  fosmidomycin resistance protein  32.71 
 
 		 406 aa  142  7e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.652835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3137  major facilitator transporter  32.71 
 
 		 406 aa  142  8e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.546423  hitchhiker  0.000000426482 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>