50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1725 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1725  glutamate synthase (NADPH)  100 
 
 		 376 aa  777    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.886544 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0385  glutamate synthase (NADPH)  72.39 
 
 		 376 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2274  glutamate synthase (NADPH)  69.25 
 
 		 376 aa  571  1.0000000000000001e-162  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1372  glutamate synthase (NADPH)  65.33 
 
 		 376 aa  543  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244449  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2387  glutamate synthase (NADPH)  65.95 
 
 		 375 aa  526  1e-148  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1375  hypothetical protein  64.34 
 
 		 376 aa  526  1e-148  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.157806  normal  0.645032 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0104  hypothetical protein  64.34 
 
 		 375 aa  511  1e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.765688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2161  hypothetical protein  39.39 
 
 		 368 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1155  putative glutamate synthase, large subunit (domain 1)  39.89 
 
 		 368 aa  272  8.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.321075  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2598  glutamate synthase large subunit  39.39 
 
 		 368 aa  267  2e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1293  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  27.85 
 
 		 368 aa  75.5  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303282 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  32.99 
 
 		 659 aa  72.4  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0558  glutamine amidotransferase, class-II  29.74 
 
 		 374 aa  70.5  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2136  glutamine amidotransferase, class-II  25.87 
 
 		 382 aa  68.2  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16310  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  25.45 
 
 		 355 aa  68.6  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000470863  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0780  glutamine amidotransferase, class-II  26.34 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0619068  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0545  glutamine amidotransferase class-II  25.57 
 
 		 369 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405824 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1300  glutamine amidotransferase class-II  24.32 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0536  glutamine amidotransferase class-II  24.88 
 
 		 372 aa  63.9  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2026  glutamine amidotransferase, class-II  25.69 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.805771  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0665  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  22.59 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0522  glutamine amidotransferase, class-II  24.88 
 
 		 395 aa  63.9  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1092  glutamine amidotransferase class-II  23.5 
 
 		 363 aa  63.5  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  30.49 
 
 		 670 aa  63.5  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0334  glutamine amidotransferase, class-II  25.34 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892096  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1815  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  23.26 
 
 		 364 aa  63.5  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0197  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  22.71 
 
 		 363 aa  62.8  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.480827  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0213  glutamine amidotransferase, class-II  24.15 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0869  glutamine amidotransferase class-II  23.5 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0521916  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_948  glutamine amidotransferase, class II  24.15 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.155092  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1078  glutamine amidotransferase class-II  23.96 
 
 		 363 aa  62  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.46258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0959  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  24.64 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315043  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2710  glutamine amidotransferase class-II  26.2 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  27.98 
 
 		 646 aa  61.2  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1236  hypothetical protein  22.69 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1598  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  23.5 
 
 		 363 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1338  glutamine amidotransferase, class-II  24.88 
 
 		 364 aa  59.7  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.845818 
 
 
-
 
NC_002936  DET1130  glutamine amidotransferase, class II  23.67 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1690  glutamine amidotransferase, class-II  25 
 
 		 349 aa  56.2  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.491949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2361  glutamine amidotransferase class-II  24.4 
 
 		 364 aa  56.2  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.595667  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1753  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  24.71 
 
 		 373 aa  54.3  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0025  glutamine amidotransferase class-II  22.86 
 
 		 365 aa  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2491  glutamine amidotransferase, class-II  22.99 
 
 		 371 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0138  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  20.98 
 
 		 612 aa  49.3  0.0001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.266568  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2499  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  24.11 
 
 		 305 aa  45.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0705172  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4173  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  26 
 
 		 609 aa  43.5  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1389  amidophosphoribosyltransferase  26.34 
 
 		 479 aa  43.5  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.254172  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1910  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  33.77 
 
 		 608 aa  43.5  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0701162  normal  0.896342 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4229  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  26 
 
 		 609 aa  43.1  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4199  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  26 
 
 		 609 aa  43.1  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.118902  normal  0.122608 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>