More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3473 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3473  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 319 aa  642    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  64.26 
 
 		 299 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  64 
 
 		 316 aa  355  5.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  64.6 
 
 		 299 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  64 
 
 		 316 aa  355  5.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  57.43 
 
 		 301 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  57.43 
 
 		 301 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  57.43 
 
 		 301 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  57.43 
 
 		 301 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  58.54 
 
 		 312 aa  329  3e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  55.37 
 
 		 300 aa  322  6e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  55.37 
 
 		 300 aa  322  6e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  56.23 
 
 		 326 aa  314  9.999999999999999e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  55.03 
 
 		 304 aa  314  9.999999999999999e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0498  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  58.62 
 
 		 297 aa  299  5e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0501  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  58.62 
 
 		 297 aa  298  9e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0340413  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  52.8 
 
 		 297 aa  290  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  48.91 
 
 		 305 aa  266  5e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  48.62 
 
 		 305 aa  265  8.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 		 313 aa  261  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  56.18 
 
 		 299 aa  261  2e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  48.38 
 
 		 305 aa  260  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  45.3 
 
 		 302 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  44.2 
 
 		 305 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  44.2 
 
 		 305 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  45.8 
 
 		 299 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0184  cation diffusion facilitator family transporter  45.36 
 
 		 304 aa  228  7e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.421209  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  39.16 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  42.01 
 
 		 305 aa  226  4e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  43.17 
 
 		 327 aa  226  5.0000000000000005e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  38.59 
 
 		 299 aa  225  6e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30010  cation diffusion facilitator family transporter  46.21 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000713084  normal  0.287518 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  38.81 
 
 		 299 aa  224  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  39.51 
 
 		 299 aa  222  7e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0171  cation diffusion facilitator family transporter  42.57 
 
 		 307 aa  219  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6162  cation diffusion facilitator family transporter  46.1 
 
 		 309 aa  219  6e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  42.81 
 
 		 304 aa  219  6e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  41.13 
 
 		 298 aa  219  7e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3631  cation diffusion facilitator family transporter  43.75 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.492249  decreased coverage  0.00000526062 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  37.81 
 
 		 342 aa  218  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  38.16 
 
 		 315 aa  216  4e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  40.41 
 
 		 331 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  38.26 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2216  cation diffusion facilitator family transporter  43.75 
 
 		 305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  44.36 
 
 		 306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  42.75 
 
 		 309 aa  212  7e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  39.16 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  39.16 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  38.01 
 
 		 326 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  38.81 
 
 		 299 aa  210  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  38.46 
 
 		 299 aa  209  5e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  39.3 
 
 		 334 aa  209  6e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  38.81 
 
 		 295 aa  208  8e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  39.03 
 
 		 314 aa  208  9e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1148  cation diffusion facilitator family transporter  37.62 
 
 		 340 aa  206  4e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280865  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  37.21 
 
 		 311 aa  205  8e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  39.22 
 
 		 307 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13910  cation diffusion facilitator family transporter  41.58 
 
 		 303 aa  204  2e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  39.8 
 
 		 312 aa  203  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3234  cation diffusion facilitator family transporter  36.18 
 
 		 323 aa  203  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.34559  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2300  cation efflux protein  44.16 
 
 		 300 aa  202  5e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4903  cation diffusion facilitator family transporter  42.41 
 
 		 308 aa  202  9e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1370  cation diffusion facilitator family transporter  39.12 
 
 		 333 aa  201  9e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3011  cation diffusion facilitator family transporter  37.25 
 
 		 347 aa  201  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  38.3 
 
 		 315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  39.86 
 
 		 327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  39.66 
 
 		 308 aa  200  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  38.61 
 
 		 310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4570  cation diffusion facilitator family transporter  40.5 
 
 		 340 aa  199  7e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3226  cation diffusion facilitator family transporter  37.24 
 
 		 352 aa  199  7e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0610  cation diffusion facilitator family transporter  43.21 
 
 		 306 aa  198  9e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049806 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  42.71 
 
 		 300 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  39.55 
 
 		 312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  36.17 
 
 		 316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  39.59 
 
 		 310 aa  196  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  36.46 
 
 		 300 aa  196  5.000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0452  cation diffusion facilitator family transporter  39.86 
 
 		 309 aa  196  5.000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0402588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0868  cation diffusion facilitator family transporter  39.21 
 
 		 309 aa  196  5.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4276  cation efflux protein  40.91 
 
 		 325 aa  195  9e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  39.25 
 
 		 325 aa  194  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4118  cation diffusion facilitator family transporter  40.91 
 
 		 325 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  37.86 
 
 		 317 aa  194  1e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0425  cation diffusion facilitator family transporter  44.11 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  39.58 
 
 		 314 aa  192  5e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4544  cation diffusion facilitator family transporter  42.91 
 
 		 356 aa  192  5e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.586592 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  40.14 
 
 		 306 aa  192  6e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3783  cation diffusion facilitator family transporter  39.31 
 
 		 341 aa  191  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4059  cation diffusion facilitator family transporter  40.21 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.552828  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  40 
 
 		 312 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  40 
 
 		 312 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  37.24 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4444  cation diffusion facilitator family transporter  40.62 
 
 		 305 aa  190  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  40.59 
 
 		 378 aa  191  2e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  39.32 
 
 		 325 aa  191  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  40.54 
 
 		 312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  40 
 
 		 312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  39.68 
 
 		 312 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1344  cation diffusion facilitator family transporter  43.2 
 
 		 307 aa  188  8e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.123489  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  35.36 
 
 		 298 aa  189  8e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2050  cation diffusion facilitator family transporter  39.11 
 
 		 333 aa  188  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.347484  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>