42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1123 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A1123  side tail fiber protein  100 
 
 		 569 aa  1170    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1090  side tail fiber protein  98.39 
 
 		 463 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  96.13 
 
 		 805 aa  634  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  97.24 
 
 		 790 aa  601  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1160  side tail fiber protein  94.5 
 
 		 791 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0463923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  80.23 
 
 		 442 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  59.52 
 
 		 1007 aa  372  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2098  Tail Collar domain protein  59.06 
 
 		 320 aa  325  1e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0113464  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0833  phage tail collar domain-containing protein  58.1 
 
 		 281 aa  292  1e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  73.3 
 
 		 580 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  58.54 
 
 		 1120 aa  254  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  56.27 
 
 		 1137 aa  248  3e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0873  side tail fiber protein  55.89 
 
 		 441 aa  239  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1643  prophage tail fibre domain protein  58.33 
 
 		 516 aa  232  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1478  phage protein  54.88 
 
 		 536 aa  223  8e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  47.84 
 
 		 962 aa  215  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00848  bacteriophage tail fiber protein  30.73 
 
 		 179 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00854  hypothetical protein  30.73 
 
 		 180 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1819  Tail Collar domain protein  31.35 
 
 		 166 aa  68.2  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.597378  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1051  hypothetical protein  39.18 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2731  tail collar domain-containing protein  30.57 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  38.32 
 
 		 682 aa  67  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  27.88 
 
 		 621 aa  66.6  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  30.81 
 
 		 498 aa  65.1  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1476  tail collar domain-containing protein  30.69 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.736982 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  47.83 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  32.56 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  47.76 
 
 		 485 aa  63.9  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2492  Tail Collar domain protein  30.57 
 
 		 262 aa  62  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136013  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  47.76 
 
 		 557 aa  61.6  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  29.08 
 
 		 689 aa  61.6  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  50.98 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  50 
 
 		 646 aa  59.7  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2758  tail collar domain-containing protein  33.68 
 
 		 177 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2198  tail collar domain-containing protein  34.29 
 
 		 402 aa  53.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23854  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3032  tail Collar domain protein  32.63 
 
 		 176 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835332 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2097  Tail Collar domain protein  45.1 
 
 		 183 aa  53.5  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1817  Tail Collar domain protein  43.14 
 
 		 196 aa  52.4  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.386449  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0636  Tail Collar domain protein  37.84 
 
 		 144 aa  49.3  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266713  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0238  hypothetical protein  24.86 
 
 		 323 aa  48.1  0.0004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0701154  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4483  probable phage tail fiber protein  43.4 
 
 		 364 aa  47.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00832813 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2023  tail fibre assembly protein  100 
 
 		 293 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0278369 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>