124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2707 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  100 
 
 		 515 aa  1070    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  77.14 
 
 		 507 aa  837    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2941  tryptophan halogenase  69.76 
 
 		 511 aa  750    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3120  tryptophan halogenase  68.91 
 
 		 510 aa  746    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  62.65 
 
 		 507 aa  680    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  51.49 
 
 		 507 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  50.4 
 
 		 508 aa  502  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  54.98 
 
 		 507 aa  498  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  51.39 
 
 		 507 aa  501  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  49.3 
 
 		 508 aa  499  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  49.4 
 
 		 508 aa  490  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2293  tryptophan halogenase  43.98 
 
 		 537 aa  428  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  42.57 
 
 		 513 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  42.77 
 
 		 513 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  42.77 
 
 		 513 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  41.26 
 
 		 526 aa  384  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1262  tryptophan halogenase, putative  37.01 
 
 		 524 aa  372  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.69859  hitchhiker  0.00000259242 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  37.92 
 
 		 508 aa  366  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  38.42 
 
 		 524 aa  368  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  41.34 
 
 		 514 aa  368  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  39.27 
 
 		 514 aa  363  6e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1143  tryptophan halogenase  37.33 
 
 		 528 aa  360  3e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1312  tryptophan halogenase  36.54 
 
 		 525 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  40.47 
 
 		 524 aa  355  1e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  38.53 
 
 		 517 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  39.35 
 
 		 532 aa  353  5e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  40.7 
 
 		 524 aa  352  8e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  37.6 
 
 		 522 aa  348  1e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  39.17 
 
 		 527 aa  343  5e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1179  tryptophan halogenase  35.98 
 
 		 543 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0239  putative tryptophan halogenase  35.24 
 
 		 537 aa  340  2.9999999999999998e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3178  tryptophan halogenase  35.98 
 
 		 543 aa  339  9e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0464622 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3276  tryptophan halogenase  37.8 
 
 		 520 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.698237  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1124  tryptophan halogenase  35.61 
 
 		 543 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0915  tryptophan halogenase  38.11 
 
 		 505 aa  336  7e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1212  tryptophan halogenase  36.36 
 
 		 543 aa  335  9e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  36.02 
 
 		 522 aa  334  2e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  38.01 
 
 		 513 aa  332  1e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1023  putative tryptophan halogenase  40.43 
 
 		 518 aa  325  8.000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1105  ATPase  36.63 
 
 		 517 aa  318  1e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1398  hypothetical protein  34.94 
 
 		 520 aa  313  6.999999999999999e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000535244 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1964  tryptophan halogenase  35.81 
 
 		 531 aa  312  9e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  32.77 
 
 		 529 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  33.27 
 
 		 505 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  32.77 
 
 		 529 aa  253  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  35.89 
 
 		 498 aa  249  6e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  32.68 
 
 		 508 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  32.87 
 
 		 508 aa  249  7e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  37.86 
 
 		 506 aa  248  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  34.27 
 
 		 501 aa  246  9e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  34.28 
 
 		 501 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  32.34 
 
 		 507 aa  243  9e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  32.83 
 
 		 538 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  36.66 
 
 		 498 aa  241  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  35.58 
 
 		 517 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  32.83 
 
 		 538 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  32.83 
 
 		 538 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  32.83 
 
 		 538 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  32.47 
 
 		 538 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  31.97 
 
 		 538 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  32.94 
 
 		 502 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  32.75 
 
 		 504 aa  233  7.000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  32.61 
 
 		 504 aa  231  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  32.18 
 
 		 501 aa  230  4e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  33.47 
 
 		 501 aa  230  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1409  tryptophan halogenase  33.53 
 
 		 501 aa  230  6e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  30.28 
 
 		 537 aa  229  7e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1436  tryptophan halogenase  34.39 
 
 		 499 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.333804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2945  tryptophan halogenase  33.2 
 
 		 501 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  36.04 
 
 		 502 aa  227  4e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1400  tryptophan halogenase  31.71 
 
 		 503 aa  226  6e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  33.33 
 
 		 740 aa  226  7e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  34.12 
 
 		 494 aa  225  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  32.55 
 
 		 499 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  31.42 
 
 		 506 aa  225  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  34.06 
 
 		 495 aa  224  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  34 
 
 		 497 aa  225  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  31.84 
 
 		 502 aa  224  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  34.47 
 
 		 505 aa  224  4e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  35.37 
 
 		 510 aa  224  4e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  31.91 
 
 		 499 aa  223  6e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  32.36 
 
 		 499 aa  223  7e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  33.69 
 
 		 512 aa  223  9e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  33.98 
 
 		 496 aa  222  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  33.08 
 
 		 506 aa  222  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  32.47 
 
 		 492 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  32.41 
 
 		 496 aa  220  5e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  30.24 
 
 		 497 aa  219  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  34.23 
 
 		 501 aa  217  4e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  32.81 
 
 		 497 aa  217  4e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  34.75 
 
 		 503 aa  216  5.9999999999999996e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  30.49 
 
 		 505 aa  215  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  31.76 
 
 		 502 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  33.76 
 
 		 507 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  33.55 
 
 		 503 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  33.55 
 
 		 503 aa  213  7e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  33.55 
 
 		 503 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  31.12 
 
 		 510 aa  213  9e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  31.56 
 
 		 500 aa  213  9e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  33.33 
 
 		 503 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>