More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1740 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1740  Sel1 domain protein repeat-containing protein  100 
 
 
231 aa  471  1e-132  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000963659  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.32 
 
 
282 aa  132  3e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.71 
 
 
487 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1876  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  38.31 
 
 
273 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0146933  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  33.51 
 
 
1493 aa  112  4.0000000000000004e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  33.33 
 
 
684 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.9 
 
 
318 aa  109  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  35.78 
 
 
1402 aa  109  3e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  31.88 
 
 
305 aa  108  8.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  34.18 
 
 
490 aa  107  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  34.18 
 
 
490 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  30.2 
 
 
831 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  33.51 
 
 
373 aa  106  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 
252 aa  105  7e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  32.98 
 
 
373 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  32.28 
 
 
232 aa  104  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0462  hypothetical protein  30.47 
 
 
234 aa  103  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.623472  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0019  Hsp12 variant C  28.88 
 
 
209 aa  103  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1388  conserved hypothetical protein, tetratricopeptide repeat domain protein family  37.66 
 
 
184 aa  103  3e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  33.17 
 
 
557 aa  102  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  32.63 
 
 
393 aa  102  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  31.51 
 
 
789 aa  101  9e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1544  hypothetical protein  28.63 
 
 
234 aa  101  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.72263  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  31.66 
 
 
464 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0015  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.92 
 
 
209 aa  97.8  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.492258  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0437  hypothetical protein  28.22 
 
 
234 aa  98.2  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  32.98 
 
 
961 aa  97.4  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.63 
 
 
392 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  32.16 
 
 
1032 aa  96.3  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  31.91 
 
 
489 aa  95.1  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  29.95 
 
 
523 aa  93.6  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  31 
 
 
1037 aa  92.4  6e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6892  Sel1 repeat-containing protein  31.84 
 
 
363 aa  91.3  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  29.95 
 
 
685 aa  91.3  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  30.99 
 
 
235 aa  89.4  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  31.58 
 
 
208 aa  88.6  7e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  32.12 
 
 
425 aa  88.6  8e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2180  Sel1 repeat-containing protein  27.51 
 
 
319 aa  88.6  8e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0570627  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.8 
 
 
316 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  30.51 
 
 
448 aa  86.7  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.38 
 
 
341 aa  85.9  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0323  beta-lactamase HcpA  36.03 
 
 
179 aa  85.9  5e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.742387  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0736  beta-lactamase HcpA  31.08 
 
 
227 aa  85.9  5e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.519148  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.1 
 
 
343 aa  85.1  8e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  26.25 
 
 
303 aa  84.7  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  29.15 
 
 
416 aa  84.3  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  26.07 
 
 
264 aa  84.3  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  33.55 
 
 
223 aa  84.7  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  26.92 
 
 
376 aa  83.6  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1251  hypothetical protein  28.04 
 
 
985 aa  82.8  0.000000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  26.5 
 
 
376 aa  82  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  32.63 
 
 
1002 aa  82  0.000000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  29.59 
 
 
2413 aa  81.6  0.000000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  26.32 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1693  putative beta-lactamase HcpC (cysteine-richprotein C)  23.51 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  29.08 
 
 
245 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  29.12 
 
 
256 aa  80.1  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  28.86 
 
 
331 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0951  hypothetical protein  27.15 
 
 
1141 aa  78.6  0.00000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.33 
 
 
346 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0544  hypothetical protein  26.9 
 
 
1134 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.142127 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.69 
 
 
798 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  30 
 
 
482 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  28.14 
 
 
271 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.06 
 
 
380 aa  77.8  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  24.05 
 
 
1877 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  29.17 
 
 
971 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.63 
 
 
865 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  29.95 
 
 
552 aa  76.3  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  26.84 
 
 
731 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2768  Sel1 domain-containing protein  30.73 
 
 
403 aa  76.6  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.17 
 
 
971 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  29.21 
 
 
509 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  29.21 
 
 
509 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  34.56 
 
 
246 aa  75.9  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  29.21 
 
 
509 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  29.21 
 
 
509 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  31.11 
 
 
380 aa  75.5  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0247  CoA-binding domain-containing protein  30.38 
 
 
221 aa  75.1  0.0000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.19 
 
 
278 aa  75.1  0.0000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  27.78 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  28.49 
 
 
850 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  29.56 
 
 
254 aa  73.6  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  31.39 
 
 
181 aa  73.6  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  28.95 
 
 
1200 aa  72.8  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0589  Sel1 repeat-containing protein  31.29 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  25.63 
 
 
976 aa  72.8  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  28.95 
 
 
1200 aa  72.8  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  28.32 
 
 
304 aa  72  0.000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.29 
 
 
528 aa  71.6  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  24.74 
 
 
679 aa  71.2  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1951  serine/threonine protein kinase  28.82 
 
 
705 aa  71.6  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0868123  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  28.99 
 
 
838 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4028  Sel1 domain-containing protein  32.39 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.530844  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  28.32 
 
 
342 aa  69.7  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  26.77 
 
 
325 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  30.66 
 
 
358 aa  68.9  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  26.42 
 
 
327 aa  68.9  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.28 
 
 
255 aa  68.6  0.00000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  25.96 
 
 
359 aa  68.6  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>