More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1024 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1024  protein of unknown function UPF0079  100 
 
 		 143 aa  292  1e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.91996  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1981  hypothetical protein  49.09 
 
 		 134 aa  117  4.9999999999999996e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1238  hypothetical protein  46.09 
 
 		 132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0752  conserved hypothetical protein (UPF0079 domain protein)  43.9 
 
 		 135 aa  110  8.000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1150  hypothetical protein  42.98 
 
 		 137 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.864213  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0769  hypothetical protein  45.54 
 
 		 135 aa  107  5e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0851  hypothetical protein  44.44 
 
 		 133 aa  107  7.000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00201789  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0694  hypothetical protein  44.64 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1331  hypothetical protein  44.64 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1067  hypothetical protein  41.32 
 
 		 136 aa  105  2e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0374  protein of unknown function UPF0079  28.67 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  44.9 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  39.13 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  37.62 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  32.33 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  38.14 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  39.78 
 
 		 157 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  39.78 
 
 		 157 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  39.78 
 
 		 157 aa  67  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  39.78 
 
 		 157 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  38.04 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  38.38 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  39.13 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  38.71 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  38.71 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  39.53 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  38.71 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1469  hypothetical protein  43.04 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  34.65 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  33.09 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  34.75 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  41.77 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  35.64 
 
 		 184 aa  63.9  0.0000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  41.77 
 
 		 161 aa  63.5  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  43.59 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  34.07 
 
 		 158 aa  62  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  33.33 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  40 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0346  hypothetical protein  46.25 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0631  hypothetical protein  36.7 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.40036 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  39.82 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  34.44 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0961  hypothetical protein  43.9 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  hitchhiker  0.00154455 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  33.58 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  33.58 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0927  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.641059 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17521  ATPase or kinase  44.74 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1296  hypothetical protein  35.71 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0433075  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1159  hypothetical protein  35.71 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147113  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0121  hypothetical protein  36.7 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  37.89 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0376  hypothetical protein  31.78 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  35.11 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  36.56 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11800  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  39.51 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4961  protein of unknown function UPF0079  34.74 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.595052 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0033  protein of unknown function UPF0079  32.08 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4283  protein of unknown function UPF0079  32.35 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  36.25 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2993  protein of unknown function UPF0079  33.01 
 
 		 140 aa  57  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.093768  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3084  protein of unknown function UPF0079  35.11 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0940  ATPase, YjeE family  33.54 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00645  ATP/GTP hydrolase  28.37 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0145  hypothetical protein  40.26 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550915  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3974  hypothetical protein  34.57 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  32.71 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10268  putative ATP/GTP-binding transmembrane protein  33.75 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.636106  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4950  hypothetical protein  34.44 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.070486  normal  0.198333 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0117  protein of unknown function UPF0079  37.76 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  32.98 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1604  protein of unknown function UPF0079  28.97 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4689  hypothetical protein  33.71 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2157  hypothetical protein  47.27 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0519  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0120244  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2465  protein of unknown function UPF0079  37.61 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0181492 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  29.84 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2896  protein of unknown function UPF0079  45.45 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.166162  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  29.84 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1300  hypothetical protein  29 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0581872  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2408  protein of unknown function UPF0079  37.61 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0266  hypothetical protein  30.48 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.0000898958  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  40.54 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2842  hypothetical protein  35.11 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.523389 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4898  hypothetical protein  30.4 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.44547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4774  hypothetical protein  30.4 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.431591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01741  ATPase or kinase  50 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2639  protein of unknown function UPF0079  42.65 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.266416 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07500  ATPase, with role in cell wall biosynthesis  29.85 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0487  hypothetical protein  33.71 
 
 		 148 aa  53.5  0.0000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  36.05 
 
 		 153 aa  53.5  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  33 
 
 		 167 aa  53.5  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1157  hypothetical protein  35.92 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2018  protein of unknown function UPF0079  32.18 
 
 		 175 aa  53.5  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00181  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0333  putative ATPase  32.28 
 
 		 188 aa  53.1  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.825022  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2026  hypothetical protein  30.7 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  31.73 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  33.33 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1171  hypothetical protein  28.89 
 
 		 172 aa  52.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00361416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1492  hypothetical protein  35.85 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>