More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0591 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0591  excinuclease ABC, C subunit  100 
 
 
599 aa  1222    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0418  excinuclease ABC subunit C  49.15 
 
 
600 aa  562  1.0000000000000001e-159  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0641  excinuclease ABC subunit C  47.19 
 
 
607 aa  557  1e-157  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.901377  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0498  excinuclease ABC subunit C  47.33 
 
 
597 aa  535  1e-151  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1266  excinuclease ABC subunit C  46 
 
 
602 aa  536  1e-151  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1559  excinuclease ABC subunit C  44.89 
 
 
605 aa  525  1e-148  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0480  excinuclease ABC subunit C  47.17 
 
 
600 aa  522  1e-147  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.867609  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1261  excinuclease ABC subunit C  47 
 
 
600 aa  523  1e-147  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1382  excinuclease ABC subunit C  47 
 
 
600 aa  518  1e-146  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0936  excinuclease ABC subunit C  45.64 
 
 
607 aa  516  1.0000000000000001e-145  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0772  excinuclease ABC subunit C  34.75 
 
 
633 aa  318  1e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00962744  normal  0.347624 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  34.09 
 
 
610 aa  317  3e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4491  excinuclease ABC subunit C  35.03 
 
 
642 aa  313  7.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.191027 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  33.86 
 
 
629 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  33.97 
 
 
619 aa  310  6.999999999999999e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  33.55 
 
 
613 aa  308  1.0000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1060  excinuclease ABC subunit C  33.39 
 
 
658 aa  309  1.0000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.41739  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  32.86 
 
 
628 aa  307  4.0000000000000004e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  33.93 
 
 
627 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1177  excinuclease ABC subunit C  34.3 
 
 
695 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.8668  normal  0.100977 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1281  excinuclease ABC subunit C  33.66 
 
 
695 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.280524  normal  0.136737 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  34.24 
 
 
615 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4046  excinuclease ABC subunit C  35.26 
 
 
649 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  33.33 
 
 
614 aa  303  8.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3146  excinuclease ABC subunit C  34.09 
 
 
690 aa  301  2e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.055346  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1082  excinuclease ABC subunit C  33.88 
 
 
644 aa  301  2e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0901  excinuclease ABC subunit C  34.19 
 
 
699 aa  301  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.686054  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3961  excinuclease ABC subunit C  34.93 
 
 
623 aa  301  3e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00581214  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  33.33 
 
 
612 aa  300  4e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2526  excinuclease ABC subunit C  34.68 
 
 
666 aa  298  1e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0420  excinuclease ABC subunit C  33.01 
 
 
620 aa  298  1e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000882939  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  32.91 
 
 
631 aa  299  1e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2589  excinuclease ABC subunit C  33.22 
 
 
691 aa  298  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0718587  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  33.17 
 
 
607 aa  298  2e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3342  excinuclease ABC subunit C  32.91 
 
 
622 aa  298  2e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.991937  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  31.72 
 
 
601 aa  298  3e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  32.95 
 
 
617 aa  296  7e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  32.95 
 
 
617 aa  296  7e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1975  excinuclease ABC subunit C  32.62 
 
 
653 aa  296  7e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5405  excinuclease ABC, C subunit  31.68 
 
 
688 aa  296  7e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2276  excinuclease ABC, C subunit  32.84 
 
 
644 aa  296  7e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1074  excinuclease ABC subunit C  32.63 
 
 
623 aa  295  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.969621  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0516  excinuclease ABC subunit C  33.33 
 
 
658 aa  295  2e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2735  excinuclease ABC subunit C  32.63 
 
 
623 aa  295  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.0935486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  31.54 
 
 
708 aa  293  4e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0909  excinuclease ABC subunit C  32.91 
 
 
625 aa  293  4e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  31.46 
 
 
638 aa  293  6e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0690  excinuclease ABC subunit C  33.77 
 
 
690 aa  293  7e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.485523  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0782  excinuclease ABC subunit C  33.06 
 
 
674 aa  293  8e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191761  normal  0.0714693 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  31.28 
 
 
624 aa  293  9e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1086  excinuclease ABC subunit C  32.52 
 
 
680 aa  293  9e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000501867 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2520  excinuclease ABC subunit C  31.45 
 
 
635 aa  292  9e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  33.55 
 
 
607 aa  292  1e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  33.23 
 
 
615 aa  292  1e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0046  excinuclease ABC subunit C  33.94 
 
 
629 aa  292  1e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.714841  hitchhiker  0.00962006 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2652  excinuclease ABC, C subunit  33.72 
 
 
668 aa  292  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.18363 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3104  excinuclease ABC, C subunit  31.36 
 
 
682 aa  292  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.299342  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2878  excinuclease ABC, C subunit  31.36 
 
 
682 aa  292  1e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  34.05 
 
 
626 aa  291  2e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1362  excinuclease ABC subunit C  32.53 
 
 
704 aa  291  3e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0644  excinuclease ABC subunit C  33.55 
 
 
631 aa  291  3e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  34.29 
 
 
599 aa  291  3e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  32.94 
 
 
588 aa  291  3e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  31.35 
 
 
653 aa  290  4e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1712  excinuclease ABC, C subunit  32.96 
 
 
692 aa  290  4e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.254064 
 
 
-
 
NC_004310  BR0699  excinuclease ABC subunit C  33.61 
 
 
690 aa  290  5.0000000000000004e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2220  excinuclease ABC subunit C  33.72 
 
 
639 aa  290  7e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0021269  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  32.01 
 
 
624 aa  289  8e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1558  excinuclease ABC subunit C  32.37 
 
 
690 aa  289  9e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  32.85 
 
 
617 aa  289  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2859  excinuclease ABC subunit C  32.62 
 
 
623 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41177  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3713  excinuclease ABC, C subunit  33.22 
 
 
668 aa  288  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3001  excinuclease ABC, C subunit  31.05 
 
 
700 aa  287  4e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1728  excinuclease ABC subunit C  33.5 
 
 
688 aa  287  5e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0415792 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  32.37 
 
 
627 aa  286  5.999999999999999e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0579  excinuclease ABC subunit C  31.67 
 
 
604 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  33.06 
 
 
617 aa  286  8e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  32.51 
 
 
609 aa  286  9e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  32.89 
 
 
636 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  32.38 
 
 
628 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  31.25 
 
 
616 aa  284  3.0000000000000004e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1232  excinuclease ABC subunit C  32.52 
 
 
680 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000101228 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  30.73 
 
 
613 aa  283  7.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  32.42 
 
 
625 aa  283  8.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  31.26 
 
 
607 aa  282  1e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1945  excinuclease ABC subunit C  33.07 
 
 
643 aa  282  1e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.892148  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  31.67 
 
 
620 aa  282  1e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  31.81 
 
 
628 aa  282  1e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  31.51 
 
 
620 aa  281  2e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  33.22 
 
 
677 aa  282  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  30.68 
 
 
641 aa  279  1e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  31.64 
 
 
614 aa  278  1e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  31.29 
 
 
607 aa  278  2e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1270  excinuclease ABC subunit C  32.79 
 
 
610 aa  278  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000021646  hitchhiker  0.000709379 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2011  excinuclease ABC subunit C  32.79 
 
 
610 aa  277  3e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000678771  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1726  excinuclease ABC subunit C  32.95 
 
 
610 aa  277  3e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000100265  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2146  excinuclease ABC subunit C  32.79 
 
 
610 aa  277  3e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000023615  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2685  excinuclease ABC subunit C  32.79 
 
 
610 aa  277  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000130785  normal  0.0663039 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1040  excinuclease ABC subunit C  32.79 
 
 
610 aa  278  3e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000190411  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2161  excinuclease ABC subunit C  32.95 
 
 
610 aa  277  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138205  hitchhiker  0.0000000035589 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>