258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0409 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0409  flagellar biosynthetic protein FliR  100 
 
 
257 aa  489  1e-137  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  48.62 
 
 
255 aa  229  4e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.894574  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0547  flagellar biosynthesis protein FliR  50.2 
 
 
253 aa  228  7e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00458922  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1313  flagellar biosynthesis protein FliR  48.22 
 
 
255 aa  228  8e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.518612  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0550  flagellar biosynthesis protein FliR  48.22 
 
 
255 aa  227  1e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.826855  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1258  flagellar biosynthesis protein FliR  48.82 
 
 
253 aa  227  2e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0798452  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1091  flagellar biosynthesis protein FliR  50.6 
 
 
256 aa  227  2e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1798  flagellar biosynthesis protein FliR  47.2 
 
 
254 aa  226  4e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1438  flagellar biosynthesis protein FliR  47.27 
 
 
257 aa  223  2e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2033  flagellar biosynthesis protein FliR  31.03 
 
 
265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.468794  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  29.41 
 
 
259 aa  118  7.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1128  flagellar biosynthesis protein FliR  33.6 
 
 
257 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  30.53 
 
 
264 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  30.42 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  29.44 
 
 
265 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  26.97 
 
 
261 aa  112  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3822  flagellar biosynthetic protein FliR  27.39 
 
 
261 aa  111  9e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1750  flagellar biosynthetic protein FliR  28.34 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1675  flagellar biosynthesis protein FliR  28 
 
 
260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0788  flagellar biosynthesis protein FliR  29.63 
 
 
255 aa  109  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000389137  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  29.22 
 
 
255 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  24.6 
 
 
261 aa  106  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  29.36 
 
 
265 aa  105  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0091  flagellar biosynthetic protein FliR  30.7 
 
 
259 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3483  flagellar biosynthetic protein FliR  30 
 
 
259 aa  104  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1640  flagellar biosynthetic protein FliR  31.06 
 
 
253 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2155  flagellar biosynthetic protein FliR  27.98 
 
 
260 aa  103  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3986  flagellar biosynthetic protein FliR  27.97 
 
 
259 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0154  flagellar biosynthetic protein FliR  31.02 
 
 
263 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0867  flagellar biosynthetic protein FliR  30 
 
 
253 aa  99  7e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0068  flagellar biosynthetic protein FliR  27.85 
 
 
266 aa  98.2  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.981811  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2260  type III secretion system inner membrane R protein  29.3 
 
 
239 aa  97.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.311436  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1164  flagellar biosynthetic protein FliR  30.17 
 
 
258 aa  95.9  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2394  flagellar biosynthesis protein FliR  29.24 
 
 
255 aa  95.9  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  27.66 
 
 
263 aa  95.9  6e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  29.03 
 
 
247 aa  94.7  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  28.92 
 
 
257 aa  94.7  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0085  flagellar biosynthetic protein FliR  27.8 
 
 
257 aa  94.4  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.402163 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0378  flagellar biosynthetic protein FliR  29.91 
 
 
261 aa  94  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1697  flagellar biosynthesis protein FliR  28.87 
 
 
255 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.708349 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  24.89 
 
 
264 aa  93.2  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  27.06 
 
 
264 aa  92.8  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  27.56 
 
 
264 aa  92  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3473  flagellar biosynthetic protein FliR  30.1 
 
 
259 aa  92  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1136  flagellar biosynthesis protein FliR  26.78 
 
 
256 aa  90.9  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0065  flagellar protein FliR  30.21 
 
 
269 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  25.91 
 
 
261 aa  90.5  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1700  flagellar biosynthetic protein FliR  30.21 
 
 
269 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000123329 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1396  flagellar biosynthetic protein FliR  31.8 
 
 
257 aa  90.9  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1967  flagellar biosynthetic protein FliR  28.88 
 
 
261 aa  89.7  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5493  flagellar biosynthesis protein FliR  26.78 
 
 
255 aa  89.4  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209401  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  28.57 
 
 
261 aa  89.7  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0586  flagellar biosynthetic protein FliR  26.82 
 
 
260 aa  89  8e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  28.44 
 
 
260 aa  88.2  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2697  flagellar biosynthetic protein FliR  26.13 
 
 
255 aa  87  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2684  flagellar biosynthetic protein FliR  27.91 
 
 
260 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.648177  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0245  flagellar biosynthetic protein FliR  27.91 
 
 
260 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  27.06 
 
 
261 aa  87.4  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2693  flagellar biosynthetic protein FliR  27.91 
 
 
260 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3595  flagellar biosynthetic protein FliR  27.87 
 
 
259 aa  87.4  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1982  flagellar biosynthesis protein FliR  25.9 
 
 
261 aa  87.8  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.345887  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3268  flagellar biosynthetic protein FliR  27.91 
 
 
260 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  27.85 
 
 
258 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1859  flagellar biosynthetic protein FliR  27.91 
 
 
260 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.352593  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  27.91 
 
 
260 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  27.91 
 
 
260 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1521  flagellar biosynthesis protein FliR  29.83 
 
 
256 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0686482  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0032  flagellar biosynthetic protein FliR  27.44 
 
 
260 aa  86.3  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.413107  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  26.53 
 
 
260 aa  85.9  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  25.34 
 
 
261 aa  85.5  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0193  flagellar biosynthetic protein FliR  26.36 
 
 
263 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  26.7 
 
 
261 aa  85.1  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3773  flagellar biosynthesis protein FliR  27.2 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0733885  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3666  flagellar biosynthetic protein FliR  27.47 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  25.11 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  28 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2016  flagellar biosynthetic protein FliR  29.25 
 
 
264 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0038  flagellar biosynthetic protein FliR  27.87 
 
 
260 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  25.91 
 
 
253 aa  82.8  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  28.4 
 
 
267 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  29.15 
 
 
262 aa  82.4  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1138  flagellar biosynthesis protein FliR  27.65 
 
 
264 aa  82  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000910874  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2139  flagellar biosynthesis protein FliR  27.65 
 
 
264 aa  82  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19844  normal  0.226973 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2197  flagellar biosynthesis protein FliR  27.65 
 
 
264 aa  82  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103622  normal  0.587287 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2144  flagellar biosynthesis protein FliR  27.65 
 
 
264 aa  82  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0345603  hitchhiker  0.00457903 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  28.19 
 
 
260 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2924  flagellar biosynthetic protein FliR  25.82 
 
 
259 aa  81.3  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5534  flagellar biosynthetic protein FliR  24.79 
 
 
254 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  26.94 
 
 
260 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0850  flagellar biosynthetic protein FliR  24 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1751  flagellar biosynthetic protein fliR  28.14 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02875  flagellar biosynthesis protein FliR  25.65 
 
 
259 aa  80.1  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1261  flagellar biosynthesis protein FliR  27.4 
 
 
264 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0910889  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1513  flagellar biosynthesis protein FliR  25 
 
 
258 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.859445  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2160  flagellar biosynthesis protein FliR  23.04 
 
 
236 aa  79.7  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1317  flagellar biosynthetic protein FliR  26.7 
 
 
259 aa  79.7  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0980  flagellar biosynthetic protein FliR  27 
 
 
260 aa  79.7  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  0.0129952 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3915  flagellar biosynthesis protein FliR  25.51 
 
 
258 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.834588  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1751  flagellar biosynthetic protein fliR  27.27 
 
 
256 aa  79  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0184  flagellar biosynthetic protein FliR  26.69 
 
 
267 aa  79  0.00000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000300642  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>