84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1937 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1937  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  442  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.481786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00359  predicted protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  74.3 
 
 		 217 aa  318  3.9999999999999996e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00398  predicted protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  75.76 
 
 		 210 aa  295  5e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3970  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  63.29 
 
 		 209 aa  281  7.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1657  hypothetical protein  63.33 
 
 		 220 aa  278  4e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00667866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5297  hypothetical protein  63.33 
 
 		 220 aa  278  4e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2277  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  63.55 
 
 		 216 aa  271  8.000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.804824 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5321  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  62.93 
 
 		 221 aa  271  8.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1707  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  62.44 
 
 		 221 aa  268  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0544116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  62.62 
 
 		 1020 aa  267  8.999999999999999e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2713  hypothetical protein  60.85 
 
 		 222 aa  264  8.999999999999999e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00064672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1176  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  60.09 
 
 		 216 aa  263  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.16042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0074  hypothetical protein  61.06 
 
 		 253 aa  261  4.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.535249 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1466  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  59.91 
 
 		 222 aa  258  5.0000000000000005e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4887  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  62.75 
 
 		 220 aa  258  6e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.724269 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0419  hypothetical protein  57.55 
 
 		 214 aa  254  6e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1255  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  57.01 
 
 		 216 aa  254  6e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.828102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0024  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  59.81 
 
 		 219 aa  254  8e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0026  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  59.81 
 
 		 219 aa  254  8e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.158025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0025  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  59.81 
 
 		 219 aa  254  8e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785805  hitchhiker  0.000421243 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2193  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  57.08 
 
 		 215 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4540  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  58.02 
 
 		 216 aa  252  3e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5389  hypothetical protein  59.33 
 
 		 219 aa  251  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4910  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  61.32 
 
 		 224 aa  251  6e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2341  hypothetical protein  59.81 
 
 		 221 aa  251  7e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2343  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  58.02 
 
 		 215 aa  250  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0551163  normal  0.704732 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3870  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  62.98 
 
 		 214 aa  248  3e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.920883  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6006  hypothetical protein  61.43 
 
 		 222 aa  245  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4835  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  59.43 
 
 		 224 aa  244  8e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0530651  normal  0.102652 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0194  protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  54.55 
 
 		 214 aa  243  9.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4519  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  57.42 
 
 		 222 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.105752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1533  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  55.07 
 
 		 218 aa  227  9e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5711  hypothetical protein  49.76 
 
 		 253 aa  221  7e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5298  hypothetical protein  49.76 
 
 		 253 aa  221  7e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.184703 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3663  hypothetical protein  49.76 
 
 		 253 aa  221  9e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1457  hypothetical protein  49.51 
 
 		 248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1477  hypothetical protein  49.51 
 
 		 248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5364  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  39.22 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1795  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.36 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.574866 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4413  hypothetical protein  30.2 
 
 		 216 aa  85.1  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4231  hypothetical protein  27.67 
 
 		 177 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1062  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.600459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10821  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  33.01 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.198126  normal  0.195099 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4254  hypothetical protein  27.09 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.138289  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2645  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  36.44 
 
 		 149 aa  54.7  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670589  normal  0.023044 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3233  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.16 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2544  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  27.43 
 
 		 242 aa  52.4  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5509  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2107  putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase  33.78 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2810  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  38.04 
 
 		 198 aa  52.4  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.29 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0213  Putative protein-S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  31.03 
 
 		 166 aa  51.2  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.308894 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0275  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.47 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.6638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1232  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase family protein  36.36 
 
 		 158 aa  50.4  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.054338 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3939  hypothetical protein  28.28 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2788  hypothetical protein  34.57 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2737  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.25 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2688  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.73 
 
 		 227 aa  49.3  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2418  hypothetical protein  32 
 
 		 167 aa  48.1  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337114  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1980  hypothetical protein  34.94 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0006793  normal  0.0779931 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1271  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.38 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.189432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1224  hypothetical protein  29.55 
 
 		 186 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1643  lipid A phosphate methyltransferase  31.03 
 
 		 254 aa  46.6  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00799898  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1746  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0429  nickel-cobalt-cadmium resistance protein  29.9 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0956  hypothetical protein  31.33 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.788915  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0088  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.63 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1486  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.57 
 
 		 221 aa  46.2  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0410752  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1004  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.73 
 
 		 202 aa  45.4  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00191791  normal  0.0260384 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3245  hypothetical protein  24.39 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1821  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.9 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.153367  normal  0.65944 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2179  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.05 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0864264 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1767  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.19 
 
 		 284 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0820574  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2022  hypothetical protein  28.72 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.166485  normal  0.296374 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0028  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.96 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5984  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase CzcN  27.19 
 
 		 273 aa  42.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131174  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2482  hypothetical protein  31.46 
 
 		 169 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.492151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0644  CzcN domain-containing protein  28.92 
 
 		 199 aa  42.4  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.193641  normal  0.541677 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3520  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.08 
 
 		 196 aa  42.7  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.492872  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1797  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.42 
 
 		 203 aa  42.4  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0660  hypothetical protein  30.68 
 
 		 213 aa  42.4  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09601  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  33.01 
 
 		 190 aa  42  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.326284 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1589  hypothetical protein  22.73 
 
 		 182 aa  41.6  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0775913  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0469  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.55 
 
 		 206 aa  41.6  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2346  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.23 
 
 		 188 aa  41.6  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>