More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1161 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1161  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  671    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02689  methyltransferase  41.64 
 
 		 310 aa  226  4e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003801  methyltransferase  40.74 
 
 		 310 aa  223  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3872  hypothetical protein  36.51 
 
 		 308 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4306  hypothetical protein  36.99 
 
 		 318 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1561  hypothetical protein  36.88 
 
 		 318 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1143  hypothetical protein  39.35 
 
 		 321 aa  221  9e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3530  hypothetical protein  38.27 
 
 		 313 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.524505  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1214  hypothetical protein  42.34 
 
 		 309 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3633  hypothetical protein  36.91 
 
 		 321 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46250  hypothetical protein  39.87 
 
 		 313 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0321722  normal  0.0483373 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2890  hypothetical protein  40.07 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0038147  hitchhiker  0.00000713173 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3932  hypothetical protein  38.54 
 
 		 313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2527  hypothetical protein  38.46 
 
 		 320 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3577  SAM-dependent methyltransferase-like protein  37.25 
 
 		 308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.586441 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3313  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  38.64 
 
 		 314 aa  212  5.999999999999999e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2337  hypothetical protein  37.46 
 
 		 320 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.623791 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1918  hypothetical protein  39.18 
 
 		 318 aa  209  6e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1686  hypothetical protein  38.85 
 
 		 305 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000452263  normal  0.0252505 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2680  hypothetical protein  38.64 
 
 		 305 aa  208  9e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00757466  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1551  hypothetical protein  39.32 
 
 		 303 aa  207  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0147626  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2701  hypothetical protein  38.31 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000560458  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2777  hypothetical protein  38.31 
 
 		 305 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00142049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2881  SAM-dependent methyltransferases  42.86 
 
 		 305 aa  206  4e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000986982  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2919  hypothetical protein  37.63 
 
 		 303 aa  206  6e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1486  hypothetical protein  39.19 
 
 		 303 aa  206  6e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000118993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2385  hypothetical protein  39.19 
 
 		 304 aa  205  7e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000477017  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1701  hypothetical protein  41.2 
 
 		 302 aa  205  8e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000328328  normal  0.027964 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2397  hypothetical protein  38.93 
 
 		 305 aa  204  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00356323  normal  0.487755 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1545  hypothetical protein  37.97 
 
 		 303 aa  203  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013291  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1661  hypothetical protein  36.98 
 
 		 319 aa  199  6e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519453  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3357  hypothetical protein  35.97 
 
 		 319 aa  198  7.999999999999999e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416158  normal  0.98402 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2556  hypothetical protein  38.8 
 
 		 302 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1491  hypothetical protein  41.5 
 
 		 308 aa  196  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000879827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2094  hypothetical protein  36.66 
 
 		 319 aa  196  6e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120571 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1666  hypothetical protein  36.42 
 
 		 303 aa  194  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000201275  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2359  hypothetical protein  37.75 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2468  hypothetical protein  38.4 
 
 		 310 aa  190  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.219028  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4405  hypothetical protein  36 
 
 		 299 aa  183  4.0000000000000006e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.134753  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4368  PUA domain-containing protein  27.99 
 
 		 399 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4665  hypothetical protein  27.97 
 
 		 399 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4650  hypothetical protein  27.97 
 
 		 399 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4435  hypothetical protein  27.97 
 
 		 399 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4274  methyltransferase  27.97 
 
 		 399 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.314948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4780  hypothetical protein  27.97 
 
 		 399 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4666  hypothetical protein  27.97 
 
 		 399 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0587  hypothetical protein  27.97 
 
 		 399 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4653  hypothetical protein  27.97 
 
 		 399 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4285  methyltransferase  27.97 
 
 		 399 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3492  pseudouridine synthase  28.52 
 
 		 560 aa  106  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0259  SAM-dependent methyltransferase  28.62 
 
 		 389 aa  106  7e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.966549  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1462  hypothetical protein  33.51 
 
 		 318 aa  103  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.685404  normal  0.241812 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1380  hypothetical protein  33.52 
 
 		 385 aa  102  6e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0930599  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3236  PUA domain-containing protein  27.06 
 
 		 399 aa  100  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.553903  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0667  hypothetical protein  26.67 
 
 		 390 aa  96.3  6e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3930  protein of unknown function Met10  29.29 
 
 		 479 aa  91.7  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1141  hypothetical protein  31.77 
 
 		 390 aa  89.7  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.432078  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1163  hypothetical protein  31.77 
 
 		 390 aa  89.7  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.809319  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  34.44 
 
 		 367 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  34.44 
 
 		 391 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  34.44 
 
 		 367 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  27.86 
 
 		 396 aa  87.4  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  34.44 
 
 		 396 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  27.86 
 
 		 396 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  34.44 
 
 		 396 aa  87  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  27.86 
 
 		 396 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  34.44 
 
 		 396 aa  87  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  40.2 
 
 		 396 aa  86.3  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  29.44 
 
 		 392 aa  85.9  9e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  33.77 
 
 		 403 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0687  hypothetical protein  32.72 
 
 		 384 aa  85.1  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.46442  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  33.77 
 
 		 403 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  33.77 
 
 		 403 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  33.77 
 
 		 403 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  33.77 
 
 		 403 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3324  hypothetical protein  25.63 
 
 		 353 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4260  hypothetical protein  25.31 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951955 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0070  hypothetical protein  24.84 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1136  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  27.18 
 
 		 702 aa  83.2  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.237115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1019  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  27.18 
 
 		 702 aa  83.2  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000163679  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2072  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  26.06 
 
 		 713 aa  83.2  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1170  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  27.18 
 
 		 702 aa  83.2  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.988002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1123  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  27.18 
 
 		 702 aa  83.2  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.482785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1102  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  27.18 
 
 		 702 aa  83.2  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.907291  normal  0.597986 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0704  hypothetical protein  27.17 
 
 		 363 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  28.71 
 
 		 396 aa  82.4  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  28.71 
 
 		 396 aa  82.4  0.000000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  28.71 
 
 		 396 aa  82.4  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  28.07 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  27.75 
 
 		 396 aa  80.9  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0772  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.96 
 
 		 776 aa  81.3  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.829763 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2168  PUA domain-containing protein  32.58 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  27.74 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2228  hypothetical protein  26.97 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0993  SAM-dependent methyltransferase-like protein  27.75 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0222076  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  36 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0766  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.09 
 
 		 768 aa  80.5  0.00000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.1454 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3595  hypothetical protein  24.82 
 
 		 335 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.222828  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2473  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.03 
 
 		 711 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00287682 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1607  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.57 
 
 		 713 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710463  normal  0.246745 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>