33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1144 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1144  MSHA biogenesis protein MshO  100 
 
 		 282 aa  566  1e-160  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0763  hypothetical protein  32.33 
 
 		 261 aa  125  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0696342  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4102  MSHA biogenesis protein MshO  30.4 
 
 		 282 aa  110  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3475  methylation site containing protein  31.51 
 
 		 287 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00218559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0571  MSHA biogenesis protein MshO  31.39 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0476  methylation site containing protein  31.62 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0553768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3757  methylation site containing protein  31.6 
 
 		 295 aa  106  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0511874  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0555  methylation site containing protein  31.5 
 
 		 269 aa  106  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0166475  normal  0.583012 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0494  MSHA biogenesis protein MshO  30.24 
 
 		 282 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709841  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3337  MSHA biogenesis protein MshO precursor  31.07 
 
 		 278 aa  106  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.131781  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0519  MSHA biogenesis protein MshO  29.51 
 
 		 282 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3825  MSHA biogenesis protein MshO  29.27 
 
 		 282 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0143391  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0400  methylation site containing protein  32.71 
 
 		 265 aa  104  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.642203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3651  methylation site containing protein  30.14 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0515  MSHA biogenesis protein MshO  28.42 
 
 		 290 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.141751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0180  prepilin-type cleavage/methylation  29.47 
 
 		 280 aa  97.8  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3741  methylation site containing protein  31.54 
 
 		 275 aa  92.4  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.772407  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3265  type II secretory pathway pseudopilin PulG  30.34 
 
 		 287 aa  92.4  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.226057  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0464  MSHA biogenesis protein MshO precursor  28.52 
 
 		 282 aa  89.4  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.467537  normal  0.968118 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3104  hypothetical protein  29.97 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4405  methylation site containing protein  29.64 
 
 		 277 aa  87  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4566  putative MSHA biogenesis protein MshO  31.65 
 
 		 292 aa  85.1  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.842341  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0394  type II secretory pathway pseudopilin PulG  28.62 
 
 		 268 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3339  methylation  29.58 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.510017  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0886  general secretion pathway protein H  30.91 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.115142 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0757  hypothetical protein  25.94 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.538658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2830  hypothetical protein  38.39 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.496531  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00261  Tfp pilus assembly protein PilW  36.56 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03688  hypothetical protein  25.48 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0480  exported protein MshO  26.02 
 
 		 251 aa  53.1  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.772217  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0855  hypothetical protein  31.76 
 
 		 317 aa  52.8  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002380  MSHA biogenesis protein MshO  31.46 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.197407  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0366  N-terminal methylation  45.1 
 
 		 132 aa  42.4  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>