69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2288 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_2050  hypothetical protein  98.08 
 
 
365 aa  734    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2097  hypothetical protein  98.08 
 
 
365 aa  734    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2288  protein of unknown function DUF58  100 
 
 
365 aa  747    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523334  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4562  hypothetical protein  98.36 
 
 
365 aa  737    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2276  hypothetical protein  98.36 
 
 
365 aa  737    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2151  hypothetical protein  74.67 
 
 
346 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2243  hypothetical protein  72.73 
 
 
361 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760307  normal  0.435241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1855  hypothetical protein  73.04 
 
 
361 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270651  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1777  hypothetical protein  72.73 
 
 
361 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2108  hypothetical protein  66.86 
 
 
354 aa  425  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2531  hypothetical protein  50 
 
 
372 aa  347  3e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1966  hypothetical protein  56.56 
 
 
329 aa  333  4e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2624  hypothetical protein  56.51 
 
 
329 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.681677  normal  0.0502315 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2417  hypothetical protein  52.87 
 
 
338 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479744  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2349  hypothetical protein  46.5 
 
 
417 aa  318  1e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2127  hypothetical protein  54.89 
 
 
334 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1898  hypothetical protein  52.2 
 
 
342 aa  278  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2777  hypothetical protein  35.8 
 
 
337 aa  199  5e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668338  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  37.77 
 
 
318 aa  189  9e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1878  hypothetical protein  39.42 
 
 
330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2249  hypothetical protein  35.08 
 
 
327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2369  hypothetical protein  35.26 
 
 
323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  35.67 
 
 
317 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2054  hypothetical protein  34.26 
 
 
318 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.285922  normal  0.509055 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  32.08 
 
 
349 aa  156  6e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26920  hypothetical protein  33.33 
 
 
318 aa  153  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1576  hypothetical protein  29.58 
 
 
339 aa  132  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0183217  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1944  hypothetical protein  28.4 
 
 
353 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02556  hypothetical protein  29.04 
 
 
374 aa  122  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  31.66 
 
 
326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1675  hypothetical protein  28.57 
 
 
353 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1884  hypothetical protein  32.81 
 
 
323 aa  116  6e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.65449  normal  0.844493 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2075  protein of unknown function DUF58  28.06 
 
 
315 aa  108  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0220521  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3625  hypothetical protein  26.56 
 
 
316 aa  107  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3010  protein of unknown function DUF58  28.57 
 
 
333 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29026  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  29.64 
 
 
321 aa  103  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3855  protein of unknown function DUF58  28.09 
 
 
357 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3969  protein of unknown function DUF58  28.09 
 
 
357 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.068653 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1838  hypothetical protein  28.17 
 
 
317 aa  95.1  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2518  hypothetical protein  26.61 
 
 
316 aa  94.7  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451759  normal  0.113037 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3378  protein of unknown function DUF58  28.31 
 
 
323 aa  94  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1863  hypothetical protein  24.69 
 
 
316 aa  90.5  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2097  hypothetical protein  29.27 
 
 
372 aa  89  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03012  hypothetical protein  26.14 
 
 
352 aa  88.2  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1872  hypothetical protein  25.3 
 
 
316 aa  86.7  7e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5566  hypothetical protein  26.99 
 
 
346 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708703  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2385  hypothetical protein  26.59 
 
 
344 aa  85.1  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1218  hypothetical protein  27.99 
 
 
355 aa  84.3  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.892265  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1324  protein of unknown function DUF58  25.8 
 
 
344 aa  81.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12431  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02437  hypothetical protein  29.54 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2162  hypothetical protein  29.01 
 
 
339 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0151001  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2815  hypothetical protein  27.86 
 
 
341 aa  82  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.682313  normal  0.278413 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2304  protein of unknown function DUF58  28.05 
 
 
341 aa  80.5  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1117  hypothetical protein  28.44 
 
 
319 aa  80.1  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1211  hypothetical protein  28.44 
 
 
319 aa  80.1  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0820  hypothetical protein  26.67 
 
 
323 aa  80.1  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3147  hypothetical protein  27.36 
 
 
337 aa  79.3  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2530  hypothetical protein  26.75 
 
 
341 aa  77  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0727  protein of unknown function DUF58  26.3 
 
 
302 aa  75.9  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  25.09 
 
 
267 aa  72  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  27.78 
 
 
314 aa  70.5  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2913  hypothetical protein  28.08 
 
 
362 aa  67.8  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278272 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1244  hypothetical protein  24.92 
 
 
336 aa  66.2  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1320  protein of unknown function DUF58  23.83 
 
 
275 aa  60.1  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2425  hypothetical protein  24.07 
 
 
276 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337672  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2963  protein of unknown function DUF58  23.1 
 
 
275 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.023693 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  22.35 
 
 
412 aa  52.8  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  22.3 
 
 
943 aa  44.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1522  protein of unknown function DUF58  18.33 
 
 
293 aa  42.7  0.01  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>