53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2159 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_0790  alpha-glucosidase  52.38 
 
 
661 aa  668    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0155602  normal  0.344193 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0476  alpha-glucosidase, putative, adg97A  50.08 
 
 
643 aa  667    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2159  alpha-glucosidase, putative, adg97A  100 
 
 
658 aa  1370    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0591315  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3873  hypothetical protein  37.18 
 
 
647 aa  418  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437353  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1419  Glycoside hydrolase 97  36.93 
 
 
648 aa  392  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.067122  normal  0.614514 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2499  putative alpha-glucosidase  36.56 
 
 
674 aa  348  2e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2469  Glycoside hydrolase 97  30.09 
 
 
641 aa  291  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1153  putative alpha-glucosidase  30.53 
 
 
574 aa  282  1e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3876  Glycoside hydrolase 97  30.09 
 
 
571 aa  280  7e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0907495  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2708  hypothetical protein  28.34 
 
 
629 aa  219  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0314889  normal  0.739389 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1420  hypothetical protein  26.85 
 
 
649 aa  204  4e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.828826  normal  0.205294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3590  hypothetical protein  26.89 
 
 
630 aa  195  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116623  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3217  alpha-glucosidase, putative  27.57 
 
 
682 aa  194  4e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751285  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4959  hypothetical protein  25.97 
 
 
659 aa  181  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1628  putative alpha-glucosidase  30.79 
 
 
678 aa  179  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0539219  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2450  alpha-glucosidase  28.66 
 
 
699 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2329  alpha-glucosidase  27.75 
 
 
710 aa  173  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2445  alpha-glucosidase  27.61 
 
 
710 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.607095  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2017  alpha-glucosidase  27.61 
 
 
702 aa  171  5e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.248833  hitchhiker  0.00490164 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2329  alpha-glucosidase  27.6 
 
 
710 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20719  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23190  alpha-glucosidase  24.45 
 
 
701 aa  167  5.9999999999999996e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.243429  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2298  putative alpha-glucosidase  25.04 
 
 
647 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2360  putative alpha-glucosidase  26.17 
 
 
679 aa  165  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103256  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51780  alpha-glucosidase  26.13 
 
 
673 aa  165  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.816262  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5410  alpha-glucosidase, putative  25.9 
 
 
648 aa  165  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0179561  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0169  putative alpha-glucosidase  26.5 
 
 
656 aa  165  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1876  alpha-glucosidase  27.51 
 
 
703 aa  163  9e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1931  alpha-glucosidase  27.51 
 
 
703 aa  163  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2102  alpha-glucosidase  27.37 
 
 
703 aa  162  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.869354  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1892  alpha-glucosidase  25.22 
 
 
682 aa  155  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0185  alpha-glucosidase  24.78 
 
 
680 aa  154  5e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4326  hypothetical protein  24.4 
 
 
672 aa  153  8.999999999999999e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1777  alpha-glucosidase  26.22 
 
 
697 aa  151  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1876  alpha-glucosidase  26.43 
 
 
707 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.507439 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1209  hypothetical protein  24.48 
 
 
726 aa  149  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5726  Glycoside hydrolase 97  25.25 
 
 
656 aa  150  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.035847 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2740  alpha-glucosidase  25.87 
 
 
703 aa  148  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2002  alpha-glucosidase  25.95 
 
 
727 aa  147  9e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1312  putative alpha-glucosidase  24.78 
 
 
655 aa  144  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1108  alpha-glucosidase  25.75 
 
 
676 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0058  Glycoside hydrolase 97  26.57 
 
 
693 aa  139  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.52966 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0590  alpha-glucosidase  25.48 
 
 
684 aa  136  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.225417  normal  0.0221919 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4429  hypothetical protein  24.44 
 
 
707 aa  134  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.857441  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0367  putative alpha-glucosidase  23.86 
 
 
677 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1400  hypothetical protein  24.96 
 
 
704 aa  133  9e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1394  hypothetical protein  23.55 
 
 
700 aa  131  3e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.872498  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1019  alpha-glucosidase  24.57 
 
 
683 aa  124  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0626  alpha-glucosidase  23.89 
 
 
727 aa  120  6e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3805  hypothetical protein  24.61 
 
 
615 aa  119  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0777  hypothetical protein  24.84 
 
 
606 aa  117  7.999999999999999e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5767  putative alpha-glucosidase  23.47 
 
 
711 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0928  hypothetical protein  21.46 
 
 
728 aa  116  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.453447  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1460  Protein of unknown function DUF2223  23.95 
 
 
1255 aa  79.7  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>