222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3590 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3590  parB-like partition protein  100 
 
 		 361 aa  721    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3917  parB-like partition protein  40.47 
 
 		 327 aa  212  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5336  parB-like partition protein  39.62 
 
 		 343 aa  199  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.557995 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4954  parB-like partition protein  37.92 
 
 		 324 aa  199  7e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4951  hypothetical protein  41.56 
 
 		 254 aa  187  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5036  parB-like partition proteins  38.1 
 
 		 321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.704003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3503  parB-like partition protein  41.67 
 
 		 337 aa  146  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.576785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7203  parB-like partition protein  34.5 
 
 		 321 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561228 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0077  ParB family protein  27.61 
 
 		 335 aa  79  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478454  hitchhiker  0.00493853 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0072  plasmid-partitioning protein  29.65 
 
 		 323 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000633113 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0021  plasmid-partitioning protein  29.65 
 
 		 323 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.155316  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0046  plasmid-partitioning protein  29.65 
 
 		 323 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.047127  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6109  parB-like partition protein  30.28 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5907  parB-like partition protein  29.09 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.911153  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0006  plasmid-partitioning protein  30.14 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0008  plasmid-partitioning protein  25.7 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.188709 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0068  DNA-binding protein  28.04 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0036  putative repB protein  28.04 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  32.87 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  31.85 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4251  plasmid-partitioning protein  27.75 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0980763 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  35.71 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  35.71 
 
 		 296 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  32.35 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  35.48 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  31.84 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  30.46 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0287  parB-like partition proteins  32.05 
 
 		 293 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  27.5 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  31.62 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  32.84 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_41  putative plasmid partition protein B  27.95 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0344008  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  29.82 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4022  parB-like partition protein  29.82 
 
 		 338 aa  55.8  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  30.32 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  30.56 
 
 		 280 aa  55.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4176  parB-like partition protein  27.12 
 
 		 360 aa  55.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0094  ParB-like partition protein  31.21 
 
 		 293 aa  54.3  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  28.26 
 
 		 298 aa  54.3  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1743  Spo0J-like protein  25.95 
 
 		 293 aa  53.5  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000307914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  29.68 
 
 		 296 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3947  parB-like partition protein  24.48 
 
 		 382 aa  53.1  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00257685  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4692  parB-like partition proteins  29.27 
 
 		 337 aa  53.1  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0209451  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4533  parB-like partition protein  33.82 
 
 		 326 aa  52.8  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4103  parB-like partition protein  29.22 
 
 		 274 aa  52.8  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  31.69 
 
 		 268 aa  52.8  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  30.46 
 
 		 290 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  29.71 
 
 		 283 aa  52.4  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  30.46 
 
 		 290 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  29.01 
 
 		 286 aa  52.4  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  32.12 
 
 		 288 aa  52.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  28.15 
 
 		 272 aa  52.4  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  30.22 
 
 		 297 aa  52.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1319  chromosome segregation DNA-binding protein  28.81 
 
 		 375 aa  52  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  32.86 
 
 		 295 aa  51.6  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  30 
 
 		 292 aa  51.6  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4693  chromosome segregation DNA-binding protein  36.64 
 
 		 318 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  32.39 
 
 		 293 aa  51.2  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  30.56 
 
 		 284 aa  51.2  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0051  parB-like partition protein  30.56 
 
 		 311 aa  51.2  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  33.33 
 
 		 321 aa  51.2  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  32.39 
 
 		 293 aa  51.2  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  33.59 
 
 		 293 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  27.21 
 
 		 326 aa  50.4  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  29.14 
 
 		 290 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  28.97 
 
 		 329 aa  50.4  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  29.37 
 
 		 283 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0008  ParB family partitioning protein  31.58 
 
 		 294 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  29.37 
 
 		 283 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4185  Rep B partitioning protein/ParB-like protein  27.27 
 
 		 328 aa  50.4  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324966  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5406  chromosome segregation DNA-binding protein  33.08 
 
 		 330 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  29.37 
 
 		 283 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  32.58 
 
 		 306 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0135978 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  33.08 
 
 		 330 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  29.37 
 
 		 283 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  33.08 
 
 		 330 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  27.49 
 
 		 290 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  30 
 
 		 303 aa  50.1  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  29.37 
 
 		 256 aa  50.1  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5913  plasmid partitioning protein RepB  28.41 
 
 		 336 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.339623  normal  0.0259303 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1059  parB-like partition proteins  28.09 
 
 		 371 aa  50.1  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  33.09 
 
 		 286 aa  50.1  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0003  hypothetical protein  27.22 
 
 		 335 aa  49.7  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  29.73 
 
 		 293 aa  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1724  parB-like partition protein  31.47 
 
 		 317 aa  50.1  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  32.39 
 
 		 293 aa  50.1  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3750  chromosome segregation DNA-binding protein  31.16 
 
 		 305 aa  50.1  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000652126  unclonable  0.00000102935 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6163  ParB family protein  33.11 
 
 		 323 aa  49.7  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670147  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  31.82 
 
 		 335 aa  49.7  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4217  parB-like partition protein  33.79 
 
 		 472 aa  49.3  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  30.77 
 
 		 295 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  30.77 
 
 		 305 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  30.33 
 
 		 299 aa  49.3  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  29.27 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2927  parB-like partition protein  28.17 
 
 		 297 aa  49.3  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  29.27 
 
 		 305 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  30.77 
 
 		 295 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  30.77 
 
 		 295 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  30.77 
 
 		 295 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  30.77 
 
 		 295 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>