More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2284 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2284  beta-lactamase-like  100 
 
 		 550 aa  1107    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.311347  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1293  beta-lactamase-like protein  62.94 
 
 		 544 aa  681    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3001  beta-lactamase domain-containing protein  63.72 
 
 		 546 aa  696    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3211  beta-lactamase domain-containing protein  48.9 
 
 		 567 aa  489  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1371  beta-lactamase domain-containing protein  47.55 
 
 		 556 aa  489  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0514771 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1571  metallo-beta-lactamase  46.85 
 
 		 560 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212236  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2816  beta-lactamase domain-containing protein  46.01 
 
 		 564 aa  461  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4141  beta-lactamase domain protein  45.5 
 
 		 556 aa  456  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2933  beta-lactamase domain protein  46.93 
 
 		 556 aa  456  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1004  beta-lactamase domain protein  44.1 
 
 		 557 aa  452  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00402664  normal  0.192677 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2589  Beta-lactamase-like protein  46.01 
 
 		 556 aa  448  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.76936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1199  beta-lactamase domain protein  43.19 
 
 		 557 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4405  beta-lactamase domain-containing protein  45.19 
 
 		 557 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465391  normal  0.32787 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0937  beta-lactamase domain-containing protein  47.15 
 
 		 548 aa  448  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3342  beta-lactamase domain protein  43.57 
 
 		 548 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1070  beta-lactamase domain-containing protein  43.19 
 
 		 557 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131651  normal  0.340413 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1872  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  44.34 
 
 		 557 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.60462  normal  0.167955 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2205  beta-lactamase-like  45.74 
 
 		 557 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4546  metallo-beta-lactamase family hydrolase  44.72 
 
 		 556 aa  441  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.030557  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2044  beta-lactamase domain-containing protein  44.6 
 
 		 557 aa  436  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0914949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2870  beta-lactamase-like  45.29 
 
 		 556 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.820732  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3283  beta-lactamase domain protein  44.32 
 
 		 556 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.820283  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0157  Beta-lactamase-like  40.51 
 
 		 544 aa  429  1e-119  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0259079  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2383  beta-lactamase domain-containing protein  44.3 
 
 		 556 aa  427  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0966  metallo-beta-lactamase family protein  39.96 
 
 		 540 aa  426  1e-118  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0817  metallo-beta-lactamase family protein  41.44 
 
 		 558 aa  425  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.160047  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0812  metallo-beta-lactamase family protein  41.44 
 
 		 558 aa  425  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0905  beta-lactamase domain-containing protein  41.37 
 
 		 555 aa  423  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2408  beta-lactamase domain-containing protein  41.26 
 
 		 558 aa  424  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2419  beta-lactamase-like  44.86 
 
 		 556 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.183431  normal  0.0102773 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1731  metal dependent hydrolase  40.83 
 
 		 555 aa  412  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0816025  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0793  putative RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.84 
 
 		 558 aa  411  1e-113  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.279593  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4618  beta-lactamase domain-containing protein  43.26 
 
 		 556 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0286043 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1368  beta-lactamase domain protein  41.47 
 
 		 556 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1037  beta-lactamase-like  43.4 
 
 		 555 aa  394  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34364  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0039  metallo-beta-lactamase family protein  36.98 
 
 		 544 aa  390  1e-107  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0829  metallo-beta-lactamase family protein  40.11 
 
 		 542 aa  388  1e-106  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0228245  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1276  beta-lactamase domain protein  41.47 
 
 		 556 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647783  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2305  metallo-beta-lactamase family protein  47.26 
 
 		 461 aa  376  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1199  beta-lactamase-like  38.38 
 
 		 558 aa  367  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.640626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2228  beta-lactamase domain-containing protein  38.2 
 
 		 558 aa  358  9.999999999999999e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.96004  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0897  beta-lactamase domain-containing protein  42.63 
 
 		 447 aa  357  1.9999999999999998e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.528069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0763  beta-lactamase-like  37.94 
 
 		 555 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.614365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1332  beta-lactamase domain protein  38.59 
 
 		 556 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288718  normal  0.0195233 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1988  beta-lactamase domain-containing protein  38.86 
 
 		 557 aa  355  2e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.91694 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  36.61 
 
 		 558 aa  351  2e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  36.61 
 
 		 558 aa  350  4e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1194  beta-lactamase domain-containing protein  38.93 
 
 		 557 aa  345  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.496445  normal  0.175299 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2534  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  38.93 
 
 		 557 aa  345  2e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.316819  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  35.15 
 
 		 558 aa  334  3e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  35.77 
 
 		 593 aa  333  4e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  35.52 
 
 		 558 aa  332  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  36.1 
 
 		 555 aa  330  5.0000000000000004e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0383  beta-lactamase domain-containing protein  35.62 
 
 		 569 aa  330  6e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  36.87 
 
 		 533 aa  325  1e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  35.38 
 
 		 555 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01020  metallo-beta-lactamase family protein  40.99 
 
 		 440 aa  320  5e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20709  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2074  beta-lactamase-like protein  41.15 
 
 		 560 aa  319  1e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000552882  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  33.69 
 
 		 555 aa  318  2e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  33.69 
 
 		 555 aa  317  4e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  35.33 
 
 		 560 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1616  beta-lactamase domain-containing protein  36.72 
 
 		 559 aa  313  4.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0224319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  32.43 
 
 		 554 aa  313  6.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0645  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  35.58 
 
 		 564 aa  311  1e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000101529  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  36.36 
 
 		 554 aa  312  1e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  37.18 
 
 		 558 aa  311  2e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000465654  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  34.36 
 
 		 561 aa  311  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2375  beta-lactamase domain protein  34.81 
 
 		 550 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.796055  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1747  metallo-beta-lactamase family protein  30.9 
 
 		 677 aa  309  9e-83  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0102  beta-lactamase domain protein  39.07 
 
 		 546 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0095  Beta-lactamase-like protein  38.5 
 
 		 550 aa  307  3e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.560108  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0113  beta-lactamase domain protein  39.26 
 
 		 546 aa  306  7e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  33.09 
 
 		 553 aa  304  3.0000000000000004e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1879  metallo-beta-lactamase family protein  31.26 
 
 		 662 aa  303  4.0000000000000003e-81  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7858  beta-lactamase domain protein  36.23 
 
 		 561 aa  303  5.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.627673 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  34.94 
 
 		 618 aa  303  6.000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0004  metallo-beta-lactamase family protein  31.26 
 
 		 662 aa  303  7.000000000000001e-81  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000419484  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  33.99 
 
 		 554 aa  303  7.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1811  metallo-beta-lactamase family protein  30.9 
 
 		 645 aa  303  8.000000000000001e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0018  metallo-beta-lactamase family protein  32.12 
 
 		 652 aa  302  1e-80  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2084  metallo-beta-lactamase family protein  30.9 
 
 		 662 aa  301  1e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000702612  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07160  beta-lactamase domain protein  35.5 
 
 		 561 aa  301  2e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0422873  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1115  hypothetical protein  30.61 
 
 		 573 aa  301  2e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1816  beta-lactamase domain-containing protein  35.57 
 
 		 559 aa  300  4e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137497  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  32.67 
 
 		 555 aa  300  5e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000100194  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2926  beta-lactamase domain protein  34.55 
 
 		 553 aa  299  7e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440144 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2585  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 549 aa  299  7e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0424665  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0627  beta-lactamase domain protein  34.92 
 
 		 555 aa  299  8e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.223093  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1887  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  30.47 
 
 		 717 aa  299  9e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.441469  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2089  hypothetical protein  31.65 
 
 		 647 aa  298  1e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0478  beta-lactamase domain protein  34.3 
 
 		 572 aa  296  7e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0647  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  34.58 
 
 		 561 aa  296  7e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2169  hypothetical protein  36.53 
 
 		 561 aa  295  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2150  beta-lactamase-like protein  34.18 
 
 		 563 aa  295  2e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.313623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1460  beta-lactamase domain protein  34.18 
 
 		 551 aa  294  2e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000017363  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_380  metallo-beta-lactamase  35.4 
 
 		 551 aa  294  3e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0438  metallo-beta-lactamase family protein  35.4 
 
 		 551 aa  294  3e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.386369  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  32 
 
 		 566 aa  294  3e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  33.52 
 
 		 553 aa  294  3e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0415  beta-lactamase domain-containing protein  35.6 
 
 		 551 aa  293  4e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>