More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1885 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1885  fructokinase  100 
 
 		 301 aa  605  9.999999999999999e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00853813  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0234  ROK family protein  43.34 
 
 		 293 aa  244  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3301  ROK family protein  43.93 
 
 		 290 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3152  ROK family protein  45.42 
 
 		 291 aa  230  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3416  ROK family protein  47.02 
 
 		 299 aa  225  8e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0682932 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1578  ROK family protein  41.55 
 
 		 292 aa  223  4e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0111  ROK family protein  46.05 
 
 		 299 aa  215  8e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.891557  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1709  fructokinase  39.39 
 
 		 297 aa  206  5e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00007225  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0164  ROK family protein  41.28 
 
 		 301 aa  205  9e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / fructokinase  40.2 
 
 		 288 aa  204  2e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2639  fructokinase  44.07 
 
 		 296 aa  202  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.293281 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1689  fructokinase  38.93 
 
 		 293 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1584  fructokinase  39.86 
 
 		 291 aa  188  8e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0154  ROK family protein  35.59 
 
 		 287 aa  186  5e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0014  transcriptional regulator and fructokinase  36.42 
 
 		 294 aa  186  5e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000579085 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1151  ROK family protein  43.14 
 
 		 299 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.602337 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3962  fructokinase  38.31 
 
 		 296 aa  172  5e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.177192 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1708  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / fructokinase  37.92 
 
 		 291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5275  ROK family protein  40.14 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244347 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0965  ROK family protein  40.67 
 
 		 301 aa  159  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.556138 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32817  predicted protein  32.44 
 
 		 347 aa  119  7e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  28.26 
 
 		 315 aa  89.4  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  32.69 
 
 		 318 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48173  predicted protein  28.85 
 
 		 764 aa  88.2  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.738632  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  29 
 
 		 315 aa  87  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  29 
 
 		 315 aa  87  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  31.25 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  28.7 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0497  ROK family protein  29.8 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0229973  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  27.13 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0065  ROK family protein  30.72 
 
 		 373 aa  80.1  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.600972  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0150  ROK family protein  28.66 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.403108 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  30.97 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  28.17 
 
 		 322 aa  78.6  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  25.45 
 
 		 335 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  27.96 
 
 		 352 aa  76.3  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  30.97 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  29.04 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1072  ROK family protein  26.87 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  32.49 
 
 		 347 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0178  ROK family protein  25.51 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.744342  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  29.1 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  28.44 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  29.04 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  29.04 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  29.04 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  29.04 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  29.04 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  29.04 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  29.04 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  29.04 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  29.04 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  28.92 
 
 		 342 aa  73.6  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0181  ROK family protein  25.17 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  27.5 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2128  ROK family protein  27.18 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  30.42 
 
 		 327 aa  72  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0928  ROK family protein  29.19 
 
 		 329 aa  72  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.400197 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  31.09 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  27.83 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1197  ROK family protein  29.56 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2663  ROK family protein  33.17 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0696  ROK family protein  27.53 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0763542  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1263  ROK family protein  31.78 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000116273  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  26.73 
 
 		 313 aa  68.9  0.00000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2082  N-acetylglucosamine kinase  29.08 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.87532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6292  ROK family protein  28.94 
 
 		 372 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.360789  normal  0.0986994 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  27.22 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  27.3 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0091  ROK family protein  27.48 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.097356  normal  0.137586 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5102  ROK family protein  27.78 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0545007 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1189  ROK family protein  28.64 
 
 		 374 aa  66.6  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  23.25 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2895  ROK family protein  31.48 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3170  ROK family protein  29.91 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1507  ROK domain-containing protein  29.02 
 
 		 393 aa  66.2  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4861  ROK family protein  25 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1251  ROK family protein  31.98 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  28.06 
 
 		 361 aa  65.9  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0378  ROK family protein  23.9 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2476  transcriptional regulator protein  30.77 
 
 		 363 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  29.5 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  33.8 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  28.26 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0661  ROK family protein  28.21 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0310  ROK family protein  28.84 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62342  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  33.05 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3238  fructokinase  30.74 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.67247  normal  0.0186988 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  26.22 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  30.12 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08320  transcriptional regulator/sugar kinase  33.49 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.416442  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  29.75 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1953  ROK family protein  30.82 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.109027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  24.53 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2278  ROK family protein  28.53 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.674671 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3214  ROK familiy protein  30.74 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00347  hypothetical protein  30.74 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  26.41 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2646  N-acetylglucosamine kinase  28.95 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3048  ROK family protein  30.18 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000252732 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>