More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1839 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1839  ribonuclease HII  100 
 
 		 196 aa  394  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.010294  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0963  ribonuclease HII  64.62 
 
 		 198 aa  234  5.0000000000000005e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.765501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4574  ribonuclease H  56.48 
 
 		 202 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  52.28 
 
 		 248 aa  169  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  53.77 
 
 		 249 aa  169  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  51.3 
 
 		 269 aa  167  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  53.16 
 
 		 210 aa  167  7e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  51.27 
 
 		 248 aa  166  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  54.92 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  54.92 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01115  ribonuclease HII  53.97 
 
 		 211 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0002331  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  52.85 
 
 		 199 aa  164  8e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1252  Ribonuclease H  52.91 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.787291  normal  0.579547 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  53.37 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  52.63 
 
 		 213 aa  162  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  53.5 
 
 		 214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  53.37 
 
 		 217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  53.72 
 
 		 202 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  52.66 
 
 		 236 aa  161  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  48.24 
 
 		 202 aa  159  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  48.24 
 
 		 202 aa  159  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  53 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  53 
 
 		 214 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  53 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  45.03 
 
 		 245 aa  159  3e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  45.6 
 
 		 198 aa  158  4e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  54.97 
 
 		 240 aa  157  7e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  51.81 
 
 		 201 aa  157  9e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  52.33 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  51.83 
 
 		 232 aa  155  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  51.05 
 
 		 229 aa  155  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  51.31 
 
 		 232 aa  155  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  51.6 
 
 		 218 aa  155  5.0000000000000005e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  50.79 
 
 		 218 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  50.5 
 
 		 214 aa  154  6e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0352  ribonuclease HII  52.08 
 
 		 234 aa  154  7e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.227489  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  52.13 
 
 		 283 aa  154  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  53.93 
 
 		 240 aa  154  8e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  50.78 
 
 		 198 aa  154  8e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  43.24 
 
 		 242 aa  153  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  50.78 
 
 		 208 aa  152  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  51.83 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3270  ribonuclease HII  54.4 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000737319  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1313  ribonuclease HII  54.4 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00162066  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1541  ribonuclease HII  54.4 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0283248  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2041  ribonuclease HII  54.4 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00230414  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2422  ribonuclease HII  54.4 
 
 		 214 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000428257  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2478  ribonuclease HII  54.4 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0544675  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2041  ribonuclease HII  54.97 
 
 		 214 aa  152  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000010241  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  50 
 
 		 199 aa  153  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0317  ribonuclease HII  51.56 
 
 		 234 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2568  ribonuclease HII  54.4 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.446358  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  48.96 
 
 		 205 aa  152  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  50.53 
 
 		 218 aa  151  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  49.47 
 
 		 203 aa  151  5e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  51.06 
 
 		 283 aa  151  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  52.11 
 
 		 209 aa  151  7e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  49.48 
 
 		 212 aa  151  7e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  51.06 
 
 		 198 aa  150  8e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  51.06 
 
 		 198 aa  150  8e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  51.06 
 
 		 198 aa  150  8e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  49.48 
 
 		 212 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  47.12 
 
 		 277 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  50.53 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  51.06 
 
 		 283 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  43.46 
 
 		 256 aa  149  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  48.96 
 
 		 199 aa  149  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  51.06 
 
 		 198 aa  149  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  51.06 
 
 		 198 aa  149  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  47.15 
 
 		 213 aa  149  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  53.65 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  50 
 
 		 207 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  53.65 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  50.53 
 
 		 207 aa  148  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  50.53 
 
 		 207 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  50.53 
 
 		 198 aa  148  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  48.95 
 
 		 217 aa  148  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  48.94 
 
 		 227 aa  147  8e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1272  ribonuclease H  46.94 
 
 		 207 aa  147  8e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2164  ribonuclease HII  56.02 
 
 		 203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.159466  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  50.79 
 
 		 198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  48.95 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  49.47 
 
 		 197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2192  RNase HII  53.48 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0628  ribonuclease H  42.29 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  50 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1756  ribonuclease HII  52.82 
 
 		 196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0173  ribonuclease HII  40.62 
 
 		 209 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  48.96 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  50 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  50 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3310  Ribonuclease H  50.53 
 
 		 207 aa  145  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1850  RNase HII  54.26 
 
 		 198 aa  145  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1910  ribonuclease HII  42.49 
 
 		 216 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  45.92 
 
 		 250 aa  145  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  45.13 
 
 		 253 aa  145  4.0000000000000006e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3847  Ribonuclease H  47.09 
 
 		 208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297829  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  47.64 
 
 		 204 aa  144  6e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  45.55 
 
 		 257 aa  144  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6108  Ribonuclease H  47.62 
 
 		 191 aa  144  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>