203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1740 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1740  competence/damage-inducible protein cinA  100 
 
 		 167 aa  327  5.0000000000000004e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386919  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7139  competence/damage-inducible protein cinA  48.72 
 
 		 160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.876288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1678  CinA-like  43.83 
 
 		 163 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3619  CinA-like  43.29 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.45601  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1897  CinA domain protein  45.22 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3350  CinA domain-containing protein  46.85 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2030  CinA domain protein  46 
 
 		 174 aa  116  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1417  CinA domain-containing protein  42.57 
 
 		 159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32786  predicted protein  32.12 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.333376  normal  0.784272 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1570  competence/damage-inducible protein CinA  34.19 
 
 		 413 aa  77  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000404385  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  39.02 
 
 		 419 aa  71.2  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  28.39 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2617  CinA domain protein  33.76 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  32 
 
 		 417 aa  68.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0797  competence/damage-inducible protein cinA  37.58 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2089  competence-damaged protein  35.09 
 
 		 419 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2396  CinA domain-containing protein  40.54 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298192 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1118  CinA domain protein  35.43 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43976  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2959  CinA domain protein  31.45 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0301  hypothetical protein  28 
 
 		 416 aa  63.9  0.0000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.241188 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  31.72 
 
 		 429 aa  63.9  0.0000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  33.76 
 
 		 418 aa  63.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.94 
 
 		 431 aa  63.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2124  CinA-like protein  38.74 
 
 		 162 aa  62  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2170  CinA domain-containing protein  38.74 
 
 		 162 aa  62  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.391062  normal  0.424185 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2111  CinA domain-containing protein  38.74 
 
 		 162 aa  62  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0706668 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  33.61 
 
 		 437 aa  62  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0125  competence/damage-inducible protein CinA  28.1 
 
 		 400 aa  62  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0114565  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25150  competence/damage-inducible protein cinA  38.84 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  32.85 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  32.28 
 
 		 415 aa  60.8  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  30.82 
 
 		 418 aa  60.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1074  competence/damage-inducible protein CinA C-terminal domain protein  29.3 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.779028  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2467  CinA domain protein  33.33 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.57 
 
 		 424 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  36.11 
 
 		 411 aa  59.7  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  35.94 
 
 		 408 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0300  competence/damage-inducible protein CinA  30.87 
 
 		 420 aa  58.5  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00640906  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_002936  DET1291  competence/damage inducible protein CinA  28.03 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0461507  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  37.84 
 
 		 414 aa  57.8  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1776  CinA domain protein  37.12 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  31.33 
 
 		 420 aa  57.4  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  35.37 
 
 		 433 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  35.16 
 
 		 408 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  25.86 
 
 		 408 aa  55.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  34.38 
 
 		 408 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  32.41 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  29.14 
 
 		 413 aa  55.1  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  30.2 
 
 		 408 aa  55.5  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  39.13 
 
 		 416 aa  55.5  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  28.19 
 
 		 423 aa  55.1  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  30 
 
 		 423 aa  55.1  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24701  molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.36 
 
 		 429 aa  54.7  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  29.81 
 
 		 416 aa  53.9  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1660  CinA domain protein  38.24 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000802014  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  32.71 
 
 		 432 aa  53.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4260  CinA domain-containing protein  37.91 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0984245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  39.29 
 
 		 432 aa  53.9  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  32.71 
 
 		 413 aa  53.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  36.49 
 
 		 420 aa  53.1  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  37.23 
 
 		 420 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  30.08 
 
 		 421 aa  53.1  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  36.36 
 
 		 427 aa  52.8  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03351  molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.59 
 
 		 430 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  28.95 
 
 		 408 aa  53.1  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1356  CinA domain-containing protein  37.39 
 
 		 177 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.482702  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0735  competence/damage-inducible protein cinA  37.5 
 
 		 414 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000607251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1923  CinA-like  29.79 
 
 		 167 aa  52.4  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.150163  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1157  competence/damage-inducible protein CinA  32.21 
 
 		 443 aa  52  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.059415 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0054  CinA domain protein  28.37 
 
 		 163 aa  52.4  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  24.84 
 
 		 412 aa  52  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1097  CinA domain-containing protein  36.89 
 
 		 164 aa  52  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal  0.063804 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0653  CinA domain protein  37.96 
 
 		 183 aa  51.6  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0311323  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2324  competence/damage-inducible protein cinA  33.07 
 
 		 168 aa  51.6  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700413  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  33.05 
 
 		 415 aa  51.6  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4984  competence/damage-inducible protein CinA  29.06 
 
 		 417 aa  51.6  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  32.17 
 
 		 415 aa  51.2  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5798  CinA domain protein  36.69 
 
 		 203 aa  51.2  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1398  CinA domain-containing protein  38.05 
 
 		 175 aa  51.2  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.6257 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0265  competence/damage-inducible protein CinA  28.97 
 
 		 430 aa  51.6  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0226126 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07490  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  30.28 
 
 		 436 aa  51.2  0.000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.042487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3874  CinA, C-terminal  33.59 
 
 		 166 aa  50.8  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  30.77 
 
 		 413 aa  50.8  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  30.77 
 
 		 425 aa  50.8  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0747  competence/damage-inducible protein CinA  36.15 
 
 		 400 aa  50.8  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.543966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2175  competence/damage-inducible protein cinA  37.07 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  28.85 
 
 		 416 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1366  CinA-like  34.82 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.649556  normal  0.75874 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11930  competence damage-inducible protein A  31.97 
 
 		 430 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.502036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1982  competence-damaged protein  32.14 
 
 		 431 aa  49.7  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0539323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0076  competence damage-inducible protein A  31.61 
 
 		 423 aa  49.3  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0110549  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  22.67 
 
 		 433 aa  49.7  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0221  CinA domain-containing protein  32.73 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06949  conserved hypothetical protein  53.19 
 
 		 523 aa  48.9  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1623  competence/damage-inducible protein cinA  25 
 
 		 430 aa  48.9  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1441  CinA protein  34.02 
 
 		 208 aa  48.9  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.297767  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1471  competence/damage-inducible protein CinA  29.7 
 
 		 406 aa  48.9  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.127151  normal  0.989632 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  35.29 
 
 		 413 aa  48.9  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  24.18 
 
 		 412 aa  48.1  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  29.79 
 
 		 417 aa  48.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>