258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4947 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4947  putative hydrolase  100 
 
 
283 aa  559  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1562  alpha/beta hydrolase fold protein  56.52 
 
 
281 aa  266  4e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0424412  normal  0.113898 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5099  alpha/beta hydrolase fold protein  47.52 
 
 
277 aa  229  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3267  alpha/beta hydrolase fold protein  49.64 
 
 
277 aa  226  3e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.251524  normal  0.03966 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6037  hypothetical protein  46.52 
 
 
273 aa  207  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1274  alpha/beta hydrolase fold protein  39.86 
 
 
297 aa  170  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.576034  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6963  ab hydrolase, alpha/beta hydrolase fold protein  39.56 
 
 
282 aa  169  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.931194  normal  0.108228 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1268  hypothetical protein  40 
 
 
290 aa  151  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0354701  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2980  alpha/beta hydrolase fold protein  39.1 
 
 
295 aa  151  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0317  alpha/beta hydrolase fold protein  38.98 
 
 
288 aa  149  6e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.439503  hitchhiker  0.00517721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3694  ab hydrolase, alpha/beta hydrolase fold protein  40.68 
 
 
285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.110664 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4785  alpha/beta hydrolase fold protein  36.3 
 
 
289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.213395 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0251  alpha/beta hydrolase fold protein  36.97 
 
 
287 aa  119  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.799554 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0153  hydrolase  31.47 
 
 
278 aa  118  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0155  alpha/beta fold family hydrolase  31.9 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0121  hypothetical protein  34.38 
 
 
287 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0182  hypothetical protein  32.13 
 
 
269 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0161  hypothetical protein  32.13 
 
 
269 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0204  hypothetical protein  32.49 
 
 
269 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0160  hypothetical protein  32.13 
 
 
269 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0078  ab hydrolase, alpha/beta hydrolase fold protein  32.82 
 
 
282 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0526  alpha/beta hydrolase fold protein  32.45 
 
 
280 aa  99  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.375875  normal  0.273636 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2657  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 
276 aa  90.9  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2603  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 
276 aa  90.9  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  22.86 
 
 
271 aa  63.9  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1728  alpha/beta hydrolase fold protein  31.79 
 
 
294 aa  62  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.0268844 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0777  alpha/beta hydrolase fold  34.56 
 
 
284 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.547366 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1453  alpha/beta hydrolase fold  31.13 
 
 
294 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_004310  BR2178  hydrolase, putative  31.25 
 
 
233 aa  57.4  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8266  alpha/beta hydrolase fold-1  40.52 
 
 
267 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0277486 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  31.58 
 
 
286 aa  56.6  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1790  alpha/beta hydrolase fold  35.09 
 
 
287 aa  57  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.333084  hitchhiker  0.00365614 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2090  putative hydrolase  30.36 
 
 
233 aa  56.2  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1448  alpha/beta hydrolase fold  31.13 
 
 
294 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.358742 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 
250 aa  55.8  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  31.86 
 
 
280 aa  55.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0351  alpha/beta hydrolase fold  30.16 
 
 
283 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.825015  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  32.48 
 
 
425 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 
277 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4470  alpha/beta hydrolase fold  30.19 
 
 
267 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5445  alpha/beta hydrolase fold protein  33 
 
 
341 aa  53.5  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.237342  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2631  Alpha/beta hydrolase  31.62 
 
 
347 aa  53.1  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1808  hypothetical protein  29.2 
 
 
219 aa  53.1  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1067  Male sterility-like protein  32.63 
 
 
685 aa  52.8  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1449  alpha/beta hydrolase fold  29.44 
 
 
278 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1467  alpha/beta hydrolase fold  29.44 
 
 
278 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3444  alpha/beta hydrolase fold  31.85 
 
 
346 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1534  lipolytic enzyme  32.26 
 
 
294 aa  52  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.277395  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  36.52 
 
 
392 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4362  alpha/beta hydrolase fold protein  33.97 
 
 
272 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5265  alpha/beta hydrolase fold  31.85 
 
 
346 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37530  putative hydrolase  35.59 
 
 
300 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.380275  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  34.21 
 
 
279 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4736  twin-arginine translocation pathway signal  34.95 
 
 
350 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.874763  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
264 aa  50.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5546  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
346 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0934865 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  30.17 
 
 
317 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3293  alpha/beta hydrolase fold  35.66 
 
 
323 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104393  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  31.78 
 
 
280 aa  50.8  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5385  alpha/beta hydrolase fold protein  37.04 
 
 
278 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0167566  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3572  alpha/beta hydrolase fold  36.27 
 
 
346 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126926  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  31.15 
 
 
302 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3508  alpha/beta hydrolase fold  32.54 
 
 
347 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3368  alpha/beta hydrolase fold protein  35.66 
 
 
326 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  31.69 
 
 
278 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  34.26 
 
 
265 aa  50.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  29.66 
 
 
311 aa  50.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 
302 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5458  alpha/beta hydrolase fold protein  36.13 
 
 
270 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306625  normal  0.0166355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  33.56 
 
 
259 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  34.23 
 
 
279 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4010  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 
347 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.719713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8373  proline iminopeptidase  37.63 
 
 
284 aa  50.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  30.83 
 
 
270 aa  49.7  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22060  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.33 
 
 
262 aa  49.3  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00549421  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  35.59 
 
 
286 aa  49.3  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.73231  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12478  proline iminopeptidase, putative  27.42 
 
 
306 aa  48.9  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  28.7 
 
 
291 aa  48.9  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0585  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
285 aa  48.9  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474837  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 
284 aa  48.9  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  34.19 
 
 
285 aa  48.9  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2473  alpha/beta fold family hydrolase  32.79 
 
 
277 aa  48.5  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2254  epoxide hydrolase  33.33 
 
 
347 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3177  Alpha/beta hydrolase fold-1  36.28 
 
 
272 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.97494  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  33.03 
 
 
265 aa  48.9  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0075  twin-arginine translocation pathway signal  34.69 
 
 
350 aa  48.5  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229261  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2443  hydrolase  33.61 
 
 
271 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.788675  normal  0.130051 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6836  alpha/beta hydrolase fold protein  35 
 
 
345 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230039  normal  0.229752 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5144  alpha/beta hydrolase fold  30.88 
 
 
347 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  34.38 
 
 
265 aa  47.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0171248  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1295  epoxide hydrolase  31.75 
 
 
453 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  31.69 
 
 
284 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1592  alpha/beta hydrolase fold  32.52 
 
 
267 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121533  normal  0.0764642 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  28.69 
 
 
302 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  35.4 
 
 
282 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4287  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 
269 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  34.13 
 
 
278 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2941  alpha/beta fold family hydrolase  31.75 
 
 
444 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.743767  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4231  alpha/beta hydrolase fold protein  34.31 
 
 
364 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
266 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>