More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0735 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0735  aminoacyl-tRNA hydrolase  100 
 
 
196 aa  391  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0791  aminoacyl-tRNA hydrolase  92.86 
 
 
196 aa  345  3e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0171  peptidyl-tRNA hydrolase  65.61 
 
 
198 aa  259  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  67.38 
 
 
201 aa  251  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  62.23 
 
 
213 aa  244  6.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  60.1 
 
 
209 aa  244  8e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  61.38 
 
 
197 aa  236  1e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0912  peptidyl-tRNA hydrolase  60.1 
 
 
217 aa  229  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0653  peptidyl-tRNA hydrolase  62.9 
 
 
189 aa  228  6e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  58.85 
 
 
195 aa  228  6e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1220  peptidyl-tRNA hydrolase  60.94 
 
 
194 aa  221  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  61.98 
 
 
196 aa  218  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000493335 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4550  peptidyl-tRNA hydrolase  64.55 
 
 
195 aa  217  7.999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30140  peptidyl-tRNA hydrolase  62.94 
 
 
202 aa  216  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.601869 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  61.67 
 
 
213 aa  214  5e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1944  peptidyl-tRNA hydrolase  56.61 
 
 
196 aa  211  7e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  55.67 
 
 
192 aa  210  9e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  55.67 
 
 
192 aa  210  9e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  55.67 
 
 
192 aa  210  9e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  55.15 
 
 
192 aa  207  6e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  60.94 
 
 
206 aa  205  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32390  peptidyl-tRNA hydrolase  58.6 
 
 
199 aa  202  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.438107 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  52.58 
 
 
192 aa  200  9e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0914  peptidyl-tRNA hydrolase  59.16 
 
 
195 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0822526  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11032  peptidyl-tRNA hydrolase  56.41 
 
 
191 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0990  peptidyl-tRNA hydrolase  55.1 
 
 
199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  hitchhiker  0.0022816 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05520  peptidyl-tRNA hydrolase  60.53 
 
 
191 aa  195  3e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1054  Aminoacyl-tRNA hydrolase  57.51 
 
 
198 aa  195  3e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0884  peptidyl-tRNA hydrolase  60.5 
 
 
206 aa  195  4.0000000000000005e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.202868 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2704  peptidyl-tRNA hydrolase  60.62 
 
 
202 aa  191  4e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3210  peptidyl-tRNA hydrolase  57.59 
 
 
194 aa  191  7e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3987  peptidyl-tRNA hydrolase  59.07 
 
 
221 aa  190  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1940  peptidyl-tRNA hydrolase  52.28 
 
 
205 aa  180  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13420  peptidyl-tRNA hydrolase  58.33 
 
 
204 aa  179  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1854  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  49.47 
 
 
188 aa  178  4.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03510  peptidyl-tRNA hydrolase  52.26 
 
 
202 aa  174  5e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.584729 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1538  peptidyl-tRNA hydrolase  51.34 
 
 
188 aa  172  3.9999999999999995e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0656  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.05 
 
 
199 aa  172  3.9999999999999995e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0778  peptidyl-tRNA hydrolase  43.08 
 
 
199 aa  171  7.999999999999999e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.881763  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2056  peptidyl-tRNA hydrolase  47.87 
 
 
214 aa  161  4.0000000000000004e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  47.22 
 
 
214 aa  161  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  45.95 
 
 
217 aa  159  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.97 
 
 
193 aa  157  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  38.38 
 
 
189 aa  154  7e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0595  peptidyl-tRNA hydrolase  39.15 
 
 
189 aa  152  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  41.71 
 
 
185 aa  152  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  43.24 
 
 
195 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1354  peptidyl-tRNA hydrolase  42.11 
 
 
193 aa  152  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  40.96 
 
 
184 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.94 
 
 
187 aa  150  1e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5242  peptidyl-tRNA hydrolase  46.81 
 
 
203 aa  150  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_535  peptidyl-tRNA hydrolase  38.1 
 
 
189 aa  149  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  38.73 
 
 
205 aa  149  3e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.8 
 
 
206 aa  149  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 
207 aa  149  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03980  peptidyl-tRNA hydrolase  41.71 
 
 
185 aa  148  4e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.469192 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  36.7 
 
 
193 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0570  peptidyl-tRNA hydrolase  41.27 
 
 
189 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0122304  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2121  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.86 
 
 
190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.062679 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  39.47 
 
 
207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  39.47 
 
 
207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  39.47 
 
 
207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  39.47 
 
 
186 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  39.47 
 
 
186 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.84 
 
 
213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  39.47 
 
 
186 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0126  peptidyl-tRNA hydrolase  51.91 
 
 
192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  51.91 
 
 
192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1291  peptidyl-tRNA hydrolase  42.02 
 
 
204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0137  peptidyl-tRNA hydrolase  51.91 
 
 
192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2760  peptidyl-tRNA hydrolase  44.39 
 
 
185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1086  peptidyl-tRNA hydrolase  47.93 
 
 
192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  39.47 
 
 
186 aa  145  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2631  peptidyl-tRNA hydrolase  40.11 
 
 
196 aa  145  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  37.77 
 
 
187 aa  145  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4839  peptidyl-tRNA hydrolase  48.21 
 
 
206 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881086  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1595  peptidyl-tRNA hydrolase  45.45 
 
 
192 aa  145  5e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2675  peptidyl-tRNA hydrolase  40.64 
 
 
186 aa  145  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0897  peptidyl-tRNA hydrolase  40.96 
 
 
230 aa  145  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185924  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  44.25 
 
 
186 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  39.47 
 
 
210 aa  144  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3102  peptidyl-tRNA hydrolase  45.7 
 
 
204 aa  143  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  38.17 
 
 
183 aa  144  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3500  peptidyl-tRNA hydrolase  41.38 
 
 
213 aa  143  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000021188 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  41.75 
 
 
194 aa  143  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  38.95 
 
 
207 aa  143  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2511  peptidyl-tRNA hydrolase  44.62 
 
 
202 aa  143  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  41.27 
 
 
191 aa  143  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  37.89 
 
 
186 aa  143  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1560  peptidyl-tRNA hydrolase  39.18 
 
 
201 aa  142  4e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0200988  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0675  peptidyl-tRNA hydrolase  39.69 
 
 
198 aa  142  4e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000361482  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  42.86 
 
 
186 aa  141  7e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0663  peptidyl-tRNA hydrolase  46.24 
 
 
193 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.741399  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2522  peptidyl-tRNA hydrolase  42.63 
 
 
192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0149301  normal  0.177259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2625  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 
188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.15421 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2606  peptidyl-tRNA hydrolase  40.96 
 
 
202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.642317 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1165  peptidyl-tRNA hydrolase  37.43 
 
 
186 aa  139  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1416  peptidyl-tRNA hydrolase  46.34 
 
 
201 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.827174  normal  0.882647 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2870  peptidyl-tRNA hydrolase  37.44 
 
 
219 aa  139  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4160  peptidyl-tRNA hydrolase  47.02 
 
 
207 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.199794 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>