More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3433 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3433  sensor protein CpxA  100 
 
 		 453 aa  919    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0911326  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  59.33 
 
 		 458 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.11 
 
 		 458 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.25 
 
 		 454 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.33 
 
 		 458 aa  561  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00578995  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0251  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  59.6 
 
 		 449 aa  560  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00216243  hitchhiker  0.000495811 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3770  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  59.38 
 
 		 449 aa  560  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00735278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0252  ATPase domain-containing protein  59.6 
 
 		 449 aa  558  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00902295  hitchhiker  0.0000000026524 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4478  sensor protein CpxA  60.49 
 
 		 449 aa  532  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3934  histidine kinase  54.7 
 
 		 458 aa  528  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000220344  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.15 
 
 		 449 aa  524  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00215301  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.46 
 
 		 459 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000534801  unclonable  0.0000000336351 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.57 
 
 		 455 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000416507  hitchhiker  0.00000000404182 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  58.21 
 
 		 466 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.445983  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3571  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.92 
 
 		 455 aa  495  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3462  ATP-binding region, ATPase-like protein  55.13 
 
 		 471 aa  474  1e-132  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.015081  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00150  two-component sensor protein  38.13 
 
 		 468 aa  265  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0988  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.58 
 
 		 467 aa  258  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00659588  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002218  copper sensory histidine kinase CpxA  37.06 
 
 		 464 aa  258  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00500804  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2798  two-component sensor protein  32.68 
 
 		 462 aa  239  5.999999999999999e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1676  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0127  two-component sensor protein  40.97 
 
 		 456 aa  236  6e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.581229  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1392  sensor histidine kinase  33.41 
 
 		 455 aa  236  7e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1563  two-component sensor protein  33.63 
 
 		 462 aa  235  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0211218  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1604  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 455 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0135  two-component sensor protein  40.97 
 
 		 456 aa  234  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4389  two-component sensor protein  38.68 
 
 		 457 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4304  two-component sensor protein  38.68 
 
 		 457 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4345  two-component sensor protein  38.68 
 
 		 457 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000360495 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4275  two-component sensor protein  38.68 
 
 		 457 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4456  two-component sensor protein  38.68 
 
 		 457 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.874205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4811  two-component sensor protein  36.68 
 
 		 457 aa  231  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201451 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2265  two-component sensor protein  35.53 
 
 		 464 aa  229  6e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000076955  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03797  two-component sensor protein  38.11 
 
 		 457 aa  227  3e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.197394  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03746  hypothetical protein  38.11 
 
 		 457 aa  227  3e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.228988  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4304  two-component sensor protein  37.89 
 
 		 457 aa  225  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335985  hitchhiker  0.00831139 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4073  histidine kinase  37.89 
 
 		 457 aa  225  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4142  two-component sensor protein  37.89 
 
 		 457 aa  225  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4445  two-component sensor protein  37.89 
 
 		 457 aa  225  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4106  two-component sensor protein  37.89 
 
 		 457 aa  225  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5366  two-component sensor protein  37.89 
 
 		 457 aa  225  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.135229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4391  two-component sensor protein  37.89 
 
 		 457 aa  224  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0083  two-component sensor protein  36.26 
 
 		 458 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3851  two-component sensor protein  40.16 
 
 		 456 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.257653  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0080  two-component sensor protein  36.26 
 
 		 458 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00536  putative sensor histidine kinase protein  34.43 
 
 		 453 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4133  two-component sensor protein  36.26 
 
 		 458 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000603711  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4034  two-component sensor protein  39.68 
 
 		 456 aa  219  8.999999999999998e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2278  sensor histidine kinase  34.57 
 
 		 465 aa  218  1e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.33 
 
 		 389 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4061  two-component sensor protein  37.53 
 
 		 457 aa  216  8e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000114618  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  32.97 
 
 		 472 aa  213  4.9999999999999996e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  42.32 
 
 		 459 aa  212  9e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000458656  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  36.65 
 
 		 452 aa  204  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3274  histidine kinase  36.07 
 
 		 465 aa  199  7.999999999999999e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000371883  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.01 
 
 		 445 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3194  histidine kinase  40.28 
 
 		 480 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3186  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 469 aa  196  5.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0705  sensor histidine kinase  38.92 
 
 		 381 aa  194  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31140  sensory histidine protein kinase  41.64 
 
 		 412 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0370261  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.93 
 
 		 442 aa  190  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000191939 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1314  sensor histidine kinase CpxA  37.42 
 
 		 449 aa  189  7e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.20791e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1425  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.42 
 
 		 449 aa  189  8e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554351  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  37.09 
 
 		 449 aa  188  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 		 439 aa  187  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0772  histidine kinase  37.88 
 
 		 456 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000128087  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3792  sensor histidine kinase  32.31 
 
 		 416 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00122531 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6516  histidine kinase  38.91 
 
 		 429 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0252048 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2596  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 		 457 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1009  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 		 455 aa  181  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1866  putative two-component system sensor kinase  33.11 
 
 		 468 aa  179  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.62 
 
 		 429 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 		 435 aa  177  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000009971 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2573  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 421 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236887 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3919  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 		 448 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 		 454 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2387  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 420 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235334  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 		 419 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335551  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2007  putative two-component system sensor kinase  36.52 
 
 		 471 aa  170  5e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0750477  hitchhiker  0.00355536 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06762  histidine kinase  35.6 
 
 		 457 aa  168  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0795  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 		 444 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05292  histidine kinase  32.17 
 
 		 428 aa  164  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00937  sensor histidine kinase  27.89 
 
 		 458 aa  164  4.0000000000000004e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000560614  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1803  sensor histidine kinase  33.96 
 
 		 450 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43373  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 		 449 aa  161  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00670789  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4561  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 440 aa  160  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102367  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000850  probable two-component system sensor kinase  34.47 
 
 		 457 aa  160  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0135797  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2891  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.98 
 
 		 433 aa  159  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.392127  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4493  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 		 458 aa  159  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0870  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 469 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1333  histidine kinase  34.94 
 
 		 461 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249082  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 461 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  37.37 
 
 		 463 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 456 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 446 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0126885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 446 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000501512  normal  0.872654 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1235  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 456 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.403806  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1481  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 446 aa  156  9e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0335199  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3591  sensor histidine kinase  33.96 
 
 		 449 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148051  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4011  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 		 446 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.704889  hitchhiker  0.0000182562 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3412  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 		 471 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>